Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FANCLQ9NW38 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FANCLQ9NW38 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FANCLQ9NW38 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCLQ9NW38 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
FANCLQ9NW38 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FANCLQ9NW38 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCLQ9NW38 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCLQ9NW38 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCLQ9NW38 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCLQ9NW38 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCLQ9NW38 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCLQ9NW38 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCLQ9NW38 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms