RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378270.5

EBPL-203, Transcript of EBP like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EBPL, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-203ENST00000378270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.72■■■■■ 8.59
EBPL-203ENST00000378270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.14■■■■■ 7.38
EBPL-203ENST00000378270 ABCC9O60706 1549 aa59.56■■■■■ 7.13
EBPL-203ENST00000378270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.48■■■■■ 6.79
EBPL-203ENST00000378270 NACADO15069 1562 aa57.47■■■■■ 6.79
EBPL-203ENST00000378270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.27■■■■■ 6.76
EBPL-203ENST00000378270 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.25■■■■■ 6.75
EBPL-203ENST00000378270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.17■■■■■ 6.74
EBPL-203ENST00000378270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.99■■■■■ 6.71
EBPL-203ENST00000378270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.07■■■■■ 6.57
EBPL-203ENST00000378270 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.68■■■■■ 6.5
EBPL-203ENST00000378270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.62■■■■■ 6.49
EBPL-203ENST00000378270 SCRIBQ14160 1630 aa55.61■■■■■ 6.49
EBPL-203ENST00000378270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.31■■■■■ 6.45
EBPL-203ENST00000378270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.58■■■■■ 6.33
EBPL-203ENST00000378270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.21■■■■■ 6.27
EBPL-203ENST00000378270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.95■■■■■ 6.23
EBPL-203ENST00000378270 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.58■■■■■ 6.17
EBPL-203ENST00000378270 SMARCA4P51532 1647 aa53.29■■■■■ 6.12
EBPL-203ENST00000378270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.28■■■■■ 6.12
EBPL-203ENST00000378270 NCAPD3P42695 1498 aa53.02■■■■■ 6.08
EBPL-203ENST00000378270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53■■■■■ 6.07
EBPL-203ENST00000378270 SMARCA2P51531 1590 aa52.99■■■■■ 6.07
EBPL-203ENST00000378270 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.89■■■■■ 6.06
EBPL-203ENST00000378270 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.86■■■■■ 6.05
EBPL-203ENST00000378270 HMGXB3Q12766 1538 aa52.77■■■■■ 6.04
EBPL-203ENST00000378270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.55■■■■■ 6
EBPL-203ENST00000378270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.35■■■■■ 5.97
EBPL-203ENST00000378270 WIZO95785 1651 aa52.29■■■■■ 5.96
EBPL-203ENST00000378270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.84■■■■■ 5.89
EBPL-203ENST00000378270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.6■■■■■ 5.85
EBPL-203ENST00000378270 NESP48681 1621 aa51.55■■■■■ 5.84
EBPL-203ENST00000378270 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.45■■■■■ 5.83
EBPL-203ENST00000378270 ERCC6Q03468 1493 aa51.39■■■■■ 5.82
EBPL-203ENST00000378270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.25■■■■■ 5.79
EBPL-203ENST00000378270 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.18■■■■■ 5.78
EBPL-203ENST00000378270 CFTRP13569 1480 aa51.16■■■■■ 5.78
EBPL-203ENST00000378270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.98■■■■■ 5.75
EBPL-203ENST00000378270 CUX2O14529 1486 aa50.94■■■■■ 5.75
EBPL-203ENST00000378270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.9■■■■■ 5.74
EBPL-203ENST00000378270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.85■■■■■ 5.73
EBPL-203ENST00000378270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.8■■■■■ 5.72
EBPL-203ENST00000378270 PRDM2Q13029 1718 aa50.77■■■■■ 5.72
EBPL-203ENST00000378270 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.76■■■■■ 5.72
EBPL-203ENST00000378270 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.68■■■■■ 5.7
EBPL-203ENST00000378270 WDR62O43379 1518 aa50.53■■■■■ 5.68
EBPL-203ENST00000378270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
EBPL-203ENST00000378270 ABCC8Q09428 1581 aa50.13■■■■■ 5.61
EBPL-203ENST00000378270 TOPBP1Q92547 1522 aa50.01■■■■■ 5.6
EBPL-203ENST00000378270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.98■■■■■ 5.59
EBPL-203ENST00000378270 IFT140Q96RY7 1462 aa49.72■■■■■ 5.55
EBPL-203ENST00000378270 CUX1P39880 1505 aa49.63■■■■■ 5.54
EBPL-203ENST00000378270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.58■■■■■ 5.53
EBPL-203ENST00000378270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
EBPL-203ENST00000378270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.44■■■■■ 5.51
EBPL-203ENST00000378270 SOGA1O94964 1423 aa49.38■■■■■ 5.5
EBPL-203ENST00000378270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.38■■■■■ 5.5
EBPL-203ENST00000378270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
EBPL-203ENST00000378270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.29■■■■■ 5.48
EBPL-203ENST00000378270 TOP2BQ02880 1626 aa49.27■■■■■ 5.48
EBPL-203ENST00000378270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.27■■■■■ 5.48
EBPL-203ENST00000378270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.24■■■■■ 5.47
EBPL-203ENST00000378270 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.23■■■■■ 5.47
EBPL-203ENST00000378270 WDR97A6NE52 1622 aa49.23■■■■■ 5.47
EBPL-203ENST00000378270 SYNJ1O43426 1573 aa49.18■■■■■ 5.46
EBPL-203ENST00000378270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.12■■■■■ 5.45
EBPL-203ENST00000378270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.05■■■■■ 5.44
EBPL-203ENST00000378270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
EBPL-203ENST00000378270 GRIN2BQ13224 1484 aa48.84■■■■■ 5.41
EBPL-203ENST00000378270 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.83■■■■■ 5.41
EBPL-203ENST00000378270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.82■■■■■ 5.41
EBPL-203ENST00000378270 OSCARQ8IYS5 282 aa48.78■■■■■ 5.4
EBPL-203ENST00000378270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.74■■■■■ 5.39
EBPL-203ENST00000378270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.69■■■■■ 5.39
EBPL-203ENST00000378270 PBRM1Q86U86 1689 aa48.68■■■■■ 5.38
EBPL-203ENST00000378270 CHD1O14646 1710 aa48.57■■■■■ 5.37
EBPL-203ENST00000378270 SYNJ2O15056 1496 aa48.51■■■■■ 5.36
EBPL-203ENST00000378270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.49■■■■■ 5.35
EBPL-203ENST00000378270 FBLN2P98095 1184 aa48.46■■■■■ 5.35
EBPL-203ENST00000378270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.43■■■■■ 5.34
EBPL-203ENST00000378270 KIF27Q86VH2 1401 aa48.36■■■■■ 5.33
EBPL-203ENST00000378270 ADAMTS12P58397 1594 aa48.34■■■■■ 5.33
EBPL-203ENST00000378270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.3■■■■■ 5.32
EBPL-203ENST00000378270 GRIN2AQ12879 1464 aa48.19■■■■■ 5.31
EBPL-203ENST00000378270 TRIM41Q8WV44 630 aa48.18■■■■■ 5.3
EBPL-203ENST00000378270 IGF1RP08069 1367 aa48.13■■■■■ 5.29
EBPL-203ENST00000378270 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.12■■■■■ 5.29
EBPL-203ENST00000378270 CUL7Q14999 1698 aa48.04■■■■■ 5.28
EBPL-203ENST00000378270 NUP160Q12769 1436 aa48■■■■■ 5.27
EBPL-203ENST00000378270 ARHGEF11O15085 1522 aa47.97■■■■■ 5.27
EBPL-203ENST00000378270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.94■■■■■ 5.26
EBPL-203ENST00000378270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.94■■■■■ 5.26
EBPL-203ENST00000378270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.94■■■■■ 5.26
EBPL-203ENST00000378270 CEP170Q5SW79 1584 aa47.9■■■■■ 5.26
EBPL-203ENST00000378270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.84■■■■■ 5.25
EBPL-203ENST00000378270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.78■■■■■ 5.24
EBPL-203ENST00000378270 SHROOM2Q13796 1616 aa47.63■■■■■ 5.22
EBPL-203ENST00000378270 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.62■■■■■ 5.21
EBPL-203ENST00000378270 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.59■■■■■ 5.21
EBPL-203ENST00000378270 ARAP1Q96P48 1450 aa47.57■■■■■ 5.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms