RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.43■■■■■ 8.06
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SLC22A23-201ENST00000380298 ABCC9O60706 1549 aa55.82■■■■■ 6.53
SLC22A23-201ENST00000380298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.66■■■■■ 6.34
SLC22A23-201ENST00000380298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.36■■■■■ 6.29
SLC22A23-201ENST00000380298 NACADO15069 1562 aa54.22■■■■■ 6.27
SLC22A23-201ENST00000380298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.21■■■■■ 6.27
SLC22A23-201ENST00000380298 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.18■■■■■ 6.26
SLC22A23-201ENST00000380298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.07■■■■■ 6.25
SLC22A23-201ENST00000380298 SCRIBQ14160 1630 aa52.77■■■■■ 6.04
SLC22A23-201ENST00000380298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.76■■■■■ 6.04
SLC22A23-201ENST00000380298 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.37■■■■■ 5.97
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SLC22A23-201ENST00000380298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.08■■■■■ 5.93
SLC22A23-201ENST00000380298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.95■■■■■ 5.75
SLC22A23-201ENST00000380298 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.85■■■■■ 5.73
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SLC22A23-201ENST00000380298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.53■■■■■ 5.68
SLC22A23-201ENST00000380298 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.41■■■■■ 5.66
SLC22A23-201ENST00000380298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.14■■■■■ 5.62
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SLC22A23-201ENST00000380298 SMARCA2P51531 1590 aa50.14■■■■■ 5.62
SLC22A23-201ENST00000380298 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.11■■■■■ 5.61
SLC22A23-201ENST00000380298 NCAPD3P42695 1498 aa50.03■■■■■ 5.6
SLC22A23-201ENST00000380298 WIZO95785 1651 aa49.88■■■■■ 5.57
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SLC22A23-201ENST00000380298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
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SLC22A23-201ENST00000380298 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.62■■■■■ 5.37
SLC22A23-201ENST00000380298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.57■■■■■ 5.37
SLC22A23-201ENST00000380298 NESP48681 1621 aa48.51■■■■■ 5.36
SLC22A23-201ENST00000380298 CFTRP13569 1480 aa48.48■■■■■ 5.35
SLC22A23-201ENST00000380298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.25■■■■■ 5.32
SLC22A23-201ENST00000380298 PRDM2Q13029 1718 aa48.1■■■■■ 5.29
SLC22A23-201ENST00000380298 ERCC6Q03468 1493 aa48.09■■■■■ 5.29
SLC22A23-201ENST00000380298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.02■■■■■ 5.28
SLC22A23-201ENST00000380298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.94■■■■■ 5.27
SLC22A23-201ENST00000380298 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.89■■■■■ 5.26
SLC22A23-201ENST00000380298 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.67■■■■■ 5.22
SLC22A23-201ENST00000380298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
SLC22A23-201ENST00000380298 WDR62O43379 1518 aa47.47■■■■■ 5.19
SLC22A23-201ENST00000380298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCC8Q09428 1581 aa47.45■■■■■ 5.19
SLC22A23-201ENST00000380298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.35■■■■■ 5.17
SLC22A23-201ENST00000380298 TOPBP1Q92547 1522 aa47.34■■■■■ 5.17
SLC22A23-201ENST00000380298 CUX2O14529 1486 aa47.32■■■■■ 5.17
SLC22A23-201ENST00000380298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.27■■■■■ 5.16
SLC22A23-201ENST00000380298 CUX1P39880 1505 aa47.24■■■■■ 5.15
SLC22A23-201ENST00000380298 TOP2BQ02880 1626 aa47.06■■■■■ 5.12
SLC22A23-201ENST00000380298 SYNJ1O43426 1573 aa47.05■■■■■ 5.12
SLC22A23-201ENST00000380298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.03■■■■■ 5.12
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SLC22A23-201ENST00000380298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.97■■■■■ 5.11
SLC22A23-201ENST00000380298 IFT140Q96RY7 1462 aa46.88■■■■■ 5.09
SLC22A23-201ENST00000380298 SOGA1O94964 1423 aa46.83■■■■■ 5.09
SLC22A23-201ENST00000380298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.75■■■■■ 5.07
SLC22A23-201ENST00000380298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
SLC22A23-201ENST00000380298 TRIM41Q8WV44 630 aa46.7■■■■■ 5.07
SLC22A23-201ENST00000380298 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.61■■■■■ 5.05
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.59■■■■■ 5.05
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
SLC22A23-201ENST00000380298 WDR97A6NE52 1622 aa46.51■■■■■ 5.04
SLC22A23-201ENST00000380298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
SLC22A23-201ENST00000380298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.41■■■■■ 5.02
SLC22A23-201ENST00000380298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
SLC22A23-201ENST00000380298 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.3■■■■■ 5
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.29■■■■■ 5
SLC22A23-201ENST00000380298 KIF27Q86VH2 1401 aa46.25■■■■■ 4.99
SLC22A23-201ENST00000380298 GRIN2BQ13224 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
SLC22A23-201ENST00000380298 PBRM1Q86U86 1689 aa46.08■■■■■ 4.97
SLC22A23-201ENST00000380298 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.05■■■■■ 4.96
SLC22A23-201ENST00000380298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
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SLC22A23-201ENST00000380298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.98■■■■■ 4.95
SLC22A23-201ENST00000380298 IGF1RP08069 1367 aa45.95■■■■■ 4.95
SLC22A23-201ENST00000380298 EEA1Q15075 1411 aa45.89■■■■■ 4.94
SLC22A23-201ENST00000380298 SYNJ2O15056 1496 aa45.81■■■■■ 4.92
SLC22A23-201ENST00000380298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.81■■■■■ 4.92
SLC22A23-201ENST00000380298 ADAMTS12P58397 1594 aa45.79■■■■■ 4.92
SLC22A23-201ENST00000380298 CUL7Q14999 1698 aa45.76■■■■■ 4.92
SLC22A23-201ENST00000380298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.92
SLC22A23-201ENST00000380298 FBLN2P98095 1184 aa45.72■■■■■ 4.91
SLC22A23-201ENST00000380298 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.71■■■■■ 4.91
SLC22A23-201ENST00000380298 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.7■■■■■ 4.91
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
SLC22A23-201ENST00000380298 CHD1O14646 1710 aa45.64■■■■■ 4.9
SLC22A23-201ENST00000380298 GRIN2AQ12879 1464 aa45.58■■■■■ 4.89
SLC22A23-201ENST00000380298 OSCARQ8IYS5 282 aa45.54■■■■■ 4.88
SLC22A23-201ENST00000380298 PRXQ9BXM0 1461 aa45.53■■■■■ 4.88
SLC22A23-201ENST00000380298 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.5■■■■■ 4.87
SLC22A23-201ENST00000380298 NUP160Q12769 1436 aa45.36■■■■■ 4.85
SLC22A23-201ENST00000380298 CEP170Q5SW79 1584 aa45.29■■■■■ 4.84
SLC22A23-201ENST00000380298 KIF21BO75037 1637 aa45.29■■■■■ 4.84
SLC22A23-201ENST00000380298 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.2■■■■■ 4.83
SLC22A23-201ENST00000380298 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.14■■■■■ 4.82
SLC22A23-201ENST00000380298 GOLGA3Q08378 1498 aa45.11■■■■■ 4.81
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