RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427482.6

SH3GL3-202, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL3, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3-202ENST00000427482 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.75■■■■■ 7.16
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SH3GL3-202ENST00000427482 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.12■■■■■ 5.45
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SH3GL3-202ENST00000427482 ABCC9O60706 1549 aa48.83■■■■■ 5.41
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SH3GL3-202ENST00000427482 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.83■■■■■ 5.25
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SH3GL3-202ENST00000427482 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.32■■■■■ 4.85
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SH3GL3-202ENST00000427482 SMARCA2P51531 1590 aa45.01■■■■■ 4.8
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SH3GL3-202ENST00000427482 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.25■■■■■ 4.67
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SH3GL3-202ENST00000427482 PRDM2Q13029 1718 aa43.63■■■■■ 4.58
SH3GL3-202ENST00000427482 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.62■■■■■ 4.57
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SH3GL3-202ENST00000427482 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
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SH3GL3-202ENST00000427482 TOP2BQ02880 1626 aa43.38■■■■■ 4.53
SH3GL3-202ENST00000427482 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.36■■■■■ 4.53
SH3GL3-202ENST00000427482 SOGA1O94964 1423 aa43.27■■■■■ 4.52
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SH3GL3-202ENST00000427482 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.11■■■■■ 4.49
SH3GL3-202ENST00000427482 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.04■■■■■ 4.48
SH3GL3-202ENST00000427482 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
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SH3GL3-202ENST00000427482 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.97■■■■■ 4.47
SH3GL3-202ENST00000427482 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.92■■■■■ 4.46
SH3GL3-202ENST00000427482 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.91■■■■■ 4.46
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SH3GL3-202ENST00000427482 CEP162Q5TB80 1403 aa42.39■■■■■ 4.38
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SH3GL3-202ENST00000427482 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.26■■■■■ 4.36
SH3GL3-202ENST00000427482 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.24■■■■■ 4.35
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SH3GL3-202ENST00000427482 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.93■■■■■ 4.3
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SH3GL3-202ENST00000427482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
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SH3GL3-202ENST00000427482 ADAMTS12P58397 1594 aa41.38■■■■■ 4.21
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