RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312734.8

CGREF1-202, Transcript of cell growth regulator with EF-hand domain 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CGREF1, Length 1,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1-202ENST00000312734 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.92■■■■■ 7.82
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CGREF1-202ENST00000312734 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.44■■■■■ 6.15
CGREF1-202ENST00000312734 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.31■■■■■ 6.12
CGREF1-202ENST00000312734 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.8■■■■■ 6.04
CGREF1-202ENST00000312734 NACADO15069 1562 aa52.63■■■■■ 6.02
CGREF1-202ENST00000312734 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.58■■■■■ 6.01
CGREF1-202ENST00000312734 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.45■■■■■ 5.99
CGREF1-202ENST00000312734 SCRIBQ14160 1630 aa51.58■■■■■ 5.85
CGREF1-202ENST00000312734 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.46■■■■■ 5.83
CGREF1-202ENST00000312734 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.29■■■■■ 5.8
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CGREF1-202ENST00000312734 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.86■■■■■ 5.73
CGREF1-202ENST00000312734 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.78■■■■■ 5.56
CGREF1-202ENST00000312734 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
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CGREF1-202ENST00000312734 SMARCA4P51532 1647 aa49.34■■■■■ 5.49
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CGREF1-202ENST00000312734 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.99■■■■■ 5.43
CGREF1-202ENST00000312734 WIZO95785 1651 aa48.88■■■■■ 5.42
CGREF1-202ENST00000312734 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.84■■■■■ 5.41
CGREF1-202ENST00000312734 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.84■■■■■ 5.41
CGREF1-202ENST00000312734 SMARCA2P51531 1590 aa48.77■■■■■ 5.4
CGREF1-202ENST00000312734 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.76■■■■■ 5.4
CGREF1-202ENST00000312734 NCAPD3P42695 1498 aa48.6■■■■■ 5.37
CGREF1-202ENST00000312734 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
CGREF1-202ENST00000312734 HMGXB3Q12766 1538 aa48.4■■■■■ 5.34
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CGREF1-202ENST00000312734 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.86■■■■■ 5.25
CGREF1-202ENST00000312734 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.31■■■■■ 5.16
CGREF1-202ENST00000312734 NESP48681 1621 aa47.23■■■■■ 5.15
CGREF1-202ENST00000312734 CFTRP13569 1480 aa47.21■■■■■ 5.15
CGREF1-202ENST00000312734 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.11■■■■■ 5.13
CGREF1-202ENST00000312734 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.83■■■■■ 5.09
CGREF1-202ENST00000312734 PRDM2Q13029 1718 aa46.82■■■■■ 5.09
CGREF1-202ENST00000312734 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.76■■■■■ 5.08
CGREF1-202ENST00000312734 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.61■■■■■ 5.05
CGREF1-202ENST00000312734 ERCC6Q03468 1493 aa46.6■■■■■ 5.05
CGREF1-202ENST00000312734 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.58■■■■■ 5.05
CGREF1-202ENST00000312734 ABCC8Q09428 1581 aa46.49■■■■■ 5.03
CGREF1-202ENST00000312734 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.01
CGREF1-202ENST00000312734 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.29■■■■■ 5
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CGREF1-202ENST00000312734 CUX1P39880 1505 aa46.2■■■■■ 4.99
CGREF1-202ENST00000312734 SYNJ1O43426 1573 aa46.15■■■■■ 4.98
CGREF1-202ENST00000312734 TRIM41Q8WV44 630 aa46.15■■■■■ 4.98
CGREF1-202ENST00000312734 TOPBP1Q92547 1522 aa46.13■■■■■ 4.98
CGREF1-202ENST00000312734 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.97
CGREF1-202ENST00000312734 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.12■■■■■ 4.97
CGREF1-202ENST00000312734 TOP2BQ02880 1626 aa46.04■■■■■ 4.96
CGREF1-202ENST00000312734 WDR62O43379 1518 aa46.03■■■■■ 4.96
CGREF1-202ENST00000312734 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.99■■■■■ 4.95
CGREF1-202ENST00000312734 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.88■■■■■ 4.94
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CGREF1-202ENST00000312734 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.7■■■■■ 4.91
CGREF1-202ENST00000312734 CUX2O14529 1486 aa45.67■■■■■ 4.9
CGREF1-202ENST00000312734 IFT140Q96RY7 1462 aa45.54■■■■■ 4.88
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CGREF1-202ENST00000312734 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.44■■■■■ 4.86
CGREF1-202ENST00000312734 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
CGREF1-202ENST00000312734 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
CGREF1-202ENST00000312734 WDR97A6NE52 1622 aa45.33■■■■■ 4.85
CGREF1-202ENST00000312734 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.32■■■■■ 4.84
CGREF1-202ENST00000312734 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
CGREF1-202ENST00000312734 KIF27Q86VH2 1401 aa45.27■■■■■ 4.84
CGREF1-202ENST00000312734 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.25■■■■■ 4.83
CGREF1-202ENST00000312734 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.16■■■■■ 4.82
CGREF1-202ENST00000312734 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.13■■■■■ 4.81
CGREF1-202ENST00000312734 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
CGREF1-202ENST00000312734 EEA1Q15075 1411 aa45.06■■■■■ 4.8
CGREF1-202ENST00000312734 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.01■■■■■ 4.8
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CGREF1-202ENST00000312734 GRIN2BQ13224 1484 aa44.97■■■■■ 4.79
CGREF1-202ENST00000312734 PBRM1Q86U86 1689 aa44.92■■■■■ 4.78
CGREF1-202ENST00000312734 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.88■■■■■ 4.78
CGREF1-202ENST00000312734 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.8■■■■■ 4.76
CGREF1-202ENST00000312734 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.76■■■■■ 4.76
CGREF1-202ENST00000312734 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.73■■■■■ 4.75
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CGREF1-202ENST00000312734 PRXQ9BXM0 1461 aa44.65■■■■■ 4.74
CGREF1-202ENST00000312734 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.65■■■■■ 4.74
CGREF1-202ENST00000312734 ADAMTS12P58397 1594 aa44.63■■■■■ 4.73
CGREF1-202ENST00000312734 FBLN2P98095 1184 aa44.62■■■■■ 4.73
CGREF1-202ENST00000312734 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
CGREF1-202ENST00000312734 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.57■■■■■ 4.72
CGREF1-202ENST00000312734 SYNJ2O15056 1496 aa44.53■■■■■ 4.72
CGREF1-202ENST00000312734 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.53■■■■■ 4.72
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CGREF1-202ENST00000312734 GOLGA3Q08378 1498 aa44.41■■■■■ 4.7
CGREF1-202ENST00000312734 GRIN2AQ12879 1464 aa44.4■■■■■ 4.7
CGREF1-202ENST00000312734 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
CGREF1-202ENST00000312734 CHD1O14646 1710 aa44.34■■■■■ 4.69
CGREF1-202ENST00000312734 CEP170Q5SW79 1584 aa44.14■■■■■ 4.66
CGREF1-202ENST00000312734 NUP160Q12769 1436 aa44.12■■■■■ 4.65
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