RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375599.7

RSG1-201, Transcript of REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSG1, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1-201ENST00000375599 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.82■■■■■ 8.29
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RSG1-201ENST00000375599 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.78■■■■■ 6.52
RSG1-201ENST00000375599 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.73■■■■■ 6.51
RSG1-201ENST00000375599 NACADO15069 1562 aa55.59■■■■■ 6.49
RSG1-201ENST00000375599 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.55■■■■■ 6.48
RSG1-201ENST00000375599 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.38■■■■■ 6.46
RSG1-201ENST00000375599 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.31■■■■■ 6.44
RSG1-201ENST00000375599 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.2■■■■■ 6.27
RSG1-201ENST00000375599 SCRIBQ14160 1630 aa54.06■■■■■ 6.24
RSG1-201ENST00000375599 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.88■■■■■ 6.22
RSG1-201ENST00000375599 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.79■■■■■ 6.2
RSG1-201ENST00000375599 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.32■■■■■ 6.13
RSG1-201ENST00000375599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.4■■■■■ 5.98
RSG1-201ENST00000375599 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.37■■■■■ 5.97
RSG1-201ENST00000375599 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.05■■■■■ 5.92
RSG1-201ENST00000375599 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.99■■■■■ 5.91
RSG1-201ENST00000375599 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.78■■■■■ 5.88
RSG1-201ENST00000375599 SMARCA4P51532 1647 aa51.74■■■■■ 5.87
RSG1-201ENST00000375599 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.49■■■■■ 5.83
RSG1-201ENST00000375599 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.38■■■■■ 5.82
RSG1-201ENST00000375599 SMARCA2P51531 1590 aa51.36■■■■■ 5.81
RSG1-201ENST00000375599 NCAPD3P42695 1498 aa51.29■■■■■ 5.8
RSG1-201ENST00000375599 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.22■■■■■ 5.79
RSG1-201ENST00000375599 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.08■■■■■ 5.77
RSG1-201ENST00000375599 HMGXB3Q12766 1538 aa51.06■■■■■ 5.76
RSG1-201ENST00000375599 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51■■■■■ 5.75
RSG1-201ENST00000375599 WIZO95785 1651 aa50.95■■■■■ 5.75
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RSG1-201ENST00000375599 NESP48681 1621 aa49.89■■■■■ 5.58
RSG1-201ENST00000375599 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.87■■■■■ 5.57
RSG1-201ENST00000375599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.87■■■■■ 5.57
RSG1-201ENST00000375599 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.84■■■■■ 5.57
RSG1-201ENST00000375599 CFTRP13569 1480 aa49.61■■■■■ 5.53
RSG1-201ENST00000375599 ERCC6Q03468 1493 aa49.61■■■■■ 5.53
RSG1-201ENST00000375599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.57■■■■■ 5.53
RSG1-201ENST00000375599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.3■■■■■ 5.48
RSG1-201ENST00000375599 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.26■■■■■ 5.48
RSG1-201ENST00000375599 PRDM2Q13029 1718 aa49.21■■■■■ 5.47
RSG1-201ENST00000375599 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.17■■■■■ 5.46
RSG1-201ENST00000375599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
RSG1-201ENST00000375599 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.99■■■■■ 5.43
RSG1-201ENST00000375599 CUX2O14529 1486 aa48.9■■■■■ 5.42
RSG1-201ENST00000375599 WDR62O43379 1518 aa48.78■■■■■ 5.4
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RSG1-201ENST00000375599 ABCC8Q09428 1581 aa48.58■■■■■ 5.37
RSG1-201ENST00000375599 TOPBP1Q92547 1522 aa48.5■■■■■ 5.36
RSG1-201ENST00000375599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.48■■■■■ 5.35
RSG1-201ENST00000375599 CUX1P39880 1505 aa48.28■■■■■ 5.32
RSG1-201ENST00000375599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.18■■■■■ 5.3
RSG1-201ENST00000375599 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.12■■■■■ 5.29
RSG1-201ENST00000375599 IFT140Q96RY7 1462 aa48.12■■■■■ 5.29
RSG1-201ENST00000375599 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.07■■■■■ 5.29
RSG1-201ENST00000375599 TOP2BQ02880 1626 aa47.99■■■■■ 5.27
RSG1-201ENST00000375599 SOGA1O94964 1423 aa47.98■■■■■ 5.27
RSG1-201ENST00000375599 SYNJ1O43426 1573 aa47.97■■■■■ 5.27
RSG1-201ENST00000375599 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.96■■■■■ 5.27
RSG1-201ENST00000375599 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.91■■■■■ 5.26
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RSG1-201ENST00000375599 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.64■■■■■ 5.22
RSG1-201ENST00000375599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
RSG1-201ENST00000375599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.63■■■■■ 5.22
RSG1-201ENST00000375599 WDR97A6NE52 1622 aa47.59■■■■■ 5.21
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RSG1-201ENST00000375599 TRIM41Q8WV44 630 aa47.41■■■■■ 5.18
RSG1-201ENST00000375599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.36■■■■■ 5.17
RSG1-201ENST00000375599 GRIN2BQ13224 1484 aa47.35■■■■■ 5.17
RSG1-201ENST00000375599 PBRM1Q86U86 1689 aa47.22■■■■■ 5.15
RSG1-201ENST00000375599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.21■■■■■ 5.15
RSG1-201ENST00000375599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
RSG1-201ENST00000375599 KIF27Q86VH2 1401 aa47.17■■■■■ 5.14
RSG1-201ENST00000375599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.08■■■■■ 5.13
RSG1-201ENST00000375599 FBLN2P98095 1184 aa47.07■■■■■ 5.13
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RSG1-201ENST00000375599 OSCARQ8IYS5 282 aa47.02■■■■■ 5.12
RSG1-201ENST00000375599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.12
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RSG1-201ENST00000375599 EEA1Q15075 1411 aa46.55■■■■■ 5.04
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RSG1-201ENST00000375599 CEP170Q5SW79 1584 aa46.44■■■■■ 5.02
RSG1-201ENST00000375599 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.4■■■■■ 5.02
RSG1-201ENST00000375599 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
RSG1-201ENST00000375599 PRXQ9BXM0 1461 aa46.32■■■■■ 5.01
RSG1-201ENST00000375599 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.18■■■■■ 4.98
RSG1-201ENST00000375599 ARHGEF11O15085 1522 aa46.17■■■■■ 4.98
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