RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393033.8

GIPC1-203, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-203ENST00000393033 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.27■■■■■ 6.76
GIPC1-203ENST00000393033 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.45■■■■■ 5.51
GIPC1-203ENST00000393033 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
GIPC1-203ENST00000393033 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.47■■■■■ 5.19
GIPC1-203ENST00000393033 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.34■■■■■ 5.17
GIPC1-203ENST00000393033 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.95■■■■■ 5.11
GIPC1-203ENST00000393033 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.37■■■■■ 5.01
GIPC1-203ENST00000393033 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
GIPC1-203ENST00000393033 ABCC9O60706 1549 aa45.85■■■■■ 4.93
GIPC1-203ENST00000393033 NACADO15069 1562 aa45.79■■■■■ 4.92
GIPC1-203ENST00000393033 SCRIBQ14160 1630 aa45.65■■■■■ 4.9
GIPC1-203ENST00000393033 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.15■■■■■ 4.82
GIPC1-203ENST00000393033 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
GIPC1-203ENST00000393033 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.77■■■■■ 4.76
GIPC1-203ENST00000393033 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.46■■■■■ 4.71
GIPC1-203ENST00000393033 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.41■■■■■ 4.7
GIPC1-203ENST00000393033 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.32■■■■■ 4.68
GIPC1-203ENST00000393033 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
GIPC1-203ENST00000393033 WIZO95785 1651 aa44.03■■■■■ 4.64
GIPC1-203ENST00000393033 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.85■■■■■ 4.61
GIPC1-203ENST00000393033 SMARCA4P51532 1647 aa43.82■■■■■ 4.61
GIPC1-203ENST00000393033 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
GIPC1-203ENST00000393033 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.46■■■■■ 4.55
GIPC1-203ENST00000393033 TRIM41Q8WV44 630 aa43.32■■■■■ 4.52
GIPC1-203ENST00000393033 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
GIPC1-203ENST00000393033 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.24■■■■■ 4.51
GIPC1-203ENST00000393033 SMARCA2P51531 1590 aa43.21■■■■■ 4.51
GIPC1-203ENST00000393033 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.15■■■■■ 4.5
GIPC1-203ENST00000393033 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.12■■■■■ 4.49
GIPC1-203ENST00000393033 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.83■■■■■ 4.45
GIPC1-203ENST00000393033 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
GIPC1-203ENST00000393033 ABCC8Q09428 1581 aa42.6■■■■■ 4.41
GIPC1-203ENST00000393033 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
GIPC1-203ENST00000393033 HMGXB3Q12766 1538 aa42.3■■■■■ 4.36
GIPC1-203ENST00000393033 NCAPD3P42695 1498 aa42.27■■■■■ 4.36
GIPC1-203ENST00000393033 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.22■■■■■ 4.35
GIPC1-203ENST00000393033 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.15■■■■■ 4.34
GIPC1-203ENST00000393033 EEA1Q15075 1411 aa42.08■■■■■ 4.33
GIPC1-203ENST00000393033 SOGA1O94964 1423 aa42■■■■■ 4.31
GIPC1-203ENST00000393033 SYNJ1O43426 1573 aa41.99■■■■■ 4.31
GIPC1-203ENST00000393033 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.95■■■■■ 4.31
GIPC1-203ENST00000393033 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
GIPC1-203ENST00000393033 HRCP23327 699 aa41.87■■■■■ 4.29
GIPC1-203ENST00000393033 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.8■■■■■ 4.28
GIPC1-203ENST00000393033 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.77■■■■■ 4.28
GIPC1-203ENST00000393033 TOP2BQ02880 1626 aa41.72■■■■■ 4.27
GIPC1-203ENST00000393033 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.67■■■■■ 4.26
GIPC1-203ENST00000393033 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.64■■■■■ 4.26
GIPC1-203ENST00000393033 CFTRP13569 1480 aa41.63■■■■■ 4.26
GIPC1-203ENST00000393033 GOLGA3Q08378 1498 aa41.56■■■■■ 4.24
GIPC1-203ENST00000393033 PRDM2Q13029 1718 aa41.53■■■■■ 4.24
GIPC1-203ENST00000393033 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.53■■■■■ 4.24
GIPC1-203ENST00000393033 KIF21BO75037 1637 aa41.52■■■■■ 4.24
GIPC1-203ENST00000393033 CEP162Q5TB80 1403 aa41.51■■■■■ 4.24
GIPC1-203ENST00000393033 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.45■■■■■ 4.23
GIPC1-203ENST00000393033 CUX1P39880 1505 aa41.37■■■■■ 4.21
GIPC1-203ENST00000393033 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
GIPC1-203ENST00000393033 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.25■■■■■ 4.19
GIPC1-203ENST00000393033 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.1■■■■■ 4.17
GIPC1-203ENST00000393033 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.04■■■■■ 4.16
GIPC1-203ENST00000393033 PRXQ9BXM0 1461 aa41■■■■■ 4.15
GIPC1-203ENST00000393033 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
GIPC1-203ENST00000393033 KIF27Q86VH2 1401 aa40.98■■■■■ 4.15
GIPC1-203ENST00000393033 CLIP1P30622 1438 aa40.94■■■■■ 4.14
GIPC1-203ENST00000393033 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.82■■■■■ 4.12
GIPC1-203ENST00000393033 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
GIPC1-203ENST00000393033 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.74■■■■■ 4.11
GIPC1-203ENST00000393033 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.74■■■■■ 4.11
GIPC1-203ENST00000393033 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.66■■■■■ 4.1
GIPC1-203ENST00000393033 CUX2O14529 1486 aa40.66■■■■■ 4.1
GIPC1-203ENST00000393033 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.65■■■■■ 4.1
GIPC1-203ENST00000393033 NESP48681 1621 aa40.61■■■■■ 4.09
GIPC1-203ENST00000393033 IGF1RP08069 1367 aa40.54■■■■■ 4.08
GIPC1-203ENST00000393033 TOPBP1Q92547 1522 aa40.51■■■■■ 4.08
GIPC1-203ENST00000393033 ARAP1Q96P48 1450 aa40.44■■■■■ 4.06
GIPC1-203ENST00000393033 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
GIPC1-203ENST00000393033 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.4■■■■■ 4.06
GIPC1-203ENST00000393033 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
GIPC1-203ENST00000393033 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
GIPC1-203ENST00000393033 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.34■■■■■ 4.05
GIPC1-203ENST00000393033 APLP2Q06481 763 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-203ENST00000393033 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.29■■■■■ 4.04
GIPC1-203ENST00000393033 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
GIPC1-203ENST00000393033 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.28■■■■■ 4.04
GIPC1-203ENST00000393033 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.24■■■■■ 4.03
GIPC1-203ENST00000393033 WDR97A6NE52 1622 aa40.21■■■■■ 4.03
GIPC1-203ENST00000393033 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.2■■■■■ 4.03
GIPC1-203ENST00000393033 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
GIPC1-203ENST00000393033 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.15■■■■■ 4.02
GIPC1-203ENST00000393033 CUL7Q14999 1698 aa40.14■■■■■ 4.02
GIPC1-203ENST00000393033 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
GIPC1-203ENST00000393033 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40■■■■□ 3.99
GIPC1-203ENST00000393033 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.88■■■■□ 3.97
GIPC1-203ENST00000393033 MAP3K1Q13233 1512 aa39.85■■■■□ 3.97
GIPC1-203ENST00000393033 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
GIPC1-203ENST00000393033 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
GIPC1-203ENST00000393033 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.83■■■■□ 3.97
GIPC1-203ENST00000393033 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.79■■■■□ 3.96
GIPC1-203ENST00000393033 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
GIPC1-203ENST00000393033 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms