RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603448.1

AP002365.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP002365.1, Length 772 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002365.1-201ENST00000603448 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.3■■■■■ 9.17
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.87■■■■■ 7.98
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCC9O60706 1549 aa64.3■■■■■ 7.88
AP002365.1-201ENST00000603448 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.48■■■■■ 7.43
AP002365.1-201ENST00000603448 NACADO15069 1562 aa61.15■■■■■ 7.38
AP002365.1-201ENST00000603448 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.67■■■■■ 7.3
AP002365.1-201ENST00000603448 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.45■■■■■ 7.27
AP002365.1-201ENST00000603448 UNC13AQ9UPW8 1703 aa60.23■■■■■ 7.23
AP002365.1-201ENST00000603448 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.02■■■■■ 7.2
AP002365.1-201ENST00000603448 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.88■■■■■ 7.18
AP002365.1-201ENST00000603448 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.83■■■■■ 7.17
AP002365.1-201ENST00000603448 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.8■■■■■ 7.16
AP002365.1-201ENST00000603448 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.65■■■■■ 7.14
AP002365.1-201ENST00000603448 SCRIBQ14160 1630 aa59.03■■■■■ 7.04
AP002365.1-201ENST00000603448 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.94■■■■■ 7.03
AP002365.1-201ENST00000603448 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa58.19■■■■■ 6.91
AP002365.1-201ENST00000603448 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP58.16■■■■■ 6.9
AP002365.1-201ENST00000603448 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.9■■■■■ 6.86
AP002365.1-201ENST00000603448 SMARCA4P51532 1647 aa56.38■■■■■ 6.62
AP002365.1-201ENST00000603448 NCAPD3P42695 1498 aa56.38■■■■■ 6.62
AP002365.1-201ENST00000603448 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.26■■■■■ 6.6
AP002365.1-201ENST00000603448 SMARCA2P51531 1590 aa56.18■■■■■ 6.58
AP002365.1-201ENST00000603448 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.13■■■■■ 6.58
AP002365.1-201ENST00000603448 HMGXB3Q12766 1538 aa56.07■■■■■ 6.57
AP002365.1-201ENST00000603448 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.85■■■■■ 6.53
AP002365.1-201ENST00000603448 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.75■■■■■ 6.52
AP002365.1-201ENST00000603448 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.7■■■■■ 6.51
AP002365.1-201ENST00000603448 ERCC6Q03468 1493 aa55.51■■■■■ 6.48
AP002365.1-201ENST00000603448 NESP48681 1621 aa55.35■■■■■ 6.45
AP002365.1-201ENST00000603448 CUX2O14529 1486 aa55.34■■■■■ 6.45
AP002365.1-201ENST00000603448 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa55.14■■■■■ 6.42
AP002365.1-201ENST00000603448 WIZO95785 1651 aa55.11■■■■■ 6.41
AP002365.1-201ENST00000603448 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.84■■■■■ 6.37
AP002365.1-201ENST00000603448 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.81■■■■■ 6.36
AP002365.1-201ENST00000603448 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.76■■■■■ 6.36
AP002365.1-201ENST00000603448 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.71■■■■■ 6.35
AP002365.1-201ENST00000603448 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.65■■■■■ 6.34
AP002365.1-201ENST00000603448 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.63■■■■■ 6.34
AP002365.1-201ENST00000603448 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.44■■■■■ 6.3
AP002365.1-201ENST00000603448 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.24■■■■■ 6.27
AP002365.1-201ENST00000603448 CFTRP13569 1480 aa54.15■■■■■ 6.26
AP002365.1-201ENST00000603448 WDR62O43379 1518 aa54.14■■■■■ 6.26
AP002365.1-201ENST00000603448 CEP164Q9UPV0 1460 aa54.1■■■■■ 6.25
AP002365.1-201ENST00000603448 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.06■■■■■ 6.24
AP002365.1-201ENST00000603448 PRDM2Q13029 1718 aa53.89■■■■■ 6.22
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.74■■■■■ 6.19
AP002365.1-201ENST00000603448 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
AP002365.1-201ENST00000603448 TOPBP1Q92547 1522 aa53.11■■■■■ 6.09
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCC8Q09428 1581 aa53.03■■■■■ 6.08
AP002365.1-201ENST00000603448 IFT140Q96RY7 1462 aa53.01■■■■■ 6.08
AP002365.1-201ENST00000603448 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.98■■■■■ 6.07
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.85■■■■■ 6.05
AP002365.1-201ENST00000603448 OSCARQ8IYS5 282 aa52.76■■■■■ 6.04
AP002365.1-201ENST00000603448 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.68■■■■■ 6.02
AP002365.1-201ENST00000603448 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.66■■■■■ 6.02
AP002365.1-201ENST00000603448 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.57■■■■■ 6.01
AP002365.1-201ENST00000603448 TRIM41Q8WV44 630 aa52.47■■■■■ 5.99
AP002365.1-201ENST00000603448 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.39■■■■■ 5.98
AP002365.1-201ENST00000603448 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.38■■■■■ 5.98
AP002365.1-201ENST00000603448 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.33■■■■■ 5.97
AP002365.1-201ENST00000603448 CUX1P39880 1505 aa52.32■■■■■ 5.97
AP002365.1-201ENST00000603448 SOGA1O94964 1423 aa52.3■■■■■ 5.96
AP002365.1-201ENST00000603448 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.3■■■■■ 5.96
AP002365.1-201ENST00000603448 CHD1O14646 1710 aa52.28■■■■■ 5.96
AP002365.1-201ENST00000603448 WDR97A6NE52 1622 aa52.22■■■■■ 5.95
AP002365.1-201ENST00000603448 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa52.18■■■■■ 5.94
AP002365.1-201ENST00000603448 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa52.18■■■■■ 5.94
AP002365.1-201ENST00000603448 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa52.18■■■■■ 5.94
AP002365.1-201ENST00000603448 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGEF11O15085 1522 aa52■■■■■ 5.92
AP002365.1-201ENST00000603448 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.92■■■■■ 5.9
AP002365.1-201ENST00000603448 FBLN2P98095 1184 aa51.9■■■■■ 5.9
AP002365.1-201ENST00000603448 GRIN2BQ13224 1484 aa51.84■■■■■ 5.89
AP002365.1-201ENST00000603448 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.84■■■■■ 5.89
AP002365.1-201ENST00000603448 PBRM1Q86U86 1689 aa51.81■■■■■ 5.89
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.75■■■■■ 5.88
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.71■■■■■ 5.87
AP002365.1-201ENST00000603448 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.7■■■■■ 5.87
AP002365.1-201ENST00000603448 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.69■■■■■ 5.87
AP002365.1-201ENST00000603448 TOP2BQ02880 1626 aa51.64■■■■■ 5.86
AP002365.1-201ENST00000603448 SYNJ1O43426 1573 aa51.63■■■■■ 5.86
AP002365.1-201ENST00000603448 SYNJ2O15056 1496 aa51.63■■■■■ 5.86
AP002365.1-201ENST00000603448 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.62■■■■■ 5.85
AP002365.1-201ENST00000603448 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.61■■■■■ 5.85
AP002365.1-201ENST00000603448 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.56■■■■■ 5.85
AP002365.1-201ENST00000603448 ARAP1Q96P48 1450 aa51.5■■■■■ 5.84
AP002365.1-201ENST00000603448 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.47■■■■■ 5.83
AP002365.1-201ENST00000603448 ADAMTS12P58397 1594 aa51.27■■■■■ 5.8
AP002365.1-201ENST00000603448 GRIN2AQ12879 1464 aa51.18■■■■■ 5.78
AP002365.1-201ENST00000603448 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.13■■■■■ 5.78
AP002365.1-201ENST00000603448 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.06■■■■■ 5.76
AP002365.1-201ENST00000603448 CEP170Q5SW79 1584 aa51.02■■■■■ 5.76
AP002365.1-201ENST00000603448 NUP160Q12769 1436 aa50.99■■■■■ 5.75
AP002365.1-201ENST00000603448 SHROOM2Q13796 1616 aa50.82■■■■■ 5.73
AP002365.1-201ENST00000603448 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.79■■■■■ 5.72
AP002365.1-201ENST00000603448 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.78■■■■■ 5.72
AP002365.1-201ENST00000603448 KIF27Q86VH2 1401 aa50.55■■■■■ 5.68
AP002365.1-201ENST00000603448 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.54■■■■■ 5.68
AP002365.1-201ENST00000603448 CUL7Q14999 1698 aa50.53■■■■■ 5.68
AP002365.1-201ENST00000603448 IGF1RP08069 1367 aa50.45■■■■■ 5.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms