RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298352.4

NGB-201, Transcript of neuroglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NGB, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGB-201ENST00000298352 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.38■■■■■ 6.78
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NGB-201ENST00000298352 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
NGB-201ENST00000298352 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.47■■■■■ 5.19
NGB-201ENST00000298352 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.39■■■■■ 5.18
NGB-201ENST00000298352 ABCC9O60706 1549 aa47.1■■■■■ 5.13
NGB-201ENST00000298352 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.08■■■■■ 5.13
NGB-201ENST00000298352 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.73■■■■■ 5.07
NGB-201ENST00000298352 NACADO15069 1562 aa46.45■■■■■ 5.03
NGB-201ENST00000298352 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.03■■■■■ 4.96
NGB-201ENST00000298352 SCRIBQ14160 1630 aa46.02■■■■■ 4.96
NGB-201ENST00000298352 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
NGB-201ENST00000298352 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.09■■■■■ 4.81
NGB-201ENST00000298352 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.61■■■■■ 4.73
NGB-201ENST00000298352 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
NGB-201ENST00000298352 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.59■■■■■ 4.73
NGB-201ENST00000298352 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.51■■■■■ 4.72
NGB-201ENST00000298352 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
NGB-201ENST00000298352 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.36■■■■■ 4.69
NGB-201ENST00000298352 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
NGB-201ENST00000298352 SMARCA4P51532 1647 aa44.08■■■■■ 4.65
NGB-201ENST00000298352 WIZO95785 1651 aa44.03■■■■■ 4.64
NGB-201ENST00000298352 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
NGB-201ENST00000298352 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.47■■■■■ 4.55
NGB-201ENST00000298352 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.29■■■■■ 4.52
NGB-201ENST00000298352 SMARCA2P51531 1590 aa43.28■■■■■ 4.52
NGB-201ENST00000298352 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
NGB-201ENST00000298352 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.12■■■■■ 4.49
NGB-201ENST00000298352 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
NGB-201ENST00000298352 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
NGB-201ENST00000298352 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.89■■■■■ 4.46
NGB-201ENST00000298352 NCAPD3P42695 1498 aa42.86■■■■■ 4.45
NGB-201ENST00000298352 HMGXB3Q12766 1538 aa42.82■■■■■ 4.45
NGB-201ENST00000298352 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.59■■■■■ 4.41
NGB-201ENST00000298352 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.45■■■■■ 4.39
NGB-201ENST00000298352 HRCP23327 699 aa42.38■■■■■ 4.37
NGB-201ENST00000298352 ABCC8Q09428 1581 aa42.31■■■■■ 4.36
NGB-201ENST00000298352 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
NGB-201ENST00000298352 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
NGB-201ENST00000298352 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.31
NGB-201ENST00000298352 CFTRP13569 1480 aa41.97■■■■■ 4.31
NGB-201ENST00000298352 SYNJ1O43426 1573 aa41.81■■■■■ 4.28
NGB-201ENST00000298352 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.81■■■■■ 4.28
NGB-201ENST00000298352 PRDM2Q13029 1718 aa41.79■■■■■ 4.28
NGB-201ENST00000298352 EEA1Q15075 1411 aa41.71■■■■■ 4.27
NGB-201ENST00000298352 TOP2BQ02880 1626 aa41.62■■■■■ 4.25
NGB-201ENST00000298352 SOGA1O94964 1423 aa41.6■■■■■ 4.25
NGB-201ENST00000298352 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.58■■■■■ 4.25
NGB-201ENST00000298352 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.56■■■■■ 4.24
NGB-201ENST00000298352 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.54■■■■■ 4.24
NGB-201ENST00000298352 CUX1P39880 1505 aa41.46■■■■■ 4.23
NGB-201ENST00000298352 NESP48681 1621 aa41.4■■■■■ 4.22
NGB-201ENST00000298352 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.39■■■■■ 4.22
NGB-201ENST00000298352 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.38■■■■■ 4.22
NGB-201ENST00000298352 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.38■■■■■ 4.22
NGB-201ENST00000298352 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.37■■■■■ 4.21
NGB-201ENST00000298352 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.24■■■■■ 4.19
NGB-201ENST00000298352 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
NGB-201ENST00000298352 GOLGA3Q08378 1498 aa41.15■■■■■ 4.18
NGB-201ENST00000298352 KIF21BO75037 1637 aa41.12■■■■■ 4.17
NGB-201ENST00000298352 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
NGB-201ENST00000298352 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.09■■■■■ 4.17
NGB-201ENST00000298352 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.09■■■■■ 4.17
NGB-201ENST00000298352 CEP162Q5TB80 1403 aa41.09■■■■■ 4.17
NGB-201ENST00000298352 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.03■■■■■ 4.16
NGB-201ENST00000298352 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
NGB-201ENST00000298352 TOPBP1Q92547 1522 aa40.94■■■■■ 4.14
NGB-201ENST00000298352 KIF27Q86VH2 1401 aa40.93■■■■■ 4.14
NGB-201ENST00000298352 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
NGB-201ENST00000298352 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.9■■■■■ 4.14
NGB-201ENST00000298352 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
NGB-201ENST00000298352 CUX2O14529 1486 aa40.79■■■■■ 4.12
NGB-201ENST00000298352 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
NGB-201ENST00000298352 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.73■■■■■ 4.11
NGB-201ENST00000298352 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.72■■■■■ 4.11
NGB-201ENST00000298352 PRXQ9BXM0 1461 aa40.71■■■■■ 4.11
NGB-201ENST00000298352 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.65■■■■■ 4.1
NGB-201ENST00000298352 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.6■■■■■ 4.09
NGB-201ENST00000298352 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.55■■■■■ 4.08
NGB-201ENST00000298352 IGF1RP08069 1367 aa40.52■■■■■ 4.08
NGB-201ENST00000298352 CLIP1P30622 1438 aa40.5■■■■■ 4.07
NGB-201ENST00000298352 WDR97A6NE52 1622 aa40.44■■■■■ 4.06
NGB-201ENST00000298352 ERCC6Q03468 1493 aa40.39■■■■■ 4.06
NGB-201ENST00000298352 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.35■■■■■ 4.05
NGB-201ENST00000298352 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.31■■■■■ 4.04
NGB-201ENST00000298352 WDR62O43379 1518 aa40.3■■■■■ 4.04
NGB-201ENST00000298352 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
NGB-201ENST00000298352 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.26■■■■■ 4.03
NGB-201ENST00000298352 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
NGB-201ENST00000298352 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
NGB-201ENST00000298352 CUL7Q14999 1698 aa40.2■■■■■ 4.03
NGB-201ENST00000298352 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.19■■■■■ 4.02
NGB-201ENST00000298352 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
NGB-201ENST00000298352 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
NGB-201ENST00000298352 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
NGB-201ENST00000298352 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
NGB-201ENST00000298352 IFT140Q96RY7 1462 aa40.09■■■■■ 4.01
NGB-201ENST00000298352 APLP2Q06481 763 aa40.09■■■■■ 4.01
NGB-201ENST00000298352 ARAP1Q96P48 1450 aa40.02■■■■■ 4
NGB-201ENST00000298352 PBRM1Q86U86 1689 aa39.95■■■■□ 3.99
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