RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261947.4

RNF130-201, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF130, Length 1,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-201ENST00000261947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.75■■■■■ 7.8
RNF130-201ENST00000261947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.03■■■■■ 6.56
RNF130-201ENST00000261947 ABCC9O60706 1549 aa53.61■■■■■ 6.17
RNF130-201ENST00000261947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
RNF130-201ENST00000261947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.84■■■■■ 6.05
RNF130-201ENST00000261947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.75■■■■■ 6.04
RNF130-201ENST00000261947 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.44■■■■■ 5.99
RNF130-201ENST00000261947 NACADO15069 1562 aa52.35■■■■■ 5.97
RNF130-201ENST00000261947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.09■■■■■ 5.93
RNF130-201ENST00000261947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.34■■■■■ 5.81
RNF130-201ENST00000261947 SCRIBQ14160 1630 aa51.33■■■■■ 5.81
RNF130-201ENST00000261947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.04■■■■■ 5.76
RNF130-201ENST00000261947 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.52■■■■■ 5.68
RNF130-201ENST00000261947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.37■■■■■ 5.65
RNF130-201ENST00000261947 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.57■■■■■ 5.53
RNF130-201ENST00000261947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.3■■■■■ 5.48
RNF130-201ENST00000261947 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.21■■■■■ 5.47
RNF130-201ENST00000261947 SMARCA4P51532 1647 aa49.19■■■■■ 5.47
RNF130-201ENST00000261947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.12■■■■■ 5.45
RNF130-201ENST00000261947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
RNF130-201ENST00000261947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
RNF130-201ENST00000261947 WIZO95785 1651 aa48.77■■■■■ 5.4
RNF130-201ENST00000261947 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.65■■■■■ 5.38
RNF130-201ENST00000261947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.56■■■■■ 5.36
RNF130-201ENST00000261947 SMARCA2P51531 1590 aa48.55■■■■■ 5.36
RNF130-201ENST00000261947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.54■■■■■ 5.36
RNF130-201ENST00000261947 NCAPD3P42695 1498 aa48.3■■■■■ 5.32
RNF130-201ENST00000261947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.32
RNF130-201ENST00000261947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
RNF130-201ENST00000261947 HMGXB3Q12766 1538 aa48.18■■■■■ 5.3
RNF130-201ENST00000261947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48■■■■■ 5.27
RNF130-201ENST00000261947 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.72■■■■■ 5.23
RNF130-201ENST00000261947 CFTRP13569 1480 aa47■■■■■ 5.11
RNF130-201ENST00000261947 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.99■■■■■ 5.11
RNF130-201ENST00000261947 NESP48681 1621 aa46.82■■■■■ 5.09
RNF130-201ENST00000261947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.82■■■■■ 5.08
RNF130-201ENST00000261947 PRDM2Q13029 1718 aa46.78■■■■■ 5.08
RNF130-201ENST00000261947 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.51■■■■■ 5.04
RNF130-201ENST00000261947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.46■■■■■ 5.03
RNF130-201ENST00000261947 ABCC8Q09428 1581 aa46.45■■■■■ 5.03
RNF130-201ENST00000261947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.45■■■■■ 5.03
RNF130-201ENST00000261947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.3■■■■■ 5
RNF130-201ENST00000261947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
RNF130-201ENST00000261947 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.26■■■■■ 5
RNF130-201ENST00000261947 TRIM41Q8WV44 630 aa46.17■■■■■ 4.98
RNF130-201ENST00000261947 SYNJ1O43426 1573 aa46.11■■■■■ 4.97
RNF130-201ENST00000261947 ERCC6Q03468 1493 aa46.07■■■■■ 4.96
RNF130-201ENST00000261947 CUX1P39880 1505 aa46.06■■■■■ 4.96
RNF130-201ENST00000261947 TOP2BQ02880 1626 aa46.02■■■■■ 4.96
RNF130-201ENST00000261947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46■■■■■ 4.95
RNF130-201ENST00000261947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
RNF130-201ENST00000261947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.92■■■■■ 4.94
RNF130-201ENST00000261947 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.89■■■■■ 4.94
RNF130-201ENST00000261947 TOPBP1Q92547 1522 aa45.88■■■■■ 4.94
RNF130-201ENST00000261947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
RNF130-201ENST00000261947 WDR62O43379 1518 aa45.7■■■■■ 4.91
RNF130-201ENST00000261947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.69■■■■■ 4.9
RNF130-201ENST00000261947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
RNF130-201ENST00000261947 SOGA1O94964 1423 aa45.43■■■■■ 4.86
RNF130-201ENST00000261947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.41■■■■■ 4.86
RNF130-201ENST00000261947 CUX2O14529 1486 aa45.35■■■■■ 4.85
RNF130-201ENST00000261947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.28■■■■■ 4.84
RNF130-201ENST00000261947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.28■■■■■ 4.84
RNF130-201ENST00000261947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
RNF130-201ENST00000261947 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
RNF130-201ENST00000261947 WDR97A6NE52 1622 aa45.23■■■■■ 4.83
RNF130-201ENST00000261947 IFT140Q96RY7 1462 aa45.21■■■■■ 4.83
RNF130-201ENST00000261947 EEA1Q15075 1411 aa45.19■■■■■ 4.82
RNF130-201ENST00000261947 KIF27Q86VH2 1401 aa45.18■■■■■ 4.82
RNF130-201ENST00000261947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
RNF130-201ENST00000261947 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45■■■■■ 4.79
RNF130-201ENST00000261947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.99■■■■■ 4.79
RNF130-201ENST00000261947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
RNF130-201ENST00000261947 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.93■■■■■ 4.78
RNF130-201ENST00000261947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.9■■■■■ 4.78
RNF130-201ENST00000261947 IGF1RP08069 1367 aa44.85■■■■■ 4.77
RNF130-201ENST00000261947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
RNF130-201ENST00000261947 PBRM1Q86U86 1689 aa44.76■■■■■ 4.76
RNF130-201ENST00000261947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.76■■■■■ 4.76
RNF130-201ENST00000261947 GRIN2BQ13224 1484 aa44.71■■■■■ 4.75
RNF130-201ENST00000261947 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.68■■■■■ 4.74
RNF130-201ENST00000261947 PRXQ9BXM0 1461 aa44.66■■■■■ 4.74
RNF130-201ENST00000261947 KIF21BO75037 1637 aa44.65■■■■■ 4.74
RNF130-201ENST00000261947 CUL7Q14999 1698 aa44.62■■■■■ 4.73
RNF130-201ENST00000261947 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.61■■■■■ 4.73
RNF130-201ENST00000261947 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.61■■■■■ 4.73
RNF130-201ENST00000261947 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.53■■■■■ 4.72
RNF130-201ENST00000261947 GOLGA3Q08378 1498 aa44.51■■■■■ 4.72
RNF130-201ENST00000261947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.48■■■■■ 4.71
RNF130-201ENST00000261947 ADAMTS12P58397 1594 aa44.45■■■■■ 4.71
RNF130-201ENST00000261947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
RNF130-201ENST00000261947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.43■■■■■ 4.7
RNF130-201ENST00000261947 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
RNF130-201ENST00000261947 SYNJ2O15056 1496 aa44.25■■■■■ 4.67
RNF130-201ENST00000261947 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.21■■■■■ 4.67
RNF130-201ENST00000261947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
RNF130-201ENST00000261947 GRIN2AQ12879 1464 aa44.15■■■■■ 4.66
RNF130-201ENST00000261947 FBLN2P98095 1184 aa44.12■■■■■ 4.65
RNF130-201ENST00000261947 CHD1O14646 1710 aa44.03■■■■■ 4.64
RNF130-201ENST00000261947 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.02■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms