RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296504.3

SAP30-201, Transcript of Sin3A associated protein 30, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAP30, Length 1,108 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30-201ENST00000296504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.25■■■■■ 8.84
SAP30-201ENST00000296504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.64■■■■■ 7.62
SAP30-201ENST00000296504 ABCC9O60706 1549 aa61.63■■■■■ 7.46
SAP30-201ENST00000296504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.12■■■■■ 7.05
SAP30-201ENST00000296504 NACADO15069 1562 aa58.96■■■■■ 7.03
SAP30-201ENST00000296504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.85■■■■■ 7.01
SAP30-201ENST00000296504 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.47■■■■■ 6.95
SAP30-201ENST00000296504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.43■■■■■ 6.94
SAP30-201ENST00000296504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.09■■■■■ 6.89
SAP30-201ENST00000296504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.84■■■■■ 6.85
SAP30-201ENST00000296504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.53■■■■■ 6.8
SAP30-201ENST00000296504 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.37■■■■■ 6.77
SAP30-201ENST00000296504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.17■■■■■ 6.74
SAP30-201ENST00000296504 SCRIBQ14160 1630 aa57.12■■■■■ 6.73
SAP30-201ENST00000296504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.67■■■■■ 6.66
SAP30-201ENST00000296504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.87■■■■■ 6.53
SAP30-201ENST00000296504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.75■■■■■ 6.51
SAP30-201ENST00000296504 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.41■■■■■ 6.46
SAP30-201ENST00000296504 SMARCA4P51532 1647 aa54.6■■■■■ 6.33
SAP30-201ENST00000296504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.46■■■■■ 6.31
SAP30-201ENST00000296504 NCAPD3P42695 1498 aa54.4■■■■■ 6.3
SAP30-201ENST00000296504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.38■■■■■ 6.3
SAP30-201ENST00000296504 SMARCA2P51531 1590 aa54.29■■■■■ 6.28
SAP30-201ENST00000296504 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.14■■■■■ 6.26
SAP30-201ENST00000296504 HMGXB3Q12766 1538 aa54.1■■■■■ 6.25
SAP30-201ENST00000296504 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.06■■■■■ 6.24
SAP30-201ENST00000296504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.91■■■■■ 6.22
SAP30-201ENST00000296504 WIZO95785 1651 aa53.57■■■■■ 6.17
SAP30-201ENST00000296504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.38■■■■■ 6.14
SAP30-201ENST00000296504 NESP48681 1621 aa53.24■■■■■ 6.11
SAP30-201ENST00000296504 ERCC6Q03468 1493 aa53.14■■■■■ 6.1
SAP30-201ENST00000296504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.04■■■■■ 6.08
SAP30-201ENST00000296504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.95■■■■■ 6.07
SAP30-201ENST00000296504 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.79■■■■■ 6.04
SAP30-201ENST00000296504 CUX2O14529 1486 aa52.75■■■■■ 6.04
SAP30-201ENST00000296504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.67■■■■■ 6.02
SAP30-201ENST00000296504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.63■■■■■ 6.02
SAP30-201ENST00000296504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.51■■■■■ 6
SAP30-201ENST00000296504 CFTRP13569 1480 aa52.41■■■■■ 5.98
SAP30-201ENST00000296504 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.33■■■■■ 5.97
SAP30-201ENST00000296504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.2■■■■■ 5.95
SAP30-201ENST00000296504 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.17■■■■■ 5.94
SAP30-201ENST00000296504 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.17■■■■■ 5.94
SAP30-201ENST00000296504 PRDM2Q13029 1718 aa52.04■■■■■ 5.92
SAP30-201ENST00000296504 WDR62O43379 1518 aa52.01■■■■■ 5.92
SAP30-201ENST00000296504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.95■■■■■ 5.91
SAP30-201ENST00000296504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.77■■■■■ 5.88
SAP30-201ENST00000296504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.71■■■■■ 5.87
SAP30-201ENST00000296504 TOPBP1Q92547 1522 aa51.33■■■■■ 5.81
SAP30-201ENST00000296504 ABCC8Q09428 1581 aa51.28■■■■■ 5.8
SAP30-201ENST00000296504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.24■■■■■ 5.79
SAP30-201ENST00000296504 IFT140Q96RY7 1462 aa51.09■■■■■ 5.77
SAP30-201ENST00000296504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.91■■■■■ 5.74
SAP30-201ENST00000296504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.87■■■■■ 5.73
SAP30-201ENST00000296504 CUX1P39880 1505 aa50.82■■■■■ 5.73
SAP30-201ENST00000296504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.81■■■■■ 5.72
SAP30-201ENST00000296504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.7■■■■■ 5.71
SAP30-201ENST00000296504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.69■■■■■ 5.71
SAP30-201ENST00000296504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.67■■■■■ 5.7
SAP30-201ENST00000296504 SOGA1O94964 1423 aa50.65■■■■■ 5.7
SAP30-201ENST00000296504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.57■■■■■ 5.694e-8■■■■□ 23.2
SAP30-201ENST00000296504 OSCARQ8IYS5 282 aa50.46■■■■■ 5.67
SAP30-201ENST00000296504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.42■■■■■ 5.66
SAP30-201ENST00000296504 WDR97A6NE52 1622 aa50.36■■■■■ 5.65
SAP30-201ENST00000296504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.34■■■■■ 5.65
SAP30-201ENST00000296504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.29■■■■■ 5.64
SAP30-201ENST00000296504 TOP2BQ02880 1626 aa50.29■■■■■ 5.64
SAP30-201ENST00000296504 SYNJ1O43426 1573 aa50.26■■■■■ 5.64
SAP30-201ENST00000296504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.18■■■■■ 5.62
SAP30-201ENST00000296504 CHD1O14646 1710 aa50.16■■■■■ 5.62
SAP30-201ENST00000296504 GRIN2BQ13224 1484 aa50.1■■■■■ 5.61
SAP30-201ENST00000296504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.09■■■■■ 5.61
SAP30-201ENST00000296504 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.06■■■■■ 5.6
SAP30-201ENST00000296504 FBLN2P98095 1184 aa50.03■■■■■ 5.6
SAP30-201ENST00000296504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.03■■■■■ 5.6
SAP30-201ENST00000296504 PBRM1Q86U86 1689 aa50.02■■■■■ 5.6
SAP30-201ENST00000296504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50■■■■■ 5.59
SAP30-201ENST00000296504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.83■■■■■ 5.57
SAP30-201ENST00000296504 SYNJ2O15056 1496 aa49.82■■■■■ 5.57
SAP30-201ENST00000296504 TRIM41Q8WV44 630 aa49.77■■■■■ 5.56
SAP30-201ENST00000296504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
SAP30-201ENST00000296504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
SAP30-201ENST00000296504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
SAP30-201ENST00000296504 ARHGEF11O15085 1522 aa49.65■■■■■ 5.54
SAP30-201ENST00000296504 ADAMTS12P58397 1594 aa49.58■■■■■ 5.53
SAP30-201ENST00000296504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.57■■■■■ 5.53
SAP30-201ENST00000296504 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.57■■■■■ 5.53
SAP30-201ENST00000296504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.46■■■■■ 5.51
SAP30-201ENST00000296504 GRIN2AQ12879 1464 aa49.45■■■■■ 5.51
SAP30-201ENST00000296504 KIF27Q86VH2 1401 aa49.31■■■■■ 5.48
SAP30-201ENST00000296504 CEP170Q5SW79 1584 aa49.25■■■■■ 5.47
SAP30-201ENST00000296504 NUP160Q12769 1436 aa49.25■■■■■ 5.47
SAP30-201ENST00000296504 ARAP1Q96P48 1450 aa49.24■■■■■ 5.47
SAP30-201ENST00000296504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.21■■■■■ 5.47
SAP30-201ENST00000296504 IGF1RP08069 1367 aa49.16■■■■■ 5.46
SAP30-201ENST00000296504 CUL7Q14999 1698 aa49.07■■■■■ 5.45
SAP30-201ENST00000296504 SHROOM2Q13796 1616 aa48.94■■■■■ 5.43
SAP30-201ENST00000296504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.88■■■■■ 5.42
SAP30-201ENST00000296504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.86■■■■■ 5.41
SAP30-201ENST00000296504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.85■■■■■ 5.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms