RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588479.5

GALK1-205, Transcript of galactokinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALK1, Length 1,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK1-205ENST00000588479 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.17■■■■■ 7.7
GALK1-205ENST00000588479 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.67■■■■■ 6.5
GALK1-205ENST00000588479 ABCC9O60706 1549 aa53.91■■■■■ 6.22
GALK1-205ENST00000588479 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.8■■■■■ 6.04
GALK1-205ENST00000588479 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.75■■■■■ 6.03
GALK1-205ENST00000588479 NACADO15069 1562 aa52.11■■■■■ 5.93
GALK1-205ENST00000588479 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.11■■■■■ 5.93
GALK1-205ENST00000588479 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.02■■■■■ 5.92
GALK1-205ENST00000588479 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.93■■■■■ 5.9
GALK1-205ENST00000588479 SCRIBQ14160 1630 aa51.17■■■■■ 5.78
GALK1-205ENST00000588479 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.09■■■■■ 5.77
GALK1-205ENST00000588479 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.83■■■■■ 5.73
GALK1-205ENST00000588479 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.6■■■■■ 5.69
GALK1-205ENST00000588479 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.52■■■■■ 5.68
GALK1-205ENST00000588479 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.28■■■■■ 5.48
GALK1-205ENST00000588479 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
GALK1-205ENST00000588479 SMARCA4P51532 1647 aa48.88■■■■■ 5.42
GALK1-205ENST00000588479 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.87■■■■■ 5.41
GALK1-205ENST00000588479 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.82■■■■■ 5.41
GALK1-205ENST00000588479 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.73■■■■■ 5.39
GALK1-205ENST00000588479 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.72■■■■■ 5.39
GALK1-205ENST00000588479 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.52■■■■■ 5.36
GALK1-205ENST00000588479 WIZO95785 1651 aa48.42■■■■■ 5.34
GALK1-205ENST00000588479 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.35■■■■■ 5.33
GALK1-205ENST00000588479 SMARCA2P51531 1590 aa48.25■■■■■ 5.32
GALK1-205ENST00000588479 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.23■■■■■ 5.31
GALK1-205ENST00000588479 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
GALK1-205ENST00000588479 NCAPD3P42695 1498 aa48.09■■■■■ 5.29
GALK1-205ENST00000588479 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
GALK1-205ENST00000588479 HMGXB3Q12766 1538 aa47.94■■■■■ 5.26
GALK1-205ENST00000588479 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
GALK1-205ENST00000588479 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.29■■■■■ 5.16
GALK1-205ENST00000588479 NESP48681 1621 aa46.95■■■■■ 5.11
GALK1-205ENST00000588479 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.79■■■■■ 5.08
GALK1-205ENST00000588479 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.71■■■■■ 5.07
GALK1-205ENST00000588479 CFTRP13569 1480 aa46.69■■■■■ 5.07
GALK1-205ENST00000588479 PRDM2Q13029 1718 aa46.49■■■■■ 5.03
GALK1-205ENST00000588479 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.4■■■■■ 5.02
GALK1-205ENST00000588479 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.36■■■■■ 5.01
GALK1-205ENST00000588479 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.33■■■■■ 5.01
GALK1-205ENST00000588479 ERCC6Q03468 1493 aa46.31■■■■■ 5
GALK1-205ENST00000588479 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.17■■■■■ 4.98
GALK1-205ENST00000588479 ABCC8Q09428 1581 aa45.99■■■■■ 4.95
GALK1-205ENST00000588479 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
GALK1-205ENST00000588479 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.88■■■■■ 4.93
GALK1-205ENST00000588479 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
GALK1-205ENST00000588479 CUX1P39880 1505 aa45.73■■■■■ 4.91
GALK1-205ENST00000588479 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
GALK1-205ENST00000588479 WDR62O43379 1518 aa45.69■■■■■ 4.91
GALK1-205ENST00000588479 TOPBP1Q92547 1522 aa45.69■■■■■ 4.91
GALK1-205ENST00000588479 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.67■■■■■ 4.9
GALK1-205ENST00000588479 SYNJ1O43426 1573 aa45.66■■■■■ 4.9
GALK1-205ENST00000588479 TOP2BQ02880 1626 aa45.5■■■■■ 4.87
GALK1-205ENST00000588479 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.49■■■■■ 4.87
GALK1-205ENST00000588479 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.42■■■■■ 4.86
GALK1-205ENST00000588479 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.4■■■■■ 4.86
GALK1-205ENST00000588479 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.85
GALK1-205ENST00000588479 TRIM41Q8WV44 630 aa45.35■■■■■ 4.85
GALK1-205ENST00000588479 CUX2O14529 1486 aa45.31■■■■■ 4.84
GALK1-205ENST00000588479 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.28■■■■■ 4.84
GALK1-205ENST00000588479 SOGA1O94964 1423 aa45.19■■■■■ 4.82
GALK1-205ENST00000588479 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.81
GALK1-205ENST00000588479 IFT140Q96RY7 1462 aa45.08■■■■■ 4.81
GALK1-205ENST00000588479 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
GALK1-205ENST00000588479 WDR97A6NE52 1622 aa44.98■■■■■ 4.79
GALK1-205ENST00000588479 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
GALK1-205ENST00000588479 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.92■■■■■ 4.78
GALK1-205ENST00000588479 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.87■■■■■ 4.771e-8■■■■■ 37.4
GALK1-205ENST00000588479 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
GALK1-205ENST00000588479 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.76■■■■■ 4.76
GALK1-205ENST00000588479 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.72■■■■■ 4.75
GALK1-205ENST00000588479 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.68■■■■■ 4.74
GALK1-205ENST00000588479 KIF27Q86VH2 1401 aa44.64■■■■■ 4.74
GALK1-205ENST00000588479 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
GALK1-205ENST00000588479 PBRM1Q86U86 1689 aa44.61■■■■■ 4.73
GALK1-205ENST00000588479 GRIN2BQ13224 1484 aa44.5■■■■■ 4.71
GALK1-205ENST00000588479 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.43■■■■■ 4.7
GALK1-205ENST00000588479 IGF1RP08069 1367 aa44.38■■■■■ 4.7
GALK1-205ENST00000588479 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.37■■■■■ 4.69
GALK1-205ENST00000588479 EEA1Q15075 1411 aa44.26■■■■■ 4.68
GALK1-205ENST00000588479 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.25■■■■■ 4.67
GALK1-205ENST00000588479 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
GALK1-205ENST00000588479 ADAMTS12P58397 1594 aa44.24■■■■■ 4.67
GALK1-205ENST00000588479 FBLN2P98095 1184 aa44.23■■■■■ 4.67
GALK1-205ENST00000588479 CUL7Q14999 1698 aa44.18■■■■■ 4.66
GALK1-205ENST00000588479 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.16■■■■■ 4.66
GALK1-205ENST00000588479 CHD1O14646 1710 aa44.15■■■■■ 4.66
GALK1-205ENST00000588479 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.15■■■■■ 4.66
GALK1-205ENST00000588479 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.12■■■■■ 4.65
GALK1-205ENST00000588479 SYNJ2O15056 1496 aa44.11■■■■■ 4.65
GALK1-205ENST00000588479 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
GALK1-205ENST00000588479 PRXQ9BXM0 1461 aa44.01■■■■■ 4.64
GALK1-205ENST00000588479 GRIN2AQ12879 1464 aa43.97■■■■■ 4.63
GALK1-205ENST00000588479 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.97■■■■■ 4.63
GALK1-205ENST00000588479 KIF21BO75037 1637 aa43.87■■■■■ 4.61
GALK1-205ENST00000588479 CEP170Q5SW79 1584 aa43.8■■■■■ 4.6
GALK1-205ENST00000588479 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.71■■■■■ 4.59
GALK1-205ENST00000588479 OSCARQ8IYS5 282 aa43.7■■■■■ 4.59
GALK1-205ENST00000588479 GOLGA3Q08378 1498 aa43.7■■■■■ 4.59
GALK1-205ENST00000588479 NUP160Q12769 1436 aa43.67■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms