RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355552.7

TPRA1-202, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRA1, Length 1,933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-202ENST00000355552 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.13■■■■■ 6.9
TPRA1-202ENST00000355552 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.86■■■■■ 5.73
TPRA1-202ENST00000355552 ABCC9O60706 1549 aa48.85■■■■■ 5.41
TPRA1-202ENST00000355552 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
TPRA1-202ENST00000355552 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.36■■■■■ 5.33
TPRA1-202ENST00000355552 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.95■■■■■ 5.27
TPRA1-202ENST00000355552 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.58■■■■■ 5.21
TPRA1-202ENST00000355552 NACADO15069 1562 aa47.53■■■■■ 5.2
TPRA1-202ENST00000355552 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.29■■■■■ 5.16
TPRA1-202ENST00000355552 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.19■■■■■ 5.14
TPRA1-202ENST00000355552 SCRIBQ14160 1630 aa46.86■■■■■ 5.09
TPRA1-202ENST00000355552 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.39■■■■■ 5.02
TPRA1-202ENST00000355552 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.01■■■■■ 4.96
TPRA1-202ENST00000355552 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.99■■■■■ 4.95
TPRA1-202ENST00000355552 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.34■■■■■ 4.85
TPRA1-202ENST00000355552 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
TPRA1-202ENST00000355552 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.96■■■■■ 4.79
TPRA1-202ENST00000355552 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
TPRA1-202ENST00000355552 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
TPRA1-202ENST00000355552 SMARCA4P51532 1647 aa44.81■■■■■ 4.76
TPRA1-202ENST00000355552 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
TPRA1-202ENST00000355552 WIZO95785 1651 aa44.56■■■■■ 4.72
TPRA1-202ENST00000355552 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.25■■■■■ 4.67
TPRA1-202ENST00000355552 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.23■■■■■ 4.67
TPRA1-202ENST00000355552 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.22■■■■■ 4.67
TPRA1-202ENST00000355552 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.13■■■■■ 4.65
TPRA1-202ENST00000355552 SMARCA2P51531 1590 aa44.12■■■■■ 4.65
TPRA1-202ENST00000355552 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
TPRA1-202ENST00000355552 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
TPRA1-202ENST00000355552 NCAPD3P42695 1498 aa43.92■■■■■ 4.62
TPRA1-202ENST00000355552 HMGXB3Q12766 1538 aa43.77■■■■■ 4.6
TPRA1-202ENST00000355552 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.75■■■■■ 4.59
TPRA1-202ENST00000355552 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.61■■■■■ 4.57
TPRA1-202ENST00000355552 CFTRP13569 1480 aa42.8■■■■■ 4.44
TPRA1-202ENST00000355552 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.78■■■■■ 4.44
TPRA1-202ENST00000355552 NESP48681 1621 aa42.73■■■■■ 4.43
TPRA1-202ENST00000355552 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.6■■■■■ 4.41
TPRA1-202ENST00000355552 ABCC8Q09428 1581 aa42.55■■■■■ 4.4
TPRA1-202ENST00000355552 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.49■■■■■ 4.39
TPRA1-202ENST00000355552 TRIM41Q8WV44 630 aa42.46■■■■■ 4.39
TPRA1-202ENST00000355552 PRDM2Q13029 1718 aa42.44■■■■■ 4.38
TPRA1-202ENST00000355552 HRCP23327 699 aa42.38■■■■■ 4.37
TPRA1-202ENST00000355552 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.33■■■■■ 4.37
TPRA1-202ENST00000355552 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.29■■■■■ 4.36
TPRA1-202ENST00000355552 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
TPRA1-202ENST00000355552 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.19■■■■■ 4.35
TPRA1-202ENST00000355552 SYNJ1O43426 1573 aa42.16■■■■■ 4.34
TPRA1-202ENST00000355552 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.12■■■■■ 4.33
TPRA1-202ENST00000355552 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.09■■■■■ 4.33
TPRA1-202ENST00000355552 CUX1P39880 1505 aa42.06■■■■■ 4.32
TPRA1-202ENST00000355552 TOP2BQ02880 1626 aa41.95■■■■■ 4.31
TPRA1-202ENST00000355552 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.9■■■■■ 4.3
TPRA1-202ENST00000355552 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
TPRA1-202ENST00000355552 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
TPRA1-202ENST00000355552 ERCC6Q03468 1493 aa41.87■■■■■ 4.29
TPRA1-202ENST00000355552 TOPBP1Q92547 1522 aa41.8■■■■■ 4.28
TPRA1-202ENST00000355552 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
TPRA1-202ENST00000355552 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
TPRA1-202ENST00000355552 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.73■■■■■ 4.27
TPRA1-202ENST00000355552 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.69■■■■■ 4.26
TPRA1-202ENST00000355552 SOGA1O94964 1423 aa41.63■■■■■ 4.26
TPRA1-202ENST00000355552 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
TPRA1-202ENST00000355552 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
TPRA1-202ENST00000355552 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.55■■■■■ 4.24
TPRA1-202ENST00000355552 WDR62O43379 1518 aa41.53■■■■■ 4.24
TPRA1-202ENST00000355552 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.5■■■■■ 4.23
TPRA1-202ENST00000355552 CUX2O14529 1486 aa41.33■■■■■ 4.21
TPRA1-202ENST00000355552 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.24■■■■■ 4.19
TPRA1-202ENST00000355552 EEA1Q15075 1411 aa41.22■■■■■ 4.19
TPRA1-202ENST00000355552 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
TPRA1-202ENST00000355552 KIF27Q86VH2 1401 aa41.2■■■■■ 4.19
TPRA1-202ENST00000355552 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.2■■■■■ 4.19
TPRA1-202ENST00000355552 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.18■■■■■ 4.18
TPRA1-202ENST00000355552 WDR97A6NE52 1622 aa41.17■■■■■ 4.18
TPRA1-202ENST00000355552 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
TPRA1-202ENST00000355552 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
TPRA1-202ENST00000355552 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
TPRA1-202ENST00000355552 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
TPRA1-202ENST00000355552 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
TPRA1-202ENST00000355552 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.158e-7■■■■□ 23.8
TPRA1-202ENST00000355552 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.97■■■■■ 4.15
TPRA1-202ENST00000355552 IGF1RP08069 1367 aa40.97■■■■■ 4.15
TPRA1-202ENST00000355552 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.94■■■■■ 4.14
TPRA1-202ENST00000355552 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.91■■■■■ 4.14
TPRA1-202ENST00000355552 CEP162Q5TB80 1403 aa40.85■■■■■ 4.13
TPRA1-202ENST00000355552 PRXQ9BXM0 1461 aa40.8■■■■■ 4.12
TPRA1-202ENST00000355552 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
TPRA1-202ENST00000355552 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.78■■■■■ 4.12
TPRA1-202ENST00000355552 GOLGA3Q08378 1498 aa40.76■■■■■ 4.12
TPRA1-202ENST00000355552 KIF21BO75037 1637 aa40.76■■■■■ 4.12
TPRA1-202ENST00000355552 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.73■■■■■ 4.11
TPRA1-202ENST00000355552 PBRM1Q86U86 1689 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-202ENST00000355552 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-202ENST00000355552 GRIN2BQ13224 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
TPRA1-202ENST00000355552 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
TPRA1-202ENST00000355552 CUL7Q14999 1698 aa40.59■■■■■ 4.09
TPRA1-202ENST00000355552 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.55■■■■■ 4.08
TPRA1-202ENST00000355552 ADAMTS12P58397 1594 aa40.49■■■■■ 4.07
TPRA1-202ENST00000355552 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.46■■■■■ 4.07
TPRA1-202ENST00000355552 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
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