RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601104.1

DBP-205, Transcript of D-box binding PAR bZIP transcription factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DBP, Length 1,489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBP-205ENST00000601104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.88■■■■■ 7.98
DBP-205ENST00000601104 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.08■■■■■ 6.73
DBP-205ENST00000601104 ABCC9O60706 1549 aa54.95■■■■■ 6.39
DBP-205ENST00000601104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.25■■■■■ 6.27
DBP-205ENST00000601104 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.84■■■■■ 6.21
DBP-205ENST00000601104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.71■■■■■ 6.19
DBP-205ENST00000601104 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.54■■■■■ 6.16
DBP-205ENST00000601104 NACADO15069 1562 aa53.48■■■■■ 6.15
DBP-205ENST00000601104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.25■■■■■ 6.12
DBP-205ENST00000601104 SCRIBQ14160 1630 aa52.22■■■■■ 5.95
DBP-205ENST00000601104 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.06■■■■■ 5.92
DBP-205ENST00000601104 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.93■■■■■ 5.9
DBP-205ENST00000601104 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.69■■■■■ 5.87
DBP-205ENST00000601104 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.61■■■■■ 5.85
DBP-205ENST00000601104 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.49■■■■■ 5.67
DBP-205ENST00000601104 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.63
DBP-205ENST00000601104 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.16■■■■■ 5.62
DBP-205ENST00000601104 SMARCA4P51532 1647 aa50.06■■■■■ 5.6
DBP-205ENST00000601104 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.05■■■■■ 5.6
DBP-205ENST00000601104 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.89■■■■■ 5.58
DBP-205ENST00000601104 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.73■■■■■ 5.55
DBP-205ENST00000601104 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.64■■■■■ 5.54
DBP-205ENST00000601104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.59■■■■■ 5.53
DBP-205ENST00000601104 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.58■■■■■ 5.53
DBP-205ENST00000601104 WIZO95785 1651 aa49.52■■■■■ 5.52
DBP-205ENST00000601104 SMARCA2P51531 1590 aa49.5■■■■■ 5.51
DBP-205ENST00000601104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.5
DBP-205ENST00000601104 NCAPD3P42695 1498 aa49.42■■■■■ 5.5
DBP-205ENST00000601104 HMGXB3Q12766 1538 aa49.18■■■■■ 5.46
DBP-205ENST00000601104 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
DBP-205ENST00000601104 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
DBP-205ENST00000601104 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.53■■■■■ 5.36
DBP-205ENST00000601104 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.04■■■■■ 5.28
DBP-205ENST00000601104 CFTRP13569 1480 aa47.97■■■■■ 5.27
DBP-205ENST00000601104 NESP48681 1621 aa47.9■■■■■ 5.26
DBP-205ENST00000601104 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.85■■■■■ 5.25
DBP-205ENST00000601104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.53■■■■■ 5.2
DBP-205ENST00000601104 PRDM2Q13029 1718 aa47.51■■■■■ 5.2
DBP-205ENST00000601104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.44■■■■■ 5.18
DBP-205ENST00000601104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.26■■■■■ 5.16
DBP-205ENST00000601104 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.23■■■■■ 5.15
DBP-205ENST00000601104 ERCC6Q03468 1493 aa47.21■■■■■ 5.15
DBP-205ENST00000601104 ABCC8Q09428 1581 aa47.03■■■■■ 5.12
DBP-205ENST00000601104 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.96■■■■■ 5.11
DBP-205ENST00000601104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.11
DBP-205ENST00000601104 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
DBP-205ENST00000601104 CUX1P39880 1505 aa46.86■■■■■ 5.09
DBP-205ENST00000601104 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
DBP-205ENST00000601104 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.83■■■■■ 5.09
DBP-205ENST00000601104 TOPBP1Q92547 1522 aa46.8■■■■■ 5.08
DBP-205ENST00000601104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.79■■■■■ 5.08
DBP-205ENST00000601104 WDR62O43379 1518 aa46.76■■■■■ 5.08
DBP-205ENST00000601104 SYNJ1O43426 1573 aa46.76■■■■■ 5.08
DBP-205ENST00000601104 TOP2BQ02880 1626 aa46.7■■■■■ 5.07
DBP-205ENST00000601104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.66■■■■■ 5.06
DBP-205ENST00000601104 TRIM41Q8WV44 630 aa46.63■■■■■ 5.05
DBP-205ENST00000601104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.51■■■■■ 5.04
DBP-205ENST00000601104 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
DBP-205ENST00000601104 CUX2O14529 1486 aa46.4■■■■■ 5.02
DBP-205ENST00000601104 SOGA1O94964 1423 aa46.35■■■■■ 5.01
DBP-205ENST00000601104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.3■■■■■ 5
DBP-205ENST00000601104 IFT140Q96RY7 1462 aa46.22■■■■■ 4.99
DBP-205ENST00000601104 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
DBP-205ENST00000601104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.13■■■■■ 4.98
DBP-205ENST00000601104 WDR97A6NE52 1622 aa46.02■■■■■ 4.96
DBP-205ENST00000601104 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
DBP-205ENST00000601104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
DBP-205ENST00000601104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.88■■■■■ 4.94
DBP-205ENST00000601104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.933e-7■■■■■ 30.5
DBP-205ENST00000601104 KIF27Q86VH2 1401 aa45.87■■■■■ 4.93
DBP-205ENST00000601104 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.8■■■■■ 4.92
DBP-205ENST00000601104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.79■■■■■ 4.92
DBP-205ENST00000601104 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
DBP-205ENST00000601104 EEA1Q15075 1411 aa45.7■■■■■ 4.91
DBP-205ENST00000601104 IGF1RP08069 1367 aa45.66■■■■■ 4.9
DBP-205ENST00000601104 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
DBP-205ENST00000601104 GRIN2BQ13224 1484 aa45.63■■■■■ 4.9
DBP-205ENST00000601104 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.59■■■■■ 4.89
DBP-205ENST00000601104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.57■■■■■ 4.88
DBP-205ENST00000601104 PBRM1Q86U86 1689 aa45.52■■■■■ 4.88
DBP-205ENST00000601104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.41■■■■■ 4.86
DBP-205ENST00000601104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.85
DBP-205ENST00000601104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.38■■■■■ 4.85
DBP-205ENST00000601104 PRXQ9BXM0 1461 aa45.32■■■■■ 4.85
DBP-205ENST00000601104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.31■■■■■ 4.84
DBP-205ENST00000601104 CUL7Q14999 1698 aa45.3■■■■■ 4.84
DBP-205ENST00000601104 ADAMTS12P58397 1594 aa45.26■■■■■ 4.84
DBP-205ENST00000601104 SYNJ2O15056 1496 aa45.2■■■■■ 4.83
DBP-205ENST00000601104 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.18■■■■■ 4.82
DBP-205ENST00000601104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
DBP-205ENST00000601104 KIF21BO75037 1637 aa45.11■■■■■ 4.81
DBP-205ENST00000601104 FBLN2P98095 1184 aa45.1■■■■■ 4.81
DBP-205ENST00000601104 GRIN2AQ12879 1464 aa45.04■■■■■ 4.8
DBP-205ENST00000601104 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.96■■■■■ 4.79
DBP-205ENST00000601104 GOLGA3Q08378 1498 aa44.95■■■■■ 4.79
DBP-205ENST00000601104 CHD1O14646 1710 aa44.95■■■■■ 4.79
DBP-205ENST00000601104 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.94■■■■■ 4.78
DBP-205ENST00000601104 NUP160Q12769 1436 aa44.84■■■■■ 4.77
DBP-205ENST00000601104 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
DBP-205ENST00000601104 CEP170Q5SW79 1584 aa44.77■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms