RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528852.5

CNIH2-203, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH2, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2-203ENST00000528852 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.85■■■■■ 7.49
CNIH2-203ENST00000528852 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.23■■■■■ 6.27
CNIH2-203ENST00000528852 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
CNIH2-203ENST00000528852 ABCC9O60706 1549 aa51.5■■■■■ 5.84
CNIH2-203ENST00000528852 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.27■■■■■ 5.8
CNIH2-203ENST00000528852 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.13■■■■■ 5.78
CNIH2-203ENST00000528852 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.87■■■■■ 5.73
CNIH2-203ENST00000528852 NACADO15069 1562 aa50.64■■■■■ 5.7
CNIH2-203ENST00000528852 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.29■■■■■ 5.64
CNIH2-203ENST00000528852 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.92■■■■■ 5.58
CNIH2-203ENST00000528852 SCRIBQ14160 1630 aa49.63■■■■■ 5.53
CNIH2-203ENST00000528852 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.07■■■■■ 5.45
CNIH2-203ENST00000528852 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.62■■■■■ 5.37
CNIH2-203ENST00000528852 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.44■■■■■ 5.35
CNIH2-203ENST00000528852 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.97■■■■■ 5.27
CNIH2-203ENST00000528852 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
CNIH2-203ENST00000528852 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.86■■■■■ 5.25
CNIH2-203ENST00000528852 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
CNIH2-203ENST00000528852 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.67■■■■■ 5.22
CNIH2-203ENST00000528852 SMARCA4P51532 1647 aa47.62■■■■■ 5.21
CNIH2-203ENST00000528852 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
CNIH2-203ENST00000528852 WIZO95785 1651 aa47.24■■■■■ 5.15
CNIH2-203ENST00000528852 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.13■■■■■ 5.14
CNIH2-203ENST00000528852 SMARCA2P51531 1590 aa47.02■■■■■ 5.12
CNIH2-203ENST00000528852 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.96■■■■■ 5.11
CNIH2-203ENST00000528852 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
CNIH2-203ENST00000528852 NCAPD3P42695 1498 aa46.7■■■■■ 5.07
CNIH2-203ENST00000528852 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
CNIH2-203ENST00000528852 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.65■■■■■ 5.06
CNIH2-203ENST00000528852 HMGXB3Q12766 1538 aa46.61■■■■■ 5.05
CNIH2-203ENST00000528852 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.32■■■■■ 5.01
CNIH2-203ENST00000528852 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.72■■■■■ 4.91
CNIH2-203ENST00000528852 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.64■■■■■ 4.9
CNIH2-203ENST00000528852 CFTRP13569 1480 aa45.51■■■■■ 4.88
CNIH2-203ENST00000528852 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.46■■■■■ 4.87
CNIH2-203ENST00000528852 PRDM2Q13029 1718 aa45.25■■■■■ 4.83
CNIH2-203ENST00000528852 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.21■■■■■ 4.83
CNIH2-203ENST00000528852 TRIM41Q8WV44 630 aa45.19■■■■■ 4.82
CNIH2-203ENST00000528852 ABCC8Q09428 1581 aa45.1■■■■■ 4.81
CNIH2-203ENST00000528852 NESP48681 1621 aa45.03■■■■■ 4.8
CNIH2-203ENST00000528852 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.03■■■■■ 4.8
CNIH2-203ENST00000528852 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.92■■■■■ 4.78
CNIH2-203ENST00000528852 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.91■■■■■ 4.78
CNIH2-203ENST00000528852 SYNJ1O43426 1573 aa44.74■■■■■ 4.75
CNIH2-203ENST00000528852 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.71■■■■■ 4.75
CNIH2-203ENST00000528852 TOP2BQ02880 1626 aa44.71■■■■■ 4.75
CNIH2-203ENST00000528852 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.66■■■■■ 4.74
CNIH2-203ENST00000528852 CUX1P39880 1505 aa44.62■■■■■ 4.73
CNIH2-203ENST00000528852 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.53■■■■■ 4.72
CNIH2-203ENST00000528852 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.46■■■■■ 4.71
CNIH2-203ENST00000528852 TOPBP1Q92547 1522 aa44.36■■■■■ 4.69
CNIH2-203ENST00000528852 ERCC6Q03468 1493 aa44.32■■■■■ 4.69
CNIH2-203ENST00000528852 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.68
CNIH2-203ENST00000528852 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.29■■■■■ 4.68
CNIH2-203ENST00000528852 EEA1Q15075 1411 aa44.28■■■■■ 4.68
CNIH2-203ENST00000528852 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.24■■■■■ 4.67
CNIH2-203ENST00000528852 SOGA1O94964 1423 aa44.19■■■■■ 4.66
CNIH2-203ENST00000528852 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
CNIH2-203ENST00000528852 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
CNIH2-203ENST00000528852 WDR62O43379 1518 aa44.06■■■■■ 4.64
CNIH2-203ENST00000528852 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.99■■■■■ 4.63
CNIH2-203ENST00000528852 KIF27Q86VH2 1401 aa43.98■■■■■ 4.63
CNIH2-203ENST00000528852 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.96■■■■■ 4.63
CNIH2-203ENST00000528852 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
CNIH2-203ENST00000528852 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.9■■■■■ 4.62
CNIH2-203ENST00000528852 CUX2O14529 1486 aa43.88■■■■■ 4.62
CNIH2-203ENST00000528852 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.88■■■■■ 4.62
CNIH2-203ENST00000528852 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.77■■■■■ 4.6
CNIH2-203ENST00000528852 WDR97A6NE52 1622 aa43.73■■■■■ 4.59
CNIH2-203ENST00000528852 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
CNIH2-203ENST00000528852 IFT140Q96RY7 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
CNIH2-203ENST00000528852 KIF21BO75037 1637 aa43.6■■■■■ 4.57
CNIH2-203ENST00000528852 IGF1RP08069 1367 aa43.55■■■■■ 4.56
CNIH2-203ENST00000528852 GOLGA3Q08378 1498 aa43.54■■■■■ 4.56
CNIH2-203ENST00000528852 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.53■■■■■ 4.56
CNIH2-203ENST00000528852 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
CNIH2-203ENST00000528852 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.51■■■■■ 4.56
CNIH2-203ENST00000528852 PRXQ9BXM0 1461 aa43.5■■■■■ 4.55
CNIH2-203ENST00000528852 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.46■■■■■ 4.55
CNIH2-203ENST00000528852 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.44■■■■■ 4.55
CNIH2-203ENST00000528852 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.37■■■■■ 4.53
CNIH2-203ENST00000528852 CUL7Q14999 1698 aa43.35■■■■■ 4.53
CNIH2-203ENST00000528852 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
CNIH2-203ENST00000528852 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.34■■■■■ 4.53
CNIH2-203ENST00000528852 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.32■■■■■ 4.53
CNIH2-203ENST00000528852 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.31■■■■■ 4.52
CNIH2-203ENST00000528852 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
CNIH2-203ENST00000528852 GRIN2BQ13224 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
CNIH2-203ENST00000528852 PBRM1Q86U86 1689 aa43.25■■■■■ 4.51
CNIH2-203ENST00000528852 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
CNIH2-203ENST00000528852 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.07■■■■■ 4.49
CNIH2-203ENST00000528852 ADAMTS12P58397 1594 aa43■■■■■ 4.47
CNIH2-203ENST00000528852 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
CNIH2-203ENST00000528852 CEP162Q5TB80 1403 aa42.98■■■■■ 4.47
CNIH2-203ENST00000528852 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.96■■■■■ 4.47
CNIH2-203ENST00000528852 SYNJ2O15056 1496 aa42.79■■■■■ 4.44
CNIH2-203ENST00000528852 CLIP1P30622 1438 aa42.79■■■■■ 4.44
CNIH2-203ENST00000528852 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.73■■■■■ 4.43
CNIH2-203ENST00000528852 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
CNIH2-203ENST00000528852 GRIN2AQ12879 1464 aa42.7■■■■■ 4.43
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