RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486685.2

TSPAN33-201, Transcript of tetraspanin 33, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN33, Length 1,863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN33-201ENST00000486685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.87■■■■■ 7.01
TSPAN33-201ENST00000486685 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.11■■■■■ 5.77
TSPAN33-201ENST00000486685 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
TSPAN33-201ENST00000486685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.76■■■■■ 5.4
TSPAN33-201ENST00000486685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.27■■■■■ 5.32
TSPAN33-201ENST00000486685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
TSPAN33-201ENST00000486685 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.01■■■■■ 5.28
TSPAN33-201ENST00000486685 ABCC9O60706 1549 aa47.77■■■■■ 5.24
TSPAN33-201ENST00000486685 NACADO15069 1562 aa47.49■■■■■ 5.19
TSPAN33-201ENST00000486685 SCRIBQ14160 1630 aa46.98■■■■■ 5.11
TSPAN33-201ENST00000486685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.93■■■■■ 5.1
TSPAN33-201ENST00000486685 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
TSPAN33-201ENST00000486685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.95■■■■■ 4.95
TSPAN33-201ENST00000486685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
TSPAN33-201ENST00000486685 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.66■■■■■ 4.9
TSPAN33-201ENST00000486685 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.51■■■■■ 4.88
TSPAN33-201ENST00000486685 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.47■■■■■ 4.87
TSPAN33-201ENST00000486685 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
TSPAN33-201ENST00000486685 SMARCA4P51532 1647 aa45.13■■■■■ 4.82
TSPAN33-201ENST00000486685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.12■■■■■ 4.81
TSPAN33-201ENST00000486685 WIZO95785 1651 aa45.09■■■■■ 4.81
TSPAN33-201ENST00000486685 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.03■■■■■ 4.8
TSPAN33-201ENST00000486685 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
TSPAN33-201ENST00000486685 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.64■■■■■ 4.74
TSPAN33-201ENST00000486685 SMARCA2P51531 1590 aa44.29■■■■■ 4.68
TSPAN33-201ENST00000486685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.28■■■■■ 4.68
TSPAN33-201ENST00000486685 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.23■■■■■ 4.67
TSPAN33-201ENST00000486685 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
TSPAN33-201ENST00000486685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
TSPAN33-201ENST00000486685 TRIM41Q8WV44 630 aa43.89■■■■■ 4.62
TSPAN33-201ENST00000486685 NCAPD3P42695 1498 aa43.84■■■■■ 4.61
TSPAN33-201ENST00000486685 HMGXB3Q12766 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
TSPAN33-201ENST00000486685 ABCC8Q09428 1581 aa43.42■■■■■ 4.54
TSPAN33-201ENST00000486685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.28■■■■■ 4.52
TSPAN33-201ENST00000486685 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.25■■■■■ 4.51
TSPAN33-201ENST00000486685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.14■■■■■ 4.5
TSPAN33-201ENST00000486685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
TSPAN33-201ENST00000486685 CFTRP13569 1480 aa43■■■■■ 4.47
TSPAN33-201ENST00000486685 SYNJ1O43426 1573 aa42.93■■■■■ 4.46
TSPAN33-201ENST00000486685 EEA1Q15075 1411 aa42.86■■■■■ 4.45
TSPAN33-201ENST00000486685 PRDM2Q13029 1718 aa42.77■■■■■ 4.44
TSPAN33-201ENST00000486685 TOP2BQ02880 1626 aa42.75■■■■■ 4.43
TSPAN33-201ENST00000486685 SOGA1O94964 1423 aa42.74■■■■■ 4.43
TSPAN33-201ENST00000486685 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.73■■■■■ 4.43
TSPAN33-201ENST00000486685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.69■■■■■ 4.43
TSPAN33-201ENST00000486685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.53■■■■■ 4.4
TSPAN33-201ENST00000486685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.49■■■■■ 4.39
TSPAN33-201ENST00000486685 CUX1P39880 1505 aa42.49■■■■■ 4.39
TSPAN33-201ENST00000486685 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.31■■■■■ 4.36
TSPAN33-201ENST00000486685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.24■■■■■ 4.35
TSPAN33-201ENST00000486685 KIF21BO75037 1637 aa42.24■■■■■ 4.35
TSPAN33-201ENST00000486685 GOLGA3Q08378 1498 aa42.23■■■■■ 4.35
TSPAN33-201ENST00000486685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.23■■■■■ 4.35
TSPAN33-201ENST00000486685 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.22■■■■■ 4.35
TSPAN33-201ENST00000486685 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.2■■■■■ 4.35
TSPAN33-201ENST00000486685 NESP48681 1621 aa42.11■■■■■ 4.33
TSPAN33-201ENST00000486685 KIF27Q86VH2 1401 aa42.01■■■■■ 4.32
TSPAN33-201ENST00000486685 CEP162Q5TB80 1403 aa41.99■■■■■ 4.31
TSPAN33-201ENST00000486685 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.98■■■■■ 4.31
TSPAN33-201ENST00000486685 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.97■■■■■ 4.31
TSPAN33-201ENST00000486685 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.94■■■■■ 4.3
TSPAN33-201ENST00000486685 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
TSPAN33-201ENST00000486685 PRXQ9BXM0 1461 aa41.89■■■■■ 4.3
TSPAN33-201ENST00000486685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.89■■■■■ 4.3
TSPAN33-201ENST00000486685 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.88■■■■■ 4.3
TSPAN33-201ENST00000486685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.86■■■■■ 4.29
TSPAN33-201ENST00000486685 TOPBP1Q92547 1522 aa41.84■■■■■ 4.29
TSPAN33-201ENST00000486685 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.8■■■■■ 4.28
TSPAN33-201ENST00000486685 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
TSPAN33-201ENST00000486685 CUX2O14529 1486 aa41.75■■■■■ 4.27
TSPAN33-201ENST00000486685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
TSPAN33-201ENST00000486685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
TSPAN33-201ENST00000486685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.63■■■■■ 4.26
TSPAN33-201ENST00000486685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.61■■■■■ 4.25
TSPAN33-201ENST00000486685 IGF1RP08069 1367 aa41.59■■■■■ 4.25
TSPAN33-201ENST00000486685 CLIP1P30622 1438 aa41.55■■■■■ 4.24
TSPAN33-201ENST00000486685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.5■■■■■ 4.23
TSPAN33-201ENST00000486685 WDR97A6NE52 1622 aa41.42■■■■■ 4.22
TSPAN33-201ENST00000486685 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.37■■■■■ 4.21
TSPAN33-201ENST00000486685 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.32■■■■■ 4.2
TSPAN33-201ENST00000486685 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.29■■■■■ 4.2
TSPAN33-201ENST00000486685 CUL7Q14999 1698 aa41.23■■■■■ 4.19
TSPAN33-201ENST00000486685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.23■■■■■ 4.19
TSPAN33-201ENST00000486685 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
TSPAN33-201ENST00000486685 WDR62O43379 1518 aa41.1■■■■■ 4.17
TSPAN33-201ENST00000486685 ARAP1Q96P48 1450 aa41.1■■■■■ 4.17
TSPAN33-201ENST00000486685 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.09■■■■■ 4.17
TSPAN33-201ENST00000486685 HRCP23327 699 aa41.09■■■■■ 4.17
TSPAN33-201ENST00000486685 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
TSPAN33-201ENST00000486685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
TSPAN33-201ENST00000486685 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41■■■■■ 4.15
TSPAN33-201ENST00000486685 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
TSPAN33-201ENST00000486685 ERCC6Q03468 1493 aa40.91■■■■■ 4.14
TSPAN33-201ENST00000486685 IFT140Q96RY7 1462 aa40.91■■■■■ 4.14
TSPAN33-201ENST00000486685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
TSPAN33-201ENST00000486685 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.8■■■■■ 4.12
TSPAN33-201ENST00000486685 APLP2Q06481 763 aa40.8■■■■■ 4.12
TSPAN33-201ENST00000486685 PBRM1Q86U86 1689 aa40.8■■■■■ 4.12
TSPAN33-201ENST00000486685 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.72■■■■■ 4.11
TSPAN33-201ENST00000486685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms