RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296130.4

CLEC3B-201, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC3B, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-201ENST00000296130 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.43■■■■■ 9.03
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CLEC3B-201ENST00000296130 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.39■■■■■ 6.14
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CLEC3B-201ENST00000296130 WDR62O43379 1518 aa53.3■■■■■ 6.12
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CLEC3B-201ENST00000296130 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.62■■■■■ 5.85
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CLEC3B-201ENST00000296130 CHD1O14646 1710 aa51.21■■■■■ 5.79
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CLEC3B-201ENST00000296130 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.2■■■■■ 5.79
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CLEC3B-201ENST00000296130 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.91■■■■■ 5.74
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CLEC3B-201ENST00000296130 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.19■■■■■ 5.63
CLEC3B-201ENST00000296130 KIF27Q86VH2 1401 aa50.12■■■■■ 5.61
CLEC3B-201ENST00000296130 IGF1RP08069 1367 aa50.04■■■■■ 5.6
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CLEC3B-201ENST00000296130 SHROOM2Q13796 1616 aa49.96■■■■■ 5.59
CLEC3B-201ENST00000296130 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.94■■■■■ 5.59
CLEC3B-201ENST00000296130 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.85■■■■■ 5.57
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