RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289388.3

CATIP-201, Transcript of ciliogenesis associated TTC17 interacting protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CATIP, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATIP-201ENST00000289388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.09■■■■■ 8.33
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CATIP-201ENST00000289388 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.95■■■■■ 6.55
CATIP-201ENST00000289388 NACADO15069 1562 aa55.94■■■■■ 6.55
CATIP-201ENST00000289388 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.89■■■■■ 6.54
CATIP-201ENST00000289388 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.79■■■■■ 6.52
CATIP-201ENST00000289388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.78■■■■■ 6.52
CATIP-201ENST00000289388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.63■■■■■ 6.5
CATIP-201ENST00000289388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.58■■■■■ 6.33
CATIP-201ENST00000289388 SCRIBQ14160 1630 aa54.22■■■■■ 6.27
CATIP-201ENST00000289388 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.14■■■■■ 6.26
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CATIP-201ENST00000289388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.76■■■■■ 6.2
CATIP-201ENST00000289388 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.78■■■■■ 6.04
CATIP-201ENST00000289388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.69■■■■■ 6.03
CATIP-201ENST00000289388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.38■■■■■ 5.98
CATIP-201ENST00000289388 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.14■■■■■ 5.94
CATIP-201ENST00000289388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52■■■■■ 5.92
CATIP-201ENST00000289388 SMARCA4P51532 1647 aa51.97■■■■■ 5.91
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CATIP-201ENST00000289388 SMARCA2P51531 1590 aa51.63■■■■■ 5.86
CATIP-201ENST00000289388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.62■■■■■ 5.85
CATIP-201ENST00000289388 NCAPD3P42695 1498 aa51.6■■■■■ 5.85
CATIP-201ENST00000289388 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.54■■■■■ 5.84
CATIP-201ENST00000289388 HMGXB3Q12766 1538 aa51.38■■■■■ 5.82
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CATIP-201ENST00000289388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.2■■■■■ 5.63
CATIP-201ENST00000289388 NESP48681 1621 aa50.12■■■■■ 5.61
CATIP-201ENST00000289388 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.09■■■■■ 5.61
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CATIP-201ENST00000289388 ERCC6Q03468 1493 aa49.86■■■■■ 5.57
CATIP-201ENST00000289388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.84■■■■■ 5.57
CATIP-201ENST00000289388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.58■■■■■ 5.53
CATIP-201ENST00000289388 PRDM2Q13029 1718 aa49.54■■■■■ 5.52
CATIP-201ENST00000289388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.47■■■■■ 5.51
CATIP-201ENST00000289388 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.4■■■■■ 5.5
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CATIP-201ENST00000289388 CUX2O14529 1486 aa49.32■■■■■ 5.49
CATIP-201ENST00000289388 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.26■■■■■ 5.48
CATIP-201ENST00000289388 WDR62O43379 1518 aa49.1■■■■■ 5.45
CATIP-201ENST00000289388 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.42
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CATIP-201ENST00000289388 TOPBP1Q92547 1522 aa48.72■■■■■ 5.39
CATIP-201ENST00000289388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.72■■■■■ 5.39
CATIP-201ENST00000289388 CUX1P39880 1505 aa48.45■■■■■ 5.35
CATIP-201ENST00000289388 IFT140Q96RY7 1462 aa48.38■■■■■ 5.33
CATIP-201ENST00000289388 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
CATIP-201ENST00000289388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.28■■■■■ 5.32
CATIP-201ENST00000289388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.24■■■■■ 5.31
CATIP-201ENST00000289388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.18■■■■■ 5.3
CATIP-201ENST00000289388 TOP2BQ02880 1626 aa48.16■■■■■ 5.3
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CATIP-201ENST00000289388 SYNJ1O43426 1573 aa48.09■■■■■ 5.29
CATIP-201ENST00000289388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.05■■■■■ 5.28
CATIP-201ENST00000289388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
CATIP-201ENST00000289388 WDR97A6NE52 1622 aa47.94■■■■■ 5.26
CATIP-201ENST00000289388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
CATIP-201ENST00000289388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.84■■■■■ 5.25
CATIP-201ENST00000289388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.81■■■■■ 5.24
CATIP-201ENST00000289388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
CATIP-201ENST00000289388 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.6■■■■■ 5.21
CATIP-201ENST00000289388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.6■■■■■ 5.21
CATIP-201ENST00000289388 GRIN2BQ13224 1484 aa47.57■■■■■ 5.21
CATIP-201ENST00000289388 PBRM1Q86U86 1689 aa47.46■■■■■ 5.19
CATIP-201ENST00000289388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
CATIP-201ENST00000289388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.4■■■■■ 5.18
CATIP-201ENST00000289388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.4■■■■■ 5.18
CATIP-201ENST00000289388 TRIM41Q8WV44 630 aa47.32■■■■■ 5.17
CATIP-201ENST00000289388 OSCARQ8IYS5 282 aa47.31■■■■■ 5.16
CATIP-201ENST00000289388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.3■■■■■ 5.16
CATIP-201ENST00000289388 KIF27Q86VH2 1401 aa47.28■■■■■ 5.16
CATIP-201ENST00000289388 CHD1O14646 1710 aa47.23■■■■■ 5.15
CATIP-201ENST00000289388 SYNJ2O15056 1496 aa47.22■■■■■ 5.15
CATIP-201ENST00000289388 FBLN2P98095 1184 aa47.15■■■■■ 5.14
CATIP-201ENST00000289388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
CATIP-201ENST00000289388 ADAMTS12P58397 1594 aa47.1■■■■■ 5.13
CATIP-201ENST00000289388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.09■■■■■ 5.13
CATIP-201ENST00000289388 IGF1RP08069 1367 aa47.03■■■■■ 5.12
CATIP-201ENST00000289388 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.95■■■■■ 5.11
CATIP-201ENST00000289388 GRIN2AQ12879 1464 aa46.94■■■■■ 5.1
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CATIP-201ENST00000289388 NUP160Q12769 1436 aa46.74■■■■■ 5.07
CATIP-201ENST00000289388 EEA1Q15075 1411 aa46.65■■■■■ 5.06
CATIP-201ENST00000289388 CEP170Q5SW79 1584 aa46.65■■■■■ 5.06
CATIP-201ENST00000289388 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.53■■■■■ 5.04
CATIP-201ENST00000289388 ARHGEF11O15085 1522 aa46.48■■■■■ 5.03
CATIP-201ENST00000289388 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.47■■■■■ 5.03
CATIP-201ENST00000289388 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.45■■■■■ 5.03
CATIP-201ENST00000289388 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.45■■■■■ 5.03
CATIP-201ENST00000289388 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.45■■■■■ 5.03
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