RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395053.7

TCEA2-204, Transcript of transcription elongation factor A2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCEA2, Length 1,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2-204ENST00000395053 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.98■■■■■ 7.51
TCEA2-204ENST00000395053 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.25■■■■■ 6.28
TCEA2-204ENST00000395053 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.96■■■■■ 5.91
TCEA2-204ENST00000395053 ABCC9O60706 1549 aa51.83■■■■■ 5.89
TCEA2-204ENST00000395053 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.3■■■■■ 5.8
TCEA2-204ENST00000395053 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.21■■■■■ 5.79
TCEA2-204ENST00000395053 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.79■■■■■ 5.72
TCEA2-204ENST00000395053 NACADO15069 1562 aa50.64■■■■■ 5.7
TCEA2-204ENST00000395053 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.33■■■■■ 5.65
TCEA2-204ENST00000395053 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.2■■■■■ 5.63
TCEA2-204ENST00000395053 SCRIBQ14160 1630 aa49.86■■■■■ 5.57
TCEA2-204ENST00000395053 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.37■■■■■ 5.49
TCEA2-204ENST00000395053 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.92■■■■■ 5.42
TCEA2-204ENST00000395053 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.78■■■■■ 5.4
TCEA2-204ENST00000395053 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.25■■■■■ 5.31
TCEA2-204ENST00000395053 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
TCEA2-204ENST00000395053 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.89■■■■■ 5.26
TCEA2-204ENST00000395053 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
TCEA2-204ENST00000395053 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.86■■■■■ 5.25
TCEA2-204ENST00000395053 SMARCA4P51532 1647 aa47.75■■■■■ 5.23
TCEA2-204ENST00000395053 WIZO95785 1651 aa47.47■■■■■ 5.19
TCEA2-204ENST00000395053 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
TCEA2-204ENST00000395053 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.19■■■■■ 5.14
TCEA2-204ENST00000395053 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.11■■■■■ 5.13
TCEA2-204ENST00000395053 SMARCA2P51531 1590 aa47.01■■■■■ 5.12
TCEA2-204ENST00000395053 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
TCEA2-204ENST00000395053 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.89■■■■■ 5.1
TCEA2-204ENST00000395053 NCAPD3P42695 1498 aa46.77■■■■■ 5.08
TCEA2-204ENST00000395053 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
TCEA2-204ENST00000395053 HMGXB3Q12766 1538 aa46.65■■■■■ 5.06
TCEA2-204ENST00000395053 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.47■■■■■ 5.03
TCEA2-204ENST00000395053 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.26■■■■■ 5
TCEA2-204ENST00000395053 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.69■■■■■ 4.91
TCEA2-204ENST00000395053 CFTRP13569 1480 aa45.6■■■■■ 4.89
TCEA2-204ENST00000395053 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.54■■■■■ 4.88
TCEA2-204ENST00000395053 NESP48681 1621 aa45.37■■■■■ 4.85
TCEA2-204ENST00000395053 ABCC8Q09428 1581 aa45.33■■■■■ 4.85
TCEA2-204ENST00000395053 PRDM2Q13029 1718 aa45.29■■■■■ 4.84
TCEA2-204ENST00000395053 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.25■■■■■ 4.83
TCEA2-204ENST00000395053 TRIM41Q8WV44 630 aa45.13■■■■■ 4.82
TCEA2-204ENST00000395053 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.05■■■■■ 4.8
TCEA2-204ENST00000395053 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.04■■■■■ 4.8
TCEA2-204ENST00000395053 SYNJ1O43426 1573 aa44.94■■■■■ 4.78
TCEA2-204ENST00000395053 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.89■■■■■ 4.78
TCEA2-204ENST00000395053 CUX1P39880 1505 aa44.81■■■■■ 4.76
TCEA2-204ENST00000395053 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.78■■■■■ 4.76
TCEA2-204ENST00000395053 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.78■■■■■ 4.76
TCEA2-204ENST00000395053 TOP2BQ02880 1626 aa44.77■■■■■ 4.76
TCEA2-204ENST00000395053 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.73■■■■■ 4.75
TCEA2-204ENST00000395053 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
TCEA2-204ENST00000395053 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.53■■■■■ 4.72
TCEA2-204ENST00000395053 TOPBP1Q92547 1522 aa44.5■■■■■ 4.71
TCEA2-204ENST00000395053 ERCC6Q03468 1493 aa44.42■■■■■ 4.7
TCEA2-204ENST00000395053 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.39■■■■■ 4.7
TCEA2-204ENST00000395053 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.38■■■■■ 4.69
TCEA2-204ENST00000395053 SOGA1O94964 1423 aa44.37■■■■■ 4.69
TCEA2-204ENST00000395053 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
TCEA2-204ENST00000395053 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.27■■■■■ 4.68
TCEA2-204ENST00000395053 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
TCEA2-204ENST00000395053 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
TCEA2-204ENST00000395053 WDR62O43379 1518 aa44.19■■■■■ 4.66
TCEA2-204ENST00000395053 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.13■■■■■ 4.65
TCEA2-204ENST00000395053 EEA1Q15075 1411 aa44.06■■■■■ 4.64
TCEA2-204ENST00000395053 CUX2O14529 1486 aa43.98■■■■■ 4.63
TCEA2-204ENST00000395053 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.96■■■■■ 4.63
TCEA2-204ENST00000395053 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.95■■■■■ 4.63
TCEA2-204ENST00000395053 KIF27Q86VH2 1401 aa43.93■■■■■ 4.62
TCEA2-204ENST00000395053 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.93■■■■■ 4.62
TCEA2-204ENST00000395053 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
TCEA2-204ENST00000395053 WDR97A6NE52 1622 aa43.9■■■■■ 4.62
TCEA2-204ENST00000395053 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.75■■■■■ 4.59
TCEA2-204ENST00000395053 IFT140Q96RY7 1462 aa43.75■■■■■ 4.59
TCEA2-204ENST00000395053 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
TCEA2-204ENST00000395053 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.67■■■■■ 4.58
TCEA2-204ENST00000395053 IGF1RP08069 1367 aa43.66■■■■■ 4.58
TCEA2-204ENST00000395053 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
TCEA2-204ENST00000395053 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.58■■■■■ 4.57
TCEA2-204ENST00000395053 KIF21BO75037 1637 aa43.58■■■■■ 4.57
TCEA2-204ENST00000395053 PRXQ9BXM0 1461 aa43.56■■■■■ 4.56
TCEA2-204ENST00000395053 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.56
TCEA2-204ENST00000395053 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.48■■■■■ 4.55
TCEA2-204ENST00000395053 GOLGA3Q08378 1498 aa43.47■■■■■ 4.55
TCEA2-204ENST00000395053 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.42■■■■■ 4.54
TCEA2-204ENST00000395053 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
TCEA2-204ENST00000395053 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.4■■■■■ 4.54
TCEA2-204ENST00000395053 PBRM1Q86U86 1689 aa43.38■■■■■ 4.54
TCEA2-204ENST00000395053 CUL7Q14999 1698 aa43.32■■■■■ 4.52
TCEA2-204ENST00000395053 GRIN2BQ13224 1484 aa43.31■■■■■ 4.52
TCEA2-204ENST00000395053 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
TCEA2-204ENST00000395053 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.24■■■■■ 4.51
TCEA2-204ENST00000395053 ADAMTS12P58397 1594 aa43.13■■■■■ 4.5
TCEA2-204ENST00000395053 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.12■■■■■ 4.49
TCEA2-204ENST00000395053 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.09■■■■■ 4.49
TCEA2-204ENST00000395053 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
TCEA2-204ENST00000395053 CEP162Q5TB80 1403 aa42.99■■■■■ 4.47
TCEA2-204ENST00000395053 SYNJ2O15056 1496 aa42.85■■■■■ 4.45
TCEA2-204ENST00000395053 GRIN2AQ12879 1464 aa42.8■■■■■ 4.44
TCEA2-204ENST00000395053 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
TCEA2-204ENST00000395053 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.77■■■■■ 4.44
TCEA2-204ENST00000395053 CLIP1P30622 1438 aa42.77■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms