RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517713.5

COL13A1-210, Transcript of collagen type XIII alpha 1 chain, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene COL13A1, Length 2,007 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL13A1-210ENST00000517713 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.49■■■■■ 6.95
COL13A1-210ENST00000517713 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.61■■■■■ 5.69
COL13A1-210ENST00000517713 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
COL13A1-210ENST00000517713 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.38■■■■■ 5.34
COL13A1-210ENST00000517713 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.3■■■■■ 5.32
COL13A1-210ENST00000517713 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.28■■■■■ 5.32
COL13A1-210ENST00000517713 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.43■■■■■ 5.18
COL13A1-210ENST00000517713 ABCC9O60706 1549 aa47.42■■■■■ 5.18
COL13A1-210ENST00000517713 NACADO15069 1562 aa47■■■■■ 5.12
COL13A1-210ENST00000517713 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.1
COL13A1-210ENST00000517713 SCRIBQ14160 1630 aa46.78■■■■■ 5.08
COL13A1-210ENST00000517713 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.46■■■■■ 5.03
COL13A1-210ENST00000517713 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
COL13A1-210ENST00000517713 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.61■■■■■ 4.89
COL13A1-210ENST00000517713 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.48■■■■■ 4.87
COL13A1-210ENST00000517713 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.27■■■■■ 4.84
COL13A1-210ENST00000517713 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.18■■■■■ 4.82
COL13A1-210ENST00000517713 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
COL13A1-210ENST00000517713 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.09■■■■■ 4.81
COL13A1-210ENST00000517713 WIZO95785 1651 aa44.96■■■■■ 4.79
COL13A1-210ENST00000517713 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.92■■■■■ 4.78
COL13A1-210ENST00000517713 SMARCA4P51532 1647 aa44.83■■■■■ 4.77
COL13A1-210ENST00000517713 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
COL13A1-210ENST00000517713 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.19■■■■■ 4.66
COL13A1-210ENST00000517713 SMARCA2P51531 1590 aa44.06■■■■■ 4.64
COL13A1-210ENST00000517713 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.05■■■■■ 4.64
COL13A1-210ENST00000517713 TRIM41Q8WV44 630 aa43.97■■■■■ 4.63
COL13A1-210ENST00000517713 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
COL13A1-210ENST00000517713 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.93■■■■■ 4.62
COL13A1-210ENST00000517713 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
COL13A1-210ENST00000517713 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.56■■■■■ 4.56
COL13A1-210ENST00000517713 NCAPD3P42695 1498 aa43.4■■■■■ 4.54
COL13A1-210ENST00000517713 ABCC8Q09428 1581 aa43.38■■■■■ 4.54
COL13A1-210ENST00000517713 HMGXB3Q12766 1538 aa43.38■■■■■ 4.53
COL13A1-210ENST00000517713 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
COL13A1-210ENST00000517713 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.97■■■■■ 4.47
COL13A1-210ENST00000517713 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.89■■■■■ 4.46
COL13A1-210ENST00000517713 SYNJ1O43426 1573 aa42.78■■■■■ 4.44
COL13A1-210ENST00000517713 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.71■■■■■ 4.43
COL13A1-210ENST00000517713 SOGA1O94964 1423 aa42.71■■■■■ 4.43
COL13A1-210ENST00000517713 EEA1Q15075 1411 aa42.66■■■■■ 4.42
COL13A1-210ENST00000517713 CFTRP13569 1480 aa42.65■■■■■ 4.42
COL13A1-210ENST00000517713 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.53■■■■■ 4.4
COL13A1-210ENST00000517713 TOP2BQ02880 1626 aa42.51■■■■■ 4.4
COL13A1-210ENST00000517713 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.46■■■■■ 4.39
COL13A1-210ENST00000517713 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.44■■■■■ 4.38
COL13A1-210ENST00000517713 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
COL13A1-210ENST00000517713 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.38■■■■■ 4.38
COL13A1-210ENST00000517713 CUX1P39880 1505 aa42.27■■■■■ 4.36
COL13A1-210ENST00000517713 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.27■■■■■ 4.36
COL13A1-210ENST00000517713 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.15■■■■■ 4.34
COL13A1-210ENST00000517713 GOLGA3Q08378 1498 aa42.14■■■■■ 4.34
COL13A1-210ENST00000517713 KIF21BO75037 1637 aa42.08■■■■■ 4.33
COL13A1-210ENST00000517713 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.07■■■■■ 4.33
COL13A1-210ENST00000517713 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
COL13A1-210ENST00000517713 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
COL13A1-210ENST00000517713 CEP162Q5TB80 1403 aa42■■■■■ 4.31
COL13A1-210ENST00000517713 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.93■■■■■ 4.3
COL13A1-210ENST00000517713 NESP48681 1621 aa41.86■■■■■ 4.29
COL13A1-210ENST00000517713 KIF27Q86VH2 1401 aa41.81■■■■■ 4.28
COL13A1-210ENST00000517713 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.81■■■■■ 4.28
COL13A1-210ENST00000517713 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.79■■■■■ 4.28
COL13A1-210ENST00000517713 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.72■■■■■ 4.27
COL13A1-210ENST00000517713 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.71■■■■■ 4.27
COL13A1-210ENST00000517713 PRXQ9BXM0 1461 aa41.69■■■■■ 4.26
COL13A1-210ENST00000517713 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.66■■■■■ 4.26
COL13A1-210ENST00000517713 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.64■■■■■ 4.26
COL13A1-210ENST00000517713 CUX2O14529 1486 aa41.58■■■■■ 4.25
COL13A1-210ENST00000517713 HRCP23327 699 aa41.55■■■■■ 4.24
COL13A1-210ENST00000517713 TOPBP1Q92547 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
COL13A1-210ENST00000517713 CLIP1P30622 1438 aa41.52■■■■■ 4.24
COL13A1-210ENST00000517713 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.23
COL13A1-210ENST00000517713 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.5■■■■■ 4.23
COL13A1-210ENST00000517713 IGF1RP08069 1367 aa41.4■■■■■ 4.22
COL13A1-210ENST00000517713 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
COL13A1-210ENST00000517713 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
COL13A1-210ENST00000517713 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.33■■■■■ 4.21
COL13A1-210ENST00000517713 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.32■■■■■ 4.2
COL13A1-210ENST00000517713 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.31■■■■■ 4.2
COL13A1-210ENST00000517713 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.23■■■■■ 4.19
COL13A1-210ENST00000517713 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
COL13A1-210ENST00000517713 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.21■■■■■ 4.19
COL13A1-210ENST00000517713 WDR97A6NE52 1622 aa41.1■■■■■ 4.17
COL13A1-210ENST00000517713 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
COL13A1-210ENST00000517713 ARAP1Q96P48 1450 aa41.03■■■■■ 4.16
COL13A1-210ENST00000517713 CUL7Q14999 1698 aa40.96■■■■■ 4.15
COL13A1-210ENST00000517713 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.92■■■■■ 4.14
COL13A1-210ENST00000517713 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.92■■■■■ 4.14
COL13A1-210ENST00000517713 APLP2Q06481 763 aa40.91■■■■■ 4.14
COL13A1-210ENST00000517713 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.89■■■■■ 4.14
COL13A1-210ENST00000517713 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
COL13A1-210ENST00000517713 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
COL13A1-210ENST00000517713 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.84■■■■■ 4.13
COL13A1-210ENST00000517713 WDR62O43379 1518 aa40.67■■■■■ 4.1
COL13A1-210ENST00000517713 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
COL13A1-210ENST00000517713 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.62■■■■■ 4.09
COL13A1-210ENST00000517713 ERCC6Q03468 1493 aa40.57■■■■■ 4.08
COL13A1-210ENST00000517713 PBRM1Q86U86 1689 aa40.54■■■■■ 4.08
COL13A1-210ENST00000517713 IFT140Q96RY7 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
COL13A1-210ENST00000517713 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.49■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms