RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.08■■■■■ 6.73
TPI1-201ENST00000229270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.17■■■■■ 5.62
TPI1-201ENST00000229270 ABCC9O60706 1549 aa48.43■■■■■ 5.34
TPI1-201ENST00000229270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
TPI1-201ENST00000229270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.26■■■■■ 5.16
TPI1-201ENST00000229270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.12■■■■■ 5.13
TPI1-201ENST00000229270 NACADO15069 1562 aa46.97■■■■■ 5.11
TPI1-201ENST00000229270 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.92■■■■■ 5.1
TPI1-201ENST00000229270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.85■■■■■ 5.09
TPI1-201ENST00000229270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.74■■■■■ 5.07
TPI1-201ENST00000229270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.91■■■■■ 4.94
TPI1-201ENST00000229270 SCRIBQ14160 1630 aa45.89■■■■■ 4.94
TPI1-201ENST00000229270 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.5■■■■■ 4.87
TPI1-201ENST00000229270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.37■■■■■ 4.854e-6■□□□□ 9.3
TPI1-201ENST00000229270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
TPI1-201ENST00000229270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
TPI1-201ENST00000229270 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.29■■■■■ 4.68
TPI1-201ENST00000229270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
TPI1-201ENST00000229270 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.11■■■■■ 4.65
TPI1-201ENST00000229270 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.05■■■■■ 4.64
TPI1-201ENST00000229270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
TPI1-201ENST00000229270 SMARCA4P51532 1647 aa43.94■■■■■ 4.63
TPI1-201ENST00000229270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.85■■■■■ 4.61
TPI1-201ENST00000229270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.83■■■■■ 4.61
TPI1-201ENST00000229270 WIZO95785 1651 aa43.77■■■■■ 4.6
TPI1-201ENST00000229270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.5■■■■■ 4.55
TPI1-201ENST00000229270 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.49■■■■■ 4.55
TPI1-201ENST00000229270 SMARCA2P51531 1590 aa43.45■■■■■ 4.55
TPI1-201ENST00000229270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
TPI1-201ENST00000229270 NCAPD3P42695 1498 aa43.34■■■■■ 4.53
TPI1-201ENST00000229270 HMGXB3Q12766 1538 aa43.21■■■■■ 4.51
TPI1-201ENST00000229270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
TPI1-201ENST00000229270 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.89■■■■■ 4.46
TPI1-201ENST00000229270 HRCP23327 699 aa42.77■■■■■ 4.44
TPI1-201ENST00000229270 TRIM41Q8WV44 630 aa42.49■■■■■ 4.39
TPI1-201ENST00000229270 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.39■■■■■ 4.38
TPI1-201ENST00000229270 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.37■■■■■ 4.37
TPI1-201ENST00000229270 NESP48681 1621 aa42.16■■■■■ 4.34
TPI1-201ENST00000229270 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.11■■■■■ 4.33
TPI1-201ENST00000229270 ABCC8Q09428 1581 aa42.11■■■■■ 4.33
TPI1-201ENST00000229270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.09■■■■■ 4.33
TPI1-201ENST00000229270 CFTRP13569 1480 aa42.04■■■■■ 4.32
TPI1-201ENST00000229270 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
TPI1-201ENST00000229270 PRDM2Q13029 1718 aa41.81■■■■■ 4.28
TPI1-201ENST00000229270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
TPI1-201ENST00000229270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.74■■■■■ 4.27
TPI1-201ENST00000229270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.69■■■■■ 4.26
TPI1-201ENST00000229270 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
TPI1-201ENST00000229270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.65■■■■■ 4.26
TPI1-201ENST00000229270 ERCC6Q03468 1493 aa41.63■■■■■ 4.26
TPI1-201ENST00000229270 SYNJ1O43426 1573 aa41.63■■■■■ 4.25
TPI1-201ENST00000229270 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.52■■■■■ 4.24
TPI1-201ENST00000229270 EEA1Q15075 1411 aa41.47■■■■■ 4.23
TPI1-201ENST00000229270 TOP2BQ02880 1626 aa41.45■■■■■ 4.23
TPI1-201ENST00000229270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.43■■■■■ 4.22
TPI1-201ENST00000229270 SOGA1O94964 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
TPI1-201ENST00000229270 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
TPI1-201ENST00000229270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
TPI1-201ENST00000229270 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
TPI1-201ENST00000229270 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.31■■■■■ 4.2
TPI1-201ENST00000229270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.25■■■■■ 4.19
TPI1-201ENST00000229270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
TPI1-201ENST00000229270 CUX1P39880 1505 aa41.22■■■■■ 4.19
TPI1-201ENST00000229270 WDR62O43379 1518 aa41.19■■■■■ 4.18
TPI1-201ENST00000229270 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.15■■■■■ 4.18
TPI1-201ENST00000229270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.09■■■■■ 4.17
TPI1-201ENST00000229270 TOPBP1Q92547 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
TPI1-201ENST00000229270 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41■■■■■ 4.15
TPI1-201ENST00000229270 KIF21BO75037 1637 aa40.93■■■■■ 4.14
TPI1-201ENST00000229270 CUX2O14529 1486 aa40.92■■■■■ 4.14
TPI1-201ENST00000229270 GOLGA3Q08378 1498 aa40.89■■■■■ 4.14
TPI1-201ENST00000229270 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.88■■■■■ 4.13
TPI1-201ENST00000229270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.8■■■■■ 4.12
TPI1-201ENST00000229270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
TPI1-201ENST00000229270 KIF27Q86VH2 1401 aa40.69■■■■■ 4.1
TPI1-201ENST00000229270 CEP162Q5TB80 1403 aa40.64■■■■■ 4.1
TPI1-201ENST00000229270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.62■■■■■ 4.09
TPI1-201ENST00000229270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
TPI1-201ENST00000229270 IFT140Q96RY7 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
TPI1-201ENST00000229270 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
TPI1-201ENST00000229270 PRXQ9BXM0 1461 aa40.58■■■■■ 4.09
TPI1-201ENST00000229270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.57■■■■■ 4.08
TPI1-201ENST00000229270 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.55■■■■■ 4.08
TPI1-201ENST00000229270 WDR97A6NE52 1622 aa40.47■■■■■ 4.07
TPI1-201ENST00000229270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
TPI1-201ENST00000229270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
TPI1-201ENST00000229270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
TPI1-201ENST00000229270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
TPI1-201ENST00000229270 IGF1RP08069 1367 aa40.3■■■■■ 4.04
TPI1-201ENST00000229270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.047e-9■■■■■ 55.8
TPI1-201ENST00000229270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.24■■■■■ 4.03
TPI1-201ENST00000229270 CLIP1P30622 1438 aa40.22■■■■■ 4.03
TPI1-201ENST00000229270 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.15■■■■■ 4.02
TPI1-201ENST00000229270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.09■■■■■ 4.01
TPI1-201ENST00000229270 PBRM1Q86U86 1689 aa40.07■■■■■ 4
TPI1-201ENST00000229270 GRIN2BQ13224 1484 aa40.03■■■■■ 4
TPI1-201ENST00000229270 CUL7Q14999 1698 aa39.99■■■■□ 3.99
TPI1-201ENST00000229270 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
TPI1-201ENST00000229270 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.96■■■■□ 3.99
TPI1-201ENST00000229270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms