RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489960.5

TPRA1-209, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TPRA1, Length 1,903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-209ENST00000489960 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.03■■■■■ 6.88
TPRA1-209ENST00000489960 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.93■■■■■ 5.74
TPRA1-209ENST00000489960 ABCC9O60706 1549 aa49.04■■■■■ 5.44
TPRA1-209ENST00000489960 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
TPRA1-209ENST00000489960 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.34■■■■■ 5.33
TPRA1-209ENST00000489960 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.92■■■■■ 5.26
TPRA1-209ENST00000489960 NACADO15069 1562 aa47.67■■■■■ 5.22
TPRA1-209ENST00000489960 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.67■■■■■ 5.22
TPRA1-209ENST00000489960 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.47■■■■■ 5.19
TPRA1-209ENST00000489960 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.85■■■■■ 5.09
TPRA1-209ENST00000489960 SCRIBQ14160 1630 aa46.8■■■■■ 5.08
TPRA1-209ENST00000489960 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.46■■■■■ 5.03
TPRA1-209ENST00000489960 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.12■■■■■ 4.97
TPRA1-209ENST00000489960 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.06■■■■■ 4.96
TPRA1-209ENST00000489960 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
TPRA1-209ENST00000489960 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.2■■■■■ 4.83
TPRA1-209ENST00000489960 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
TPRA1-209ENST00000489960 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.82■■■■■ 4.77
TPRA1-209ENST00000489960 SMARCA4P51532 1647 aa44.78■■■■■ 4.76
TPRA1-209ENST00000489960 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.76
TPRA1-209ENST00000489960 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
TPRA1-209ENST00000489960 WIZO95785 1651 aa44.4■■■■■ 4.7
TPRA1-209ENST00000489960 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.31■■■■■ 4.68
TPRA1-209ENST00000489960 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
TPRA1-209ENST00000489960 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.23■■■■■ 4.67
TPRA1-209ENST00000489960 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.22■■■■■ 4.67
TPRA1-209ENST00000489960 SMARCA2P51531 1590 aa44.2■■■■■ 4.67
TPRA1-209ENST00000489960 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.06■■■■■ 4.64
TPRA1-209ENST00000489960 NCAPD3P42695 1498 aa44.02■■■■■ 4.64
TPRA1-209ENST00000489960 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
TPRA1-209ENST00000489960 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
TPRA1-209ENST00000489960 HMGXB3Q12766 1538 aa43.86■■■■■ 4.61
TPRA1-209ENST00000489960 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.47■■■■■ 4.55
TPRA1-209ENST00000489960 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.86■■■■■ 4.45
TPRA1-209ENST00000489960 CFTRP13569 1480 aa42.82■■■■■ 4.45
TPRA1-209ENST00000489960 NESP48681 1621 aa42.79■■■■■ 4.44
TPRA1-209ENST00000489960 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.64■■■■■ 4.42
TPRA1-209ENST00000489960 TRIM41Q8WV44 630 aa42.64■■■■■ 4.42
TPRA1-209ENST00000489960 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.53■■■■■ 4.4
TPRA1-209ENST00000489960 PRDM2Q13029 1718 aa42.46■■■■■ 4.39
TPRA1-209ENST00000489960 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.38■■■■■ 4.38
TPRA1-209ENST00000489960 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.38■■■■■ 4.37
TPRA1-209ENST00000489960 ABCC8Q09428 1581 aa42.3■■■■■ 4.36
TPRA1-209ENST00000489960 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.21■■■■■ 4.35
TPRA1-209ENST00000489960 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.19■■■■■ 4.34
TPRA1-209ENST00000489960 ERCC6Q03468 1493 aa42.13■■■■■ 4.33
TPRA1-209ENST00000489960 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
TPRA1-209ENST00000489960 PCGF6Q9BYE7 350 aa42■■■■■ 4.31
TPRA1-209ENST00000489960 SYNJ1O43426 1573 aa41.96■■■■■ 4.31
TPRA1-209ENST00000489960 CUX1P39880 1505 aa41.96■■■■■ 4.31
TPRA1-209ENST00000489960 HRCP23327 699 aa41.93■■■■■ 4.3
TPRA1-209ENST00000489960 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
TPRA1-209ENST00000489960 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.87■■■■■ 4.29
TPRA1-209ENST00000489960 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
TPRA1-209ENST00000489960 TOP2BQ02880 1626 aa41.83■■■■■ 4.29
TPRA1-209ENST00000489960 TOPBP1Q92547 1522 aa41.82■■■■■ 4.29
TPRA1-209ENST00000489960 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.81■■■■■ 4.28
TPRA1-209ENST00000489960 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.78■■■■■ 4.28
TPRA1-209ENST00000489960 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
TPRA1-209ENST00000489960 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
TPRA1-209ENST00000489960 WDR62O43379 1518 aa41.66■■■■■ 4.26
TPRA1-209ENST00000489960 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.64■■■■■ 4.26
TPRA1-209ENST00000489960 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.24
TPRA1-209ENST00000489960 EEA1Q15075 1411 aa41.5■■■■■ 4.23
TPRA1-209ENST00000489960 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.45■■■■■ 4.23
TPRA1-209ENST00000489960 SOGA1O94964 1423 aa41.44■■■■■ 4.22
TPRA1-209ENST00000489960 CUX2O14529 1486 aa41.39■■■■■ 4.22
TPRA1-209ENST00000489960 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
TPRA1-209ENST00000489960 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.24■■■■■ 4.19
TPRA1-209ENST00000489960 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.23■■■■■ 4.19
TPRA1-209ENST00000489960 IFT140Q96RY7 1462 aa41.22■■■■■ 4.19
TPRA1-209ENST00000489960 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.19■■■■■ 4.18
TPRA1-209ENST00000489960 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
TPRA1-209ENST00000489960 WDR97A6NE52 1622 aa41.13■■■■■ 4.17
TPRA1-209ENST00000489960 KIF27Q86VH2 1401 aa41.12■■■■■ 4.17
TPRA1-209ENST00000489960 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
TPRA1-209ENST00000489960 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.07■■■■■ 4.17
TPRA1-209ENST00000489960 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.05■■■■■ 4.16
TPRA1-209ENST00000489960 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.168e-7■■■■□ 23.8
TPRA1-209ENST00000489960 GOLGA3Q08378 1498 aa40.98■■■■■ 4.15
TPRA1-209ENST00000489960 CEP162Q5TB80 1403 aa40.96■■■■■ 4.15
TPRA1-209ENST00000489960 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.95■■■■■ 4.15
TPRA1-209ENST00000489960 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.95■■■■■ 4.15
TPRA1-209ENST00000489960 KIF21BO75037 1637 aa40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-209ENST00000489960 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
TPRA1-209ENST00000489960 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
TPRA1-209ENST00000489960 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
TPRA1-209ENST00000489960 GRIN2BQ13224 1484 aa40.75■■■■■ 4.11
TPRA1-209ENST00000489960 PBRM1Q86U86 1689 aa40.73■■■■■ 4.11
TPRA1-209ENST00000489960 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-209ENST00000489960 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TPRA1-209ENST00000489960 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.65■■■■■ 4.1
TPRA1-209ENST00000489960 PRXQ9BXM0 1461 aa40.62■■■■■ 4.09
TPRA1-209ENST00000489960 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
TPRA1-209ENST00000489960 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.59■■■■■ 4.09
TPRA1-209ENST00000489960 CUL7Q14999 1698 aa40.55■■■■■ 4.08
TPRA1-209ENST00000489960 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.53■■■■■ 4.08
TPRA1-209ENST00000489960 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
TPRA1-209ENST00000489960 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.48■■■■■ 4.07
TPRA1-209ENST00000489960 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
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