RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568218.2

AC139426.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC139426.1, Length 2,529 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC139426.1-201ENST00000568218 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.74■■■■■ 6.51
AC139426.1-201ENST00000568218 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.55■■■■■ 5.2
AC139426.1-201ENST00000568218 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.25■■■■■ 5.15
AC139426.1-201ENST00000568218 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
AC139426.1-201ENST00000568218 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.5■■■■■ 5.03
AC139426.1-201ENST00000568218 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
AC139426.1-201ENST00000568218 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.67■■■■■ 4.9
AC139426.1-201ENST00000568218 ABCC9O60706 1549 aa44.65■■■■■ 4.74
AC139426.1-201ENST00000568218 SCRIBQ14160 1630 aa44.59■■■■■ 4.73
AC139426.1-201ENST00000568218 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.53■■■■■ 4.72
AC139426.1-201ENST00000568218 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.51■■■■■ 4.72
AC139426.1-201ENST00000568218 NACADO15069 1562 aa44.12■■■■■ 4.65
AC139426.1-201ENST00000568218 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
AC139426.1-201ENST00000568218 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.59■■■■■ 4.57
AC139426.1-201ENST00000568218 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.52■■■■■ 4.56
AC139426.1-201ENST00000568218 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.35■■■■■ 4.53
AC139426.1-201ENST00000568218 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.24■■■■■ 4.51
AC139426.1-201ENST00000568218 WIZO95785 1651 aa43.08■■■■■ 4.49
AC139426.1-201ENST00000568218 TRIM41Q8WV44 630 aa42.92■■■■■ 4.46
AC139426.1-201ENST00000568218 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.89■■■■■ 4.46
AC139426.1-201ENST00000568218 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
AC139426.1-201ENST00000568218 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.42
AC139426.1-201ENST00000568218 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
AC139426.1-201ENST00000568218 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.6■■■■■ 4.41
AC139426.1-201ENST00000568218 SMARCA4P51532 1647 aa42.55■■■■■ 4.4
AC139426.1-201ENST00000568218 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.42■■■■■ 4.38
AC139426.1-201ENST00000568218 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
AC139426.1-201ENST00000568218 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.33■■■■■ 4.37
AC139426.1-201ENST00000568218 HRCP23327 699 aa42.28■■■■■ 4.36
AC139426.1-201ENST00000568218 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.21■■■■■ 4.35
AC139426.1-201ENST00000568218 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
AC139426.1-201ENST00000568218 SMARCA2P51531 1590 aa42.12■■■■■ 4.33
AC139426.1-201ENST00000568218 ABCC8Q09428 1581 aa41.95■■■■■ 4.31
AC139426.1-201ENST00000568218 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
AC139426.1-201ENST00000568218 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
AC139426.1-201ENST00000568218 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.72■■■■■ 4.27
AC139426.1-201ENST00000568218 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.61■■■■■ 4.25
AC139426.1-201ENST00000568218 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
AC139426.1-201ENST00000568218 SOGA1O94964 1423 aa41.47■■■■■ 4.23
AC139426.1-201ENST00000568218 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
AC139426.1-201ENST00000568218 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.31■■■■■ 4.2
AC139426.1-201ENST00000568218 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.2
AC139426.1-201ENST00000568218 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.16■■■■■ 4.18
AC139426.1-201ENST00000568218 SYNJ1O43426 1573 aa41.1■■■■■ 4.17
AC139426.1-201ENST00000568218 EEA1Q15075 1411 aa41.02■■■■■ 4.16
AC139426.1-201ENST00000568218 CEP162Q5TB80 1403 aa40.98■■■■■ 4.15
AC139426.1-201ENST00000568218 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
AC139426.1-201ENST00000568218 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.92■■■■■ 4.14
AC139426.1-201ENST00000568218 NCAPD3P42695 1498 aa40.88■■■■■ 4.13
AC139426.1-201ENST00000568218 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
AC139426.1-201ENST00000568218 HMGXB3Q12766 1538 aa40.78■■■■■ 4.12
AC139426.1-201ENST00000568218 GOLGA3Q08378 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
AC139426.1-201ENST00000568218 TOP2BQ02880 1626 aa40.6■■■■■ 4.09
AC139426.1-201ENST00000568218 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.6■■■■■ 4.09
AC139426.1-201ENST00000568218 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
AC139426.1-201ENST00000568218 KIF21BO75037 1637 aa40.51■■■■■ 4.08
AC139426.1-201ENST00000568218 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.47■■■■■ 4.07
AC139426.1-201ENST00000568218 MYT1Q01538 1121 aa40.44■■■■■ 4.06
AC139426.1-201ENST00000568218 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.44■■■■■ 4.06
AC139426.1-201ENST00000568218 CFTRP13569 1480 aa40.41■■■■■ 4.06
AC139426.1-201ENST00000568218 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
AC139426.1-201ENST00000568218 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
AC139426.1-201ENST00000568218 CUX1P39880 1505 aa40.38■■■■■ 4.05
AC139426.1-201ENST00000568218 CLIP1P30622 1438 aa40.33■■■■■ 4.05
AC139426.1-201ENST00000568218 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
AC139426.1-201ENST00000568218 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
AC139426.1-201ENST00000568218 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.15■■■■■ 4.02
AC139426.1-201ENST00000568218 PRXQ9BXM0 1461 aa40.09■■■■■ 4.01
AC139426.1-201ENST00000568218 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.08■■■■■ 4.01
AC139426.1-201ENST00000568218 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.06■■■■■ 4
AC139426.1-201ENST00000568218 KIF27Q86VH2 1401 aa40.03■■■■■ 4
AC139426.1-201ENST00000568218 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
AC139426.1-201ENST00000568218 PRDM2Q13029 1718 aa39.94■■■■□ 3.98
AC139426.1-201ENST00000568218 APLP2Q06481 763 aa39.87■■■■□ 3.97
AC139426.1-201ENST00000568218 CUX2O14529 1486 aa39.8■■■■□ 3.96
AC139426.1-201ENST00000568218 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
AC139426.1-201ENST00000568218 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.74■■■■□ 3.95
AC139426.1-201ENST00000568218 ARAP1Q96P48 1450 aa39.74■■■■□ 3.95
AC139426.1-201ENST00000568218 IGF1RP08069 1367 aa39.7■■■■□ 3.95
AC139426.1-201ENST00000568218 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.69■■■■□ 3.94
AC139426.1-201ENST00000568218 NESP48681 1621 aa39.65■■■■□ 3.94
AC139426.1-201ENST00000568218 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
AC139426.1-201ENST00000568218 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.51■■■■□ 3.92
AC139426.1-201ENST00000568218 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.51■■■■□ 3.91
AC139426.1-201ENST00000568218 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.49■■■■□ 3.91
AC139426.1-201ENST00000568218 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.45■■■■□ 3.91
AC139426.1-201ENST00000568218 TOPBP1Q92547 1522 aa39.38■■■■□ 3.89
AC139426.1-201ENST00000568218 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.37■■■■□ 3.89
AC139426.1-201ENST00000568218 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
AC139426.1-201ENST00000568218 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.22■■■■□ 3.87
AC139426.1-201ENST00000568218 P3H3Q8IVL6 736 aa39.18■■■■□ 3.86
AC139426.1-201ENST00000568218 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
AC139426.1-201ENST00000568218 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.17■■■■□ 3.86
AC139426.1-201ENST00000568218 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
AC139426.1-201ENST00000568218 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
AC139426.1-201ENST00000568218 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
AC139426.1-201ENST00000568218 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
AC139426.1-201ENST00000568218 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.98■■■■□ 3.83
AC139426.1-201ENST00000568218 ITGAEP38570 1179 aa38.96■■■■□ 3.83
AC139426.1-201ENST00000568218 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.95■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms