Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTPNP58546 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTPNP58546 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTPNP58546 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTPNP58546 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTPNP58546 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTPNP58546 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTPNP58546 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTPNP58546 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTPNP58546 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTPNP58546 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTPNP58546 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MTPNP58546 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTPNP58546 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTPNP58546 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTPNP58546 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTPNP58546 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTPNP58546 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTPNP58546 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MTPNP58546 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTPNP58546 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTPNP58546 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTPNP58546 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTPNP58546 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTPNP58546 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTPNP58546 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTPNP58546 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTPNP58546 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTPNP58546 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTPNP58546 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTPNP58546 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTPNP58546 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTPNP58546 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTPNP58546 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTPNP58546 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTPNP58546 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTPNP58546 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTPNP58546 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTPNP58546 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTPNP58546 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTPNP58546 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MTPNP58546 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTPNP58546 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTPNP58546 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTPNP58546 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTPNP58546 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTPNP58546 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTPNP58546 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTPNP58546 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MTPNP58546 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTPNP58546 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTPNP58546 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTPNP58546 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTPNP58546 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTPNP58546 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTPNP58546 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTPNP58546 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTPNP58546 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTPNP58546 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTPNP58546 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTPNP58546 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTPNP58546 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTPNP58546 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTPNP58546 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTPNP58546 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTPNP58546 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTPNP58546 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTPNP58546 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTPNP58546 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTPNP58546 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTPNP58546 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTPNP58546 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTPNP58546 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTPNP58546 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTPNP58546 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTPNP58546 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTPNP58546 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTPNP58546 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTPNP58546 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTPNP58546 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTPNP58546 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTPNP58546 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTPNP58546 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTPNP58546 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTPNP58546 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTPNP58546 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTPNP58546 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTPNP58546 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTPNP58546 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTPNP58546 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTPNP58546 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTPNP58546 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTPNP58546 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTPNP58546 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTPNP58546 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTPNP58546 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTPNP58546 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTPNP58546 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTPNP58546 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTPNP58546 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms