RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417295.6

SH3GL1-202, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3GL1, Length 1,404 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-202ENST00000417295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.49■■■■■ 8.72
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SH3GL1-202ENST00000417295 ABCC9O60706 1549 aa60.52■■■■■ 7.28
SH3GL1-202ENST00000417295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.18■■■■■ 6.9
SH3GL1-202ENST00000417295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.08■■■■■ 6.89
SH3GL1-202ENST00000417295 NACADO15069 1562 aa58.02■■■■■ 6.88
SH3GL1-202ENST00000417295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.88■■■■■ 6.86
SH3GL1-202ENST00000417295 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.68■■■■■ 6.82
SH3GL1-202ENST00000417295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.44■■■■■ 6.79
SH3GL1-202ENST00000417295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.69■■■■■ 6.67
SH3GL1-202ENST00000417295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.64■■■■■ 6.66
SH3GL1-202ENST00000417295 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.39■■■■■ 6.62
SH3GL1-202ENST00000417295 SCRIBQ14160 1630 aa56.37■■■■■ 6.61
SH3GL1-202ENST00000417295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.7■■■■■ 6.51
SH3GL1-202ENST00000417295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.67■■■■■ 6.5
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SH3GL1-202ENST00000417295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.67■■■■■ 6.34
SH3GL1-202ENST00000417295 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.35■■■■■ 6.29
SH3GL1-202ENST00000417295 SMARCA4P51532 1647 aa53.87■■■■■ 6.21
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SH3GL1-202ENST00000417295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.66■■■■■ 6.18
SH3GL1-202ENST00000417295 NCAPD3P42695 1498 aa53.61■■■■■ 6.17
SH3GL1-202ENST00000417295 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.6■■■■■ 6.17
SH3GL1-202ENST00000417295 SMARCA2P51531 1590 aa53.5■■■■■ 6.16
SH3GL1-202ENST00000417295 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.34■■■■■ 6.13
SH3GL1-202ENST00000417295 HMGXB3Q12766 1538 aa53.28■■■■■ 6.12
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SH3GL1-202ENST00000417295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.12■■■■■ 5.93
SH3GL1-202ENST00000417295 ERCC6Q03468 1493 aa52.11■■■■■ 5.93
SH3GL1-202ENST00000417295 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.08■■■■■ 5.93
SH3GL1-202ENST00000417295 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.84■■■■■ 5.89
SH3GL1-202ENST00000417295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.84■■■■■ 5.89
SH3GL1-202ENST00000417295 CFTRP13569 1480 aa51.75■■■■■ 5.87
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SH3GL1-202ENST00000417295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.61■■■■■ 5.85
SH3GL1-202ENST00000417295 CUX2O14529 1486 aa51.53■■■■■ 5.84
SH3GL1-202ENST00000417295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.48■■■■■ 5.83
SH3GL1-202ENST00000417295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.47■■■■■ 5.83
SH3GL1-202ENST00000417295 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.37■■■■■ 5.81
SH3GL1-202ENST00000417295 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.3■■■■■ 5.8
SH3GL1-202ENST00000417295 PRDM2Q13029 1718 aa51.11■■■■■ 5.77
SH3GL1-202ENST00000417295 WDR62O43379 1518 aa51.11■■■■■ 5.77
SH3GL1-202ENST00000417295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
SH3GL1-202ENST00000417295 TOPBP1Q92547 1522 aa50.64■■■■■ 5.7
SH3GL1-202ENST00000417295 ABCC8Q09428 1581 aa50.55■■■■■ 5.68
SH3GL1-202ENST00000417295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.52■■■■■ 5.68
SH3GL1-202ENST00000417295 IFT140Q96RY7 1462 aa50.3■■■■■ 5.64
SH3GL1-202ENST00000417295 CUX1P39880 1505 aa50.27■■■■■ 5.64
SH3GL1-202ENST00000417295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.22■■■■■ 5.63
SH3GL1-202ENST00000417295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.15■■■■■ 5.62
SH3GL1-202ENST00000417295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.09■■■■■ 5.61
SH3GL1-202ENST00000417295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.06■■■■■ 5.6
SH3GL1-202ENST00000417295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.05■■■■■ 5.6
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SH3GL1-202ENST00000417295 SOGA1O94964 1423 aa50.03■■■■■ 5.6
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SH3GL1-202ENST00000417295 SYNJ1O43426 1573 aa49.8■■■■■ 5.56
SH3GL1-202ENST00000417295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
SH3GL1-202ENST00000417295 TOP2BQ02880 1626 aa49.77■■■■■ 5.56
SH3GL1-202ENST00000417295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.72■■■■■ 5.55
SH3GL1-202ENST00000417295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.59■■■■■ 5.53
SH3GL1-202ENST00000417295 WDR97A6NE52 1622 aa49.56■■■■■ 5.52
SH3GL1-202ENST00000417295 OSCARQ8IYS5 282 aa49.48■■■■■ 5.51
SH3GL1-202ENST00000417295 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.42■■■■■ 5.5
SH3GL1-202ENST00000417295 GRIN2BQ13224 1484 aa49.41■■■■■ 5.5
SH3GL1-202ENST00000417295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.37■■■■■ 5.49
SH3GL1-202ENST00000417295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.34■■■■■ 5.49
SH3GL1-202ENST00000417295 FBLN2P98095 1184 aa49.29■■■■■ 5.48
SH3GL1-202ENST00000417295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.25■■■■■ 5.47
SH3GL1-202ENST00000417295 PBRM1Q86U86 1689 aa49.19■■■■■ 5.46
SH3GL1-202ENST00000417295 CHD1O14646 1710 aa49.16■■■■■ 5.46
SH3GL1-202ENST00000417295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.13■■■■■ 5.46
SH3GL1-202ENST00000417295 SYNJ2O15056 1496 aa49.08■■■■■ 5.45
SH3GL1-202ENST00000417295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.96■■■■■ 5.43
SH3GL1-202ENST00000417295 ADAMTS12P58397 1594 aa48.88■■■■■ 5.42
SH3GL1-202ENST00000417295 KIF27Q86VH2 1401 aa48.88■■■■■ 5.42
SH3GL1-202ENST00000417295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.85■■■■■ 5.41
SH3GL1-202ENST00000417295 TRIM41Q8WV44 630 aa48.8■■■■■ 5.4
SH3GL1-202ENST00000417295 GRIN2AQ12879 1464 aa48.77■■■■■ 5.4
SH3GL1-202ENST00000417295 IGF1RP08069 1367 aa48.76■■■■■ 5.4
SH3GL1-202ENST00000417295 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.71■■■■■ 5.39
SH3GL1-202ENST00000417295 ARHGEF11O15085 1522 aa48.64■■■■■ 5.38
SH3GL1-202ENST00000417295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.6■■■■■ 5.37
SH3GL1-202ENST00000417295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.6■■■■■ 5.37
SH3GL1-202ENST00000417295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.6■■■■■ 5.37
SH3GL1-202ENST00000417295 NUP160Q12769 1436 aa48.58■■■■■ 5.37
SH3GL1-202ENST00000417295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.53■■■■■ 5.36
SH3GL1-202ENST00000417295 CEP170Q5SW79 1584 aa48.53■■■■■ 5.36
SH3GL1-202ENST00000417295 CUL7Q14999 1698 aa48.45■■■■■ 5.35
SH3GL1-202ENST00000417295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.44■■■■■ 5.34
SH3GL1-202ENST00000417295 ARAP1Q96P48 1450 aa48.28■■■■■ 5.32
SH3GL1-202ENST00000417295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.27■■■■■ 5.32
SH3GL1-202ENST00000417295 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.25■■■■■ 5.32
SH3GL1-202ENST00000417295 JPH4Q96JJ6 628 aa48.14■■■■■ 5.3
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