RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335071.3

FOXE3-201, Transcript of forkhead box E3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXE3, Length 1,981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3-201ENST00000335071 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.21■■■■■ 6.91
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FOXE3-201ENST00000335071 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.12■■■■■ 5.29
FOXE3-201ENST00000335071 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.97■■■■■ 5.27
FOXE3-201ENST00000335071 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.84■■■■■ 5.25
FOXE3-201ENST00000335071 ABCC9O60706 1549 aa47.38■■■■■ 5.18
FOXE3-201ENST00000335071 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.38■■■■■ 5.18
FOXE3-201ENST00000335071 NACADO15069 1562 aa46.95■■■■■ 5.11
FOXE3-201ENST00000335071 SCRIBQ14160 1630 aa46.53■■■■■ 5.04
FOXE3-201ENST00000335071 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.43■■■■■ 5.02
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FOXE3-201ENST00000335071 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.2■■■■■ 4.83
FOXE3-201ENST00000335071 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.02■■■■■ 4.8
FOXE3-201ENST00000335071 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.99■■■■■ 4.79
FOXE3-201ENST00000335071 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
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FOXE3-201ENST00000335071 WIZO95785 1651 aa44.64■■■■■ 4.74
FOXE3-201ENST00000335071 SMARCA4P51532 1647 aa44.63■■■■■ 4.74
FOXE3-201ENST00000335071 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.56■■■■■ 4.72
FOXE3-201ENST00000335071 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.67
FOXE3-201ENST00000335071 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.07■■■■■ 4.65
FOXE3-201ENST00000335071 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.81■■■■■ 4.6
FOXE3-201ENST00000335071 SMARCA2P51531 1590 aa43.79■■■■■ 4.6
FOXE3-201ENST00000335071 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.77■■■■■ 4.6
FOXE3-201ENST00000335071 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
FOXE3-201ENST00000335071 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
FOXE3-201ENST00000335071 TRIM41Q8WV44 630 aa43.49■■■■■ 4.55
FOXE3-201ENST00000335071 NCAPD3P42695 1498 aa43.35■■■■■ 4.53
FOXE3-201ENST00000335071 HMGXB3Q12766 1538 aa43.31■■■■■ 4.52
FOXE3-201ENST00000335071 ABCC8Q09428 1581 aa42.98■■■■■ 4.47
FOXE3-201ENST00000335071 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.87■■■■■ 4.45
FOXE3-201ENST00000335071 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.87■■■■■ 4.45
FOXE3-201ENST00000335071 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
FOXE3-201ENST00000335071 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.42
FOXE3-201ENST00000335071 CFTRP13569 1480 aa42.52■■■■■ 4.4
FOXE3-201ENST00000335071 SYNJ1O43426 1573 aa42.46■■■■■ 4.39
FOXE3-201ENST00000335071 EEA1Q15075 1411 aa42.33■■■■■ 4.37
FOXE3-201ENST00000335071 SOGA1O94964 1423 aa42.3■■■■■ 4.36
FOXE3-201ENST00000335071 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.29■■■■■ 4.36
FOXE3-201ENST00000335071 PRDM2Q13029 1718 aa42.27■■■■■ 4.36
FOXE3-201ENST00000335071 TOP2BQ02880 1626 aa42.25■■■■■ 4.35
FOXE3-201ENST00000335071 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.18■■■■■ 4.34
FOXE3-201ENST00000335071 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.11■■■■■ 4.33
FOXE3-201ENST00000335071 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.08■■■■■ 4.33
FOXE3-201ENST00000335071 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.07■■■■■ 4.32
FOXE3-201ENST00000335071 CUX1P39880 1505 aa42.03■■■■■ 4.32
FOXE3-201ENST00000335071 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.81■■■■■ 4.28
FOXE3-201ENST00000335071 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.78■■■■■ 4.28
FOXE3-201ENST00000335071 GOLGA3Q08378 1498 aa41.76■■■■■ 4.28
FOXE3-201ENST00000335071 NESP48681 1621 aa41.74■■■■■ 4.27
FOXE3-201ENST00000335071 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.73■■■■■ 4.27
FOXE3-201ENST00000335071 KIF21BO75037 1637 aa41.72■■■■■ 4.27
FOXE3-201ENST00000335071 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.71■■■■■ 4.27
FOXE3-201ENST00000335071 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.67■■■■■ 4.26
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FOXE3-201ENST00000335071 KIF27Q86VH2 1401 aa41.57■■■■■ 4.24
FOXE3-201ENST00000335071 CEP162Q5TB80 1403 aa41.52■■■■■ 4.24
FOXE3-201ENST00000335071 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.51■■■■■ 4.24
FOXE3-201ENST00000335071 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.51■■■■■ 4.24
FOXE3-201ENST00000335071 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.47■■■■■ 4.23
FOXE3-201ENST00000335071 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.45■■■■■ 4.23
FOXE3-201ENST00000335071 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.42■■■■■ 4.22
FOXE3-201ENST00000335071 TOPBP1Q92547 1522 aa41.41■■■■■ 4.22
FOXE3-201ENST00000335071 PRXQ9BXM0 1461 aa41.4■■■■■ 4.22
FOXE3-201ENST00000335071 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.37■■■■■ 4.21
FOXE3-201ENST00000335071 CUX2O14529 1486 aa41.34■■■■■ 4.21
FOXE3-201ENST00000335071 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
FOXE3-201ENST00000335071 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
FOXE3-201ENST00000335071 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
FOXE3-201ENST00000335071 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.21■■■■■ 4.19
FOXE3-201ENST00000335071 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.16■■■■■ 4.18
FOXE3-201ENST00000335071 IGF1RP08069 1367 aa41.15■■■■■ 4.18
FOXE3-201ENST00000335071 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.12■■■■■ 4.17
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FOXE3-201ENST00000335071 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.96■■■■■ 4.15
FOXE3-201ENST00000335071 WDR97A6NE52 1622 aa40.94■■■■■ 4.14
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FOXE3-201ENST00000335071 ERCC6Q03468 1493 aa40.58■■■■■ 4.09
FOXE3-201ENST00000335071 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.55■■■■■ 4.08
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FOXE3-201ENST00000335071 APLP2Q06481 763 aa40.46■■■■■ 4.07
FOXE3-201ENST00000335071 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
FOXE3-201ENST00000335071 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
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FOXE3-201ENST00000335071 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
FOXE3-201ENST00000335071 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.35■■■■■ 4.05
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