RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.15■■■■■ 7.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.04■■■■■ 6.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC9O60706 1549 aa52.86■■■■■ 6.05
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.2■■■■■ 5.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.99■■■■■ 5.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NACADO15069 1562 aa50.77■■■■■ 5.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.75■■■■■ 5.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.49■■■■■ 5.67
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.44■■■■■ 5.67
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.78■■■■■ 5.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SCRIBQ14160 1630 aa49.58■■■■■ 5.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.56■■■■■ 5.52
CAPNS1-201ENST00000246533 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.38■■■■■ 5.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.79■■■■■ 5.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.38■■■■■ 5.34
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.77■■■■■ 5.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.74■■■■■ 5.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCA4P51532 1647 aa47.37■■■■■ 5.17
CAPNS1-201ENST00000246533 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.24■■■■■ 5.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.05■■■■■ 5.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NCAPD3P42695 1498 aa46.91■■■■■ 5.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCA2P51531 1590 aa46.88■■■■■ 5.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.81■■■■■ 5.08
CAPNS1-201ENST00000246533 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
CAPNS1-201ENST00000246533 WIZO95785 1651 aa46.76■■■■■ 5.08
CAPNS1-201ENST00000246533 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.65■■■■■ 5.06
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGXB3Q12766 1538 aa46.65■■■■■ 5.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
CAPNS1-201ENST00000246533 NESP48681 1621 aa45.9■■■■■ 4.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.71■■■■■ 4.91
CAPNS1-201ENST00000246533 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.61■■■■■ 4.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.56■■■■■ 4.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ERCC6Q03468 1493 aa45.41■■■■■ 4.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CFTRP13569 1480 aa45.4■■■■■ 4.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.26■■■■■ 4.84
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.25■■■■■ 4.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.1■■■■■ 4.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM2Q13029 1718 aa44.98■■■■■ 4.79
CAPNS1-201ENST00000246533 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.96■■■■■ 4.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.81■■■■■ 4.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CUX2O14529 1486 aa44.69■■■■■ 4.74
CAPNS1-201ENST00000246533 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR62O43379 1518 aa44.65■■■■■ 4.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TOPBP1Q92547 1522 aa44.42■■■■■ 4.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.33■■■■■ 4.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CUX1P39880 1505 aa44.26■■■■■ 4.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC8Q09428 1581 aa44.25■■■■■ 4.67
CAPNS1-201ENST00000246533 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
CAPNS1-201ENST00000246533 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.06■■■■■ 4.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.03■■■■■ 4.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNJ1O43426 1573 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.99■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT140Q96RY7 1462 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SOGA1O94964 1423 aa43.91■■■■■ 4.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TOP2BQ02880 1626 aa43.88■■■■■ 4.62
CAPNS1-201ENST00000246533 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.85■■■■■ 4.61
CAPNS1-201ENST00000246533 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.74■■■■■ 4.598e-9■□□□□ 10.5
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CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR97A6NE52 1622 aa43.59■■■■■ 4.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.55■■■■■ 4.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.38■■■■■ 4.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.36■■■■■ 4.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM41Q8WV44 630 aa43.32■■■■■ 4.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIN2BQ13224 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.25■■■■■ 4.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PBRM1Q86U86 1689 aa43.24■■■■■ 4.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FBLN2P98095 1184 aa43.17■■■■■ 4.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.1■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.1■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD1O14646 1710 aa43.07■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF27Q86VH2 1401 aa43.05■■■■■ 4.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OSCARQ8IYS5 282 aa43.04■■■■■ 4.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.04■■■■■ 4.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.99■■■■■ 4.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNJ2O15056 1496 aa42.96■■■■■ 4.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IGF1RP08069 1367 aa42.95■■■■■ 4.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS12P58397 1594 aa42.91■■■■■ 4.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.84■■■■■ 4.45
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIN2AQ12879 1464 aa42.76■■■■■ 4.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.67■■■■■ 4.42
CAPNS1-201ENST00000246533 CUL7Q14999 1698 aa42.63■■■■■ 4.42
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP170Q5SW79 1584 aa42.59■■■■■ 4.41
CAPNS1-201ENST00000246533 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.56■■■■■ 4.4
CAPNS1-201ENST00000246533 HRCP23327 699 aa42.56■■■■■ 4.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP160Q12769 1436 aa42.54■■■■■ 4.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.46■■■■■ 4.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.4■■■■■ 4.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PRXQ9BXM0 1461 aa42.37■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF11O15085 1522 aa42.35■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 EEA1Q15075 1411 aa42.34■■■■■ 4.37
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