RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 NISCHQ9Y2I1 1504 aa76.33■■■■■ 9.81
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa68.58■■■■■ 8.57
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC9O60706 1549 aa68.48■■■■■ 8.55
ALYREF-202ENST00000505490 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa65.25■■■■■ 8.04
ALYREF-202ENST00000505490 NACADO15069 1562 aa64.84■■■■■ 7.97
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJC5BQ9UF47 199 aa64.44■■■■■ 7.91
ALYREF-202ENST00000505490 DCAF8L2P0C7V8 631 aa64.11■■■■■ 7.85
ALYREF-202ENST00000505490 MYO15BQ96JP2 1530 aa64.05■■■■■ 7.84
ALYREF-202ENST00000505490 UNC13AQ9UPW8 1703 aa63.83■■■■■ 7.81
ALYREF-202ENST00000505490 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP63.7■■■■■ 7.79
ALYREF-202ENST00000505490 BICRAQ9NZM4 1560 aa63.45■■■■■ 7.75
ALYREF-202ENST00000505490 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP63.26■■■■■ 7.72
ALYREF-202ENST00000505490 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa63.16■■■■■ 7.7
ALYREF-202ENST00000505490 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa62.64■■■■■ 7.62
ALYREF-202ENST00000505490 SCRIBQ14160 1630 aa62.3■■■■■ 7.56
ALYREF-202ENST00000505490 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa61.96■■■■■ 7.51
ALYREF-202ENST00000505490 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP61.83■■■■■ 7.49
ALYREF-202ENST00000505490 CECR2Q9BXF3 1484 aa61.76■■■■■ 7.48
ALYREF-202ENST00000505490 NCAPD3P42695 1498 aa59.89■■■■■ 7.18
ALYREF-202ENST00000505490 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa59.64■■■■■ 7.14
ALYREF-202ENST00000505490 SMARCA4P51532 1647 aa59.54■■■■■ 7.12
ALYREF-202ENST00000505490 SMARCA2P51531 1590 aa59.46■■■■■ 7.11
ALYREF-202ENST00000505490 HMGXB3Q12766 1538 aa59.43■■■■■ 7.1
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa59.27■■■■■ 7.08
ALYREF-202ENST00000505490 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP59.22■■■■■ 7.07
ALYREF-202ENST00000505490 CUX2O14529 1486 aa59.2■■■■■ 7.07
ALYREF-202ENST00000505490 PEG3Q9GZU2 1588 aa59.1■■■■■ 7.05
ALYREF-202ENST00000505490 ERCC6Q03468 1493 aa59.09■■■■■ 7.05
ALYREF-202ENST00000505490 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP58.97■■■■■ 7.03
ALYREF-202ENST00000505490 NESP48681 1621 aa58.85■■■■■ 7.01
ALYREF-202ENST00000505490 MROH2BQ7Z745 1585 aa58.77■■■■■ 7
ALYREF-202ENST00000505490 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa58.51■■■■■ 6.96
ALYREF-202ENST00000505490 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP58.37■■■■■ 6.94
ALYREF-202ENST00000505490 PDS5BQ9NTI5 1447 aa58.12■■■■■ 6.89
ALYREF-202ENST00000505490 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa58.12■■■■■ 6.89
ALYREF-202ENST00000505490 WIZO95785 1651 aa58.03■■■■■ 6.88
ALYREF-202ENST00000505490 CADPSQ9ULU8 1353 aa58■■■■■ 6.88
ALYREF-202ENST00000505490 MRC2Q9UBG0 1479 aa57.63■■■■■ 6.82
ALYREF-202ENST00000505490 WDR62O43379 1518 aa57.56■■■■■ 6.81
ALYREF-202ENST00000505490 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.53■■■■■ 6.8
ALYREF-202ENST00000505490 CFTRP13569 1480 aa57.36■■■■■ 6.77
ALYREF-202ENST00000505490 CEP164Q9UPV0 1460 aa57.35■■■■■ 6.77
ALYREF-202ENST00000505490 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP57.34■■■■■ 6.77
ALYREF-202ENST00000505490 FANCD2Q9BXW9 1451 aa57.29■■■■■ 6.76
ALYREF-202ENST00000505490 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP56.87■■■■■ 6.69
ALYREF-202ENST00000505490 PRDM2Q13029 1718 aa56.77■■■■■ 6.68
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.67■■■■■ 6.66
ALYREF-202ENST00000505490 OSCARQ8IYS5 282 aa56.39■■■■■ 6.62
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM41Q8WV44 630 aa56.36■■■■■ 6.61
ALYREF-202ENST00000505490 IFT140Q96RY7 1462 aa56.26■■■■■ 6.6
ALYREF-202ENST00000505490 TOPBP1Q92547 1522 aa56.23■■■■■ 6.59
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP56.15■■■■■ 6.58
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC8Q09428 1581 aa56.13■■■■■ 6.58
ALYREF-202ENST00000505490 DNMBPQ6XZF7 1577 aa56.02■■■■■ 6.56
ALYREF-202ENST00000505490 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP55.84■■■■■ 6.53
ALYREF-202ENST00000505490 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP55.8■■■■■ 6.52
ALYREF-202ENST00000505490 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa55.71■■■■■ 6.51
ALYREF-202ENST00000505490 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa55.71■■■■■ 6.51
ALYREF-202ENST00000505490 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa55.71■■■■■ 6.51
ALYREF-202ENST00000505490 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP55.65■■■■■ 6.5
ALYREF-202ENST00000505490 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP55.6■■■■■ 6.491e-7■■■■■ 34
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGEF11O15085 1522 aa55.53■■■■■ 6.48
ALYREF-202ENST00000505490 CHD1O14646 1710 aa55.43■■■■■ 6.46
ALYREF-202ENST00000505490 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa55.39■■■■■ 6.46
ALYREF-202ENST00000505490 SOGA1O94964 1423 aa55.35■■■■■ 6.45
ALYREF-202ENST00000505490 WDR97A6NE52 1622 aa55.27■■■■■ 6.44
ALYREF-202ENST00000505490 FGD5Q6ZNL6 1462 aa55.25■■■■■ 6.44
ALYREF-202ENST00000505490 CUX1P39880 1505 aa55.23■■■■■ 6.43
ALYREF-202ENST00000505490 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP55.21■■■■■ 6.43
ALYREF-202ENST00000505490 FBLN2P98095 1184 aa55.07■■■■■ 6.41
ALYREF-202ENST00000505490 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa55.03■■■■■ 6.4
ALYREF-202ENST00000505490 CYB5RLQ6IPT4 315 aa55■■■■■ 6.4
ALYREF-202ENST00000505490 ARAP1Q96P48 1450 aa54.99■■■■■ 6.39
ALYREF-202ENST00000505490 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP54.96■■■■■ 6.39
ALYREF-202ENST00000505490 GRIN2BQ13224 1484 aa54.91■■■■■ 6.38
ALYREF-202ENST00000505490 CLASP1Q7Z460 1538 aa54.89■■■■■ 6.38
ALYREF-202ENST00000505490 SYNJ2O15056 1496 aa54.76■■■■■ 6.36
ALYREF-202ENST00000505490 SYNJ1O43426 1573 aa54.76■■■■■ 6.36
ALYREF-202ENST00000505490 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP54.75■■■■■ 6.36
ALYREF-202ENST00000505490 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa54.7■■■■■ 6.35
ALYREF-202ENST00000505490 GAPVD1Q14C86 1478 aa54.69■■■■■ 6.35
ALYREF-202ENST00000505490 PBRM1Q86U86 1689 aa54.68■■■■■ 6.34
ALYREF-202ENST00000505490 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.63■■■■■ 6.34
ALYREF-202ENST00000505490 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa54.62■■■■■ 6.34
ALYREF-202ENST00000505490 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.37■■■■■ 6.29
ALYREF-202ENST00000505490 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.36■■■■■ 6.29
ALYREF-202ENST00000505490 TOP2BQ02880 1626 aa54.34■■■■■ 6.29
ALYREF-202ENST00000505490 TRHP20396 242 aaPredicted RBP54.31■■■■■ 6.28
ALYREF-202ENST00000505490 GRIN2AQ12879 1464 aa54.21■■■■■ 6.27
ALYREF-202ENST00000505490 ADAMTS12P58397 1594 aa54.18■■■■■ 6.26
ALYREF-202ENST00000505490 NUP160Q12769 1436 aa54.1■■■■■ 6.25
ALYREF-202ENST00000505490 CEP170Q5SW79 1584 aa54.04■■■■■ 6.24
ALYREF-202ENST00000505490 FHAD1B1AJZ9 1412 aa54.02■■■■■ 6.24
ALYREF-202ENST00000505490 ERICH3Q5RHP9 1530 aa54■■■■■ 6.24
ALYREF-202ENST00000505490 ERCC6L2Q5T890 1561 aa53.95■■■■■ 6.23
ALYREF-202ENST00000505490 SHROOM2Q13796 1616 aa53.9■■■■■ 6.22
ALYREF-202ENST00000505490 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP53.47■■■■■ 6.15
ALYREF-202ENST00000505490 JPH4Q96JJ6 628 aa53.44■■■■■ 6.15
ALYREF-202ENST00000505490 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53.43■■■■■ 6.14
ALYREF-202ENST00000505490 IGF1RP08069 1367 aa53.26■■■■■ 6.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms