RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.04■■■■■ 6.88
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.34■■■■■ 5.65
FOXQ1-201ENST00000296839 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.41
FOXQ1-201ENST00000296839 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.94■■■■■ 5.27
FOXQ1-201ENST00000296839 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.83■■■■■ 5.25
FOXQ1-201ENST00000296839 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.79■■■■■ 5.24
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCC9O60706 1549 aa47.15■■■■■ 5.14
FOXQ1-201ENST00000296839 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.14■■■■■ 5.14
FOXQ1-201ENST00000296839 NACADO15069 1562 aa46.73■■■■■ 5.07
FOXQ1-201ENST00000296839 SCRIBQ14160 1630 aa46.45■■■■■ 5.03
FOXQ1-201ENST00000296839 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
FOXQ1-201ENST00000296839 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.21■■■■■ 4.99
FOXQ1-201ENST00000296839 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.44■■■■■ 4.86
FOXQ1-201ENST00000296839 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
FOXQ1-201ENST00000296839 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.11■■■■■ 4.81
FOXQ1-201ENST00000296839 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.91■■■■■ 4.78
FOXQ1-201ENST00000296839 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.88■■■■■ 4.77
FOXQ1-201ENST00000296839 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
FOXQ1-201ENST00000296839 WIZO95785 1651 aa44.61■■■■■ 4.73
FOXQ1-201ENST00000296839 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.59■■■■■ 4.73
FOXQ1-201ENST00000296839 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.57■■■■■ 4.73
FOXQ1-201ENST00000296839 SMARCA4P51532 1647 aa44.53■■■■■ 4.72
FOXQ1-201ENST00000296839 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
FOXQ1-201ENST00000296839 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.92■■■■■ 4.62
FOXQ1-201ENST00000296839 SMARCA2P51531 1590 aa43.73■■■■■ 4.59
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.67■■■■■ 4.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.63■■■■■ 4.57
FOXQ1-201ENST00000296839 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
FOXQ1-201ENST00000296839 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
FOXQ1-201ENST00000296839 TRIM41Q8WV44 630 aa43.41■■■■■ 4.54
FOXQ1-201ENST00000296839 NCAPD3P42695 1498 aa43.13■■■■■ 4.49
FOXQ1-201ENST00000296839 HMGXB3Q12766 1538 aa43.13■■■■■ 4.49
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCC8Q09428 1581 aa42.99■■■■■ 4.47
FOXQ1-201ENST00000296839 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.93■■■■■ 4.46
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
FOXQ1-201ENST00000296839 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.69■■■■■ 4.42
FOXQ1-201ENST00000296839 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.56■■■■■ 4.4
FOXQ1-201ENST00000296839 SYNJ1O43426 1573 aa42.43■■■■■ 4.38
FOXQ1-201ENST00000296839 CFTRP13569 1480 aa42.34■■■■■ 4.37
FOXQ1-201ENST00000296839 SOGA1O94964 1423 aa42.27■■■■■ 4.36
FOXQ1-201ENST00000296839 PRDM2Q13029 1718 aa42.24■■■■■ 4.35
FOXQ1-201ENST00000296839 EEA1Q15075 1411 aa42.21■■■■■ 4.35
FOXQ1-201ENST00000296839 TOP2BQ02880 1626 aa42.18■■■■■ 4.34
FOXQ1-201ENST00000296839 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.14■■■■■ 4.34
FOXQ1-201ENST00000296839 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.12■■■■■ 4.33
FOXQ1-201ENST00000296839 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.11■■■■■ 4.33
FOXQ1-201ENST00000296839 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.07■■■■■ 4.33
FOXQ1-201ENST00000296839 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.96■■■■■ 4.31
FOXQ1-201ENST00000296839 CUX1P39880 1505 aa41.95■■■■■ 4.31
FOXQ1-201ENST00000296839 KIF21BO75037 1637 aa41.7■■■■■ 4.27
FOXQ1-201ENST00000296839 GOLGA3Q08378 1498 aa41.7■■■■■ 4.27
FOXQ1-201ENST00000296839 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.67■■■■■ 4.26
FOXQ1-201ENST00000296839 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.64■■■■■ 4.26
FOXQ1-201ENST00000296839 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.63■■■■■ 4.26
FOXQ1-201ENST00000296839 NESP48681 1621 aa41.6■■■■■ 4.25
FOXQ1-201ENST00000296839 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.58■■■■■ 4.25
FOXQ1-201ENST00000296839 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.53■■■■■ 4.24
FOXQ1-201ENST00000296839 CEP162Q5TB80 1403 aa41.51■■■■■ 4.24
FOXQ1-201ENST00000296839 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.49■■■■■ 4.23
FOXQ1-201ENST00000296839 KIF27Q86VH2 1401 aa41.42■■■■■ 4.22
FOXQ1-201ENST00000296839 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.39■■■■■ 4.22
FOXQ1-201ENST00000296839 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.37■■■■■ 4.21
FOXQ1-201ENST00000296839 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.37■■■■■ 4.21
FOXQ1-201ENST00000296839 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
FOXQ1-201ENST00000296839 PRXQ9BXM0 1461 aa41.3■■■■■ 4.2
FOXQ1-201ENST00000296839 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.29■■■■■ 4.2
FOXQ1-201ENST00000296839 TOPBP1Q92547 1522 aa41.26■■■■■ 4.2
FOXQ1-201ENST00000296839 CUX2O14529 1486 aa41.22■■■■■ 4.19
FOXQ1-201ENST00000296839 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.22■■■■■ 4.19
FOXQ1-201ENST00000296839 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.13■■■■■ 4.17
FOXQ1-201ENST00000296839 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
FOXQ1-201ENST00000296839 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
FOXQ1-201ENST00000296839 CLIP1P30622 1438 aa41.05■■■■■ 4.16
FOXQ1-201ENST00000296839 IGF1RP08069 1367 aa41.02■■■■■ 4.16
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.01■■■■■ 4.16
FOXQ1-201ENST00000296839 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41■■■■■ 4.15
FOXQ1-201ENST00000296839 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
FOXQ1-201ENST00000296839 WDR97A6NE52 1622 aa40.89■■■■■ 4.14
FOXQ1-201ENST00000296839 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.82■■■■■ 4.12
FOXQ1-201ENST00000296839 HRCP23327 699 aa40.79■■■■■ 4.12
FOXQ1-201ENST00000296839 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.77■■■■■ 4.12
FOXQ1-201ENST00000296839 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
FOXQ1-201ENST00000296839 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.69■■■■■ 4.1
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
FOXQ1-201ENST00000296839 CUL7Q14999 1698 aa40.67■■■■■ 4.1
FOXQ1-201ENST00000296839 ARAP1Q96P48 1450 aa40.62■■■■■ 4.09
FOXQ1-201ENST00000296839 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
FOXQ1-201ENST00000296839 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
FOXQ1-201ENST00000296839 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.52■■■■■ 4.08
FOXQ1-201ENST00000296839 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.5■■■■■ 4.07
FOXQ1-201ENST00000296839 WDR62O43379 1518 aa40.47■■■■■ 4.07
FOXQ1-201ENST00000296839 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
FOXQ1-201ENST00000296839 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.34■■■■■ 4.05
FOXQ1-201ENST00000296839 APLP2Q06481 763 aa40.34■■■■■ 4.05
FOXQ1-201ENST00000296839 ERCC6Q03468 1493 aa40.33■■■■■ 4.05
FOXQ1-201ENST00000296839 PBRM1Q86U86 1689 aa40.32■■■■■ 4.05
FOXQ1-201ENST00000296839 IFT140Q96RY7 1462 aa40.26■■■■■ 4.04
FOXQ1-201ENST00000296839 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
FOXQ1-201ENST00000296839 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms