Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP2O75044 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SRGAP2O75044 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP2O75044 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2O75044 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP2O75044 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2O75044 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP2O75044 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP2O75044 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRGAP2O75044 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRGAP2O75044 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 553.3 ms