RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.65■■■■■ 7.78
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GNPTAB-206ENST00000549940 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.35■■■■■ 6.13
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCC9O60706 1549 aa53.14■■■■■ 6.1
GNPTAB-206ENST00000549940 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.83■■■■■ 6.05
GNPTAB-206ENST00000549940 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.66■■■■■ 6.02
GNPTAB-206ENST00000549940 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.23■■■■■ 5.95
GNPTAB-206ENST00000549940 NACADO15069 1562 aa52.07■■■■■ 5.93
GNPTAB-206ENST00000549940 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.75■■■■■ 5.87
GNPTAB-206ENST00000549940 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.55■■■■■ 5.84
GNPTAB-206ENST00000549940 SCRIBQ14160 1630 aa51.16■■■■■ 5.78
GNPTAB-206ENST00000549940 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.55■■■■■ 5.68
GNPTAB-206ENST00000549940 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.07■■■■■ 5.61
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GNPTAB-206ENST00000549940 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.44■■■■■ 5.51
GNPTAB-206ENST00000549940 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.42■■■■■ 5.5
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GNPTAB-206ENST00000549940 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.17■■■■■ 5.46
GNPTAB-206ENST00000549940 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.11■■■■■ 5.45
GNPTAB-206ENST00000549940 SMARCA4P51532 1647 aa49.02■■■■■ 5.44
GNPTAB-206ENST00000549940 WIZO95785 1651 aa48.68■■■■■ 5.38
GNPTAB-206ENST00000549940 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
GNPTAB-206ENST00000549940 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.45■■■■■ 5.35
GNPTAB-206ENST00000549940 SMARCA2P51531 1590 aa48.37■■■■■ 5.33
GNPTAB-206ENST00000549940 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.36■■■■■ 5.33
GNPTAB-206ENST00000549940 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
GNPTAB-206ENST00000549940 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
GNPTAB-206ENST00000549940 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.07■■■■■ 5.29
GNPTAB-206ENST00000549940 NCAPD3P42695 1498 aa48.05■■■■■ 5.28
GNPTAB-206ENST00000549940 HMGXB3Q12766 1538 aa47.93■■■■■ 5.26
GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.7■■■■■ 5.23
GNPTAB-206ENST00000549940 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.24■■■■■ 5.15
GNPTAB-206ENST00000549940 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.02■■■■■ 5.12
GNPTAB-206ENST00000549940 CFTRP13569 1480 aa46.83■■■■■ 5.09
GNPTAB-206ENST00000549940 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.8■■■■■ 5.08
GNPTAB-206ENST00000549940 TRIM41Q8WV44 630 aa46.56■■■■■ 5.04
GNPTAB-206ENST00000549940 PRDM2Q13029 1718 aa46.53■■■■■ 5.04
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCC8Q09428 1581 aa46.51■■■■■ 5.04
GNPTAB-206ENST00000549940 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.51■■■■■ 5.04
GNPTAB-206ENST00000549940 NESP48681 1621 aa46.45■■■■■ 5.03
GNPTAB-206ENST00000549940 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.35■■■■■ 5.01
GNPTAB-206ENST00000549940 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.26■■■■■ 5
GNPTAB-206ENST00000549940 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.22■■■■■ 4.99
GNPTAB-206ENST00000549940 SYNJ1O43426 1573 aa46.09■■■■■ 4.97
GNPTAB-206ENST00000549940 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.05■■■■■ 4.96
GNPTAB-206ENST00000549940 TOP2BQ02880 1626 aa45.99■■■■■ 4.95
GNPTAB-206ENST00000549940 CUX1P39880 1505 aa45.96■■■■■ 4.95
GNPTAB-206ENST00000549940 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.94■■■■■ 4.94
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.9■■■■■ 4.94
GNPTAB-206ENST00000549940 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.75■■■■■ 4.91
GNPTAB-206ENST00000549940 ERCC6Q03468 1493 aa45.7■■■■■ 4.91
GNPTAB-206ENST00000549940 TOPBP1Q92547 1522 aa45.69■■■■■ 4.9
GNPTAB-206ENST00000549940 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
GNPTAB-206ENST00000549940 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.6■■■■■ 4.89
GNPTAB-206ENST00000549940 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.57■■■■■ 4.89
GNPTAB-206ENST00000549940 SOGA1O94964 1423 aa45.55■■■■■ 4.88
GNPTAB-206ENST00000549940 EEA1Q15075 1411 aa45.48■■■■■ 4.87
GNPTAB-206ENST00000549940 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
GNPTAB-206ENST00000549940 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.37■■■■■ 4.85
GNPTAB-206ENST00000549940 WDR62O43379 1518 aa45.34■■■■■ 4.85
GNPTAB-206ENST00000549940 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
GNPTAB-206ENST00000549940 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.27■■■■■ 4.84
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF27Q86VH2 1401 aa45.26■■■■■ 4.84
GNPTAB-206ENST00000549940 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.25■■■■■ 4.83
GNPTAB-206ENST00000549940 CUX2O14529 1486 aa45.22■■■■■ 4.83
GNPTAB-206ENST00000549940 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.18■■■■■ 4.82
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.17■■■■■ 4.82
GNPTAB-206ENST00000549940 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
GNPTAB-206ENST00000549940 WDR97A6NE52 1622 aa45■■■■■ 4.79
GNPTAB-206ENST00000549940 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.99■■■■■ 4.79
GNPTAB-206ENST00000549940 IFT140Q96RY7 1462 aa44.98■■■■■ 4.79
GNPTAB-206ENST00000549940 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
GNPTAB-206ENST00000549940 IGF1RP08069 1367 aa44.86■■■■■ 4.77
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF21BO75037 1637 aa44.83■■■■■ 4.77
GNPTAB-206ENST00000549940 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.81■■■■■ 4.76
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.8■■■■■ 4.76
GNPTAB-206ENST00000549940 GOLGA3Q08378 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
GNPTAB-206ENST00000549940 PRXQ9BXM0 1461 aa44.76■■■■■ 4.76
GNPTAB-206ENST00000549940 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
GNPTAB-206ENST00000549940 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.74
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
GNPTAB-206ENST00000549940 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.66■■■■■ 4.74
GNPTAB-206ENST00000549940 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.66■■■■■ 4.74
GNPTAB-206ENST00000549940 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.66■■■■■ 4.74
GNPTAB-206ENST00000549940 CUL7Q14999 1698 aa44.57■■■■■ 4.73
GNPTAB-206ENST00000549940 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.55■■■■■ 4.72
GNPTAB-206ENST00000549940 GRIN2BQ13224 1484 aa44.55■■■■■ 4.72
GNPTAB-206ENST00000549940 PBRM1Q86U86 1689 aa44.53■■■■■ 4.72
GNPTAB-206ENST00000549940 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
GNPTAB-206ENST00000549940 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.33■■■■■ 4.69
GNPTAB-206ENST00000549940 ADAMTS12P58397 1594 aa44.27■■■■■ 4.68
GNPTAB-206ENST00000549940 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.26■■■■■ 4.68
GNPTAB-206ENST00000549940 CEP162Q5TB80 1403 aa44.26■■■■■ 4.68
GNPTAB-206ENST00000549940 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
GNPTAB-206ENST00000549940 CLIP1P30622 1438 aa44.06■■■■■ 4.64
GNPTAB-206ENST00000549940 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
GNPTAB-206ENST00000549940 SYNJ2O15056 1496 aa44.05■■■■■ 4.64
GNPTAB-206ENST00000549940 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
GNPTAB-206ENST00000549940 GRIN2AQ12879 1464 aa43.97■■■■■ 4.63
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