RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610767.4

KCTD17-209, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene KCTD17, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17-209ENST00000610767 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.15■■■■■ 8.18
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KCTD17-209ENST00000610767 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.59■■■■■ 6.33
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KCTD17-209ENST00000610767 SMARCA2P51531 1590 aa50.52■■■■■ 5.68
KCTD17-209ENST00000610767 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.52■■■■■ 5.68
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KCTD17-209ENST00000610767 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.34■■■■■ 5.33
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KCTD17-209ENST00000610767 SYNJ1O43426 1573 aa47.76■■■■■ 5.24
KCTD17-209ENST00000610767 WDR62O43379 1518 aa47.74■■■■■ 5.23
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KCTD17-209ENST00000610767 WDR97A6NE52 1622 aa47.1■■■■■ 5.13
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KCTD17-209ENST00000610767 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.69■■■■■ 5.07
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KCTD17-209ENST00000610767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.32■■■■■ 5.01
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KCTD17-209ENST00000610767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.16■■■■■ 4.98
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KCTD17-209ENST00000610767 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.04■■■■■ 4.96
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KCTD17-209ENST00000610767 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
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KCTD17-209ENST00000610767 FBLN2P98095 1184 aa45.84■■■■■ 4.93
KCTD17-209ENST00000610767 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.75■■■■■ 4.91
KCTD17-209ENST00000610767 CEP170Q5SW79 1584 aa45.7■■■■■ 4.91
KCTD17-209ENST00000610767 NUP160Q12769 1436 aa45.68■■■■■ 4.9
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KCTD17-209ENST00000610767 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.64■■■■■ 4.9
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