RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.49■■■■■ 5.67
SENP3-201ENST00000321337 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.06■■■■■ 4.64
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SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
SENP3-201ENST00000321337 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.62■■■■■ 4.41
SENP3-201ENST00000321337 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.47■■■■■ 4.39
SENP3-201ENST00000321337 HRCP23327 699 aa42.33■■■■■ 4.37
SENP3-201ENST00000321337 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.31■■■■■ 4.36
SENP3-201ENST00000321337 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.14■■■■■ 4.34
SENP3-201ENST00000321337 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.99■■■■■ 4.31
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SENP3-201ENST00000321337 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.47■■■■■ 4.23
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SENP3-201ENST00000321337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
SENP3-201ENST00000321337 TRIM41Q8WV44 630 aa40.25■■■■■ 4.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SENP3-201ENST00000321337 SCRIBQ14160 1630 aa40.21■■■■■ 4.03
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SENP3-201ENST00000321337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.09■■■■■ 4.01
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SENP3-201ENST00000321337 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.71■■■■□ 3.79
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SENP3-201ENST00000321337 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.55■■■■□ 3.76
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SENP3-201ENST00000321337 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38.5■■■■□ 3.75
SENP3-201ENST00000321337 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
SENP3-201ENST00000321337 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.38■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 SMARCA2P51531 1590 aa38.37■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.35■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 SMARCA4P51532 1647 aa38.29■■■■□ 3.72
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SENP3-201ENST00000321337 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.26■■■■□ 3.72
SENP3-201ENST00000321337 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
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SENP3-201ENST00000321337 CLIP1P30622 1438 aa37.68■■■■□ 3.62
SENP3-201ENST00000321337 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.66■■■■□ 3.62
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SENP3-201ENST00000321337 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.54■■■■□ 3.6
SENP3-201ENST00000321337 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.5■■■■□ 3.59
SENP3-201ENST00000321337 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.44■■■■□ 3.58
SENP3-201ENST00000321337 APLP2Q06481 763 aa37.42■■■■□ 3.58
SENP3-201ENST00000321337 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.36■■■■□ 3.57
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SENP3-201ENST00000321337 MYT1Q01538 1121 aa37.17■■■■□ 3.54
SENP3-201ENST00000321337 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
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SENP3-201ENST00000321337 TOP2BQ02880 1626 aa37■■■■□ 3.51
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SENP3-201ENST00000321337 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.8■■■■□ 3.48
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SENP3-201ENST00000321337 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
SENP3-201ENST00000321337 NCAPD3P42695 1498 aa36.23■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 WDR97A6NE52 1622 aa36.22■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 TIAM1Q13009 1591 aa36.21■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.21■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.2■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 CFTRP13569 1480 aa36.2■■■■□ 3.39
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