RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.57■■■■■ 8.09
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.89■■■■■ 6.86
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC9O60706 1549 aa55.65■■■■■ 6.5
GIPC1-201ENST00000345425 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.85■■■■■ 6.37
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.4■■■■■ 6.3
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.33■■■■■ 6.29
GIPC1-201ENST00000345425 NACADO15069 1562 aa54.19■■■■■ 6.27
GIPC1-201ENST00000345425 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.19■■■■■ 6.27
GIPC1-201ENST00000345425 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.01■■■■■ 6.24
GIPC1-201ENST00000345425 SCRIBQ14160 1630 aa52.88■■■■■ 6.06
GIPC1-201ENST00000345425 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.77■■■■■ 6.04
GIPC1-201ENST00000345425 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.4■■■■■ 5.98
GIPC1-201ENST00000345425 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.29■■■■■ 5.96
GIPC1-201ENST00000345425 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.15■■■■■ 5.94
GIPC1-201ENST00000345425 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.93■■■■■ 5.74
GIPC1-201ENST00000345425 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.86■■■■■ 5.73
GIPC1-201ENST00000345425 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.79■■■■■ 5.72
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCA4P51532 1647 aa50.68■■■■■ 5.7
GIPC1-201ENST00000345425 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.54■■■■■ 5.68
GIPC1-201ENST00000345425 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.4■■■■■ 5.66
GIPC1-201ENST00000345425 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.32■■■■■ 5.65
GIPC1-201ENST00000345425 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.18■■■■■ 5.62
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCA2P51531 1590 aa50.17■■■■■ 5.62
GIPC1-201ENST00000345425 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.14■■■■■ 5.62
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.1■■■■■ 5.61
GIPC1-201ENST00000345425 WIZO95785 1651 aa50.06■■■■■ 5.6
GIPC1-201ENST00000345425 NCAPD3P42695 1498 aa49.96■■■■■ 5.59
GIPC1-201ENST00000345425 HMGXB3Q12766 1538 aa49.84■■■■■ 5.57
GIPC1-201ENST00000345425 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
GIPC1-201ENST00000345425 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
GIPC1-201ENST00000345425 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC88BA6NC98 1476 aa49■■■■■ 5.43
GIPC1-201ENST00000345425 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.57■■■■■ 5.37
GIPC1-201ENST00000345425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.52■■■■■ 5.36
GIPC1-201ENST00000345425 CFTRP13569 1480 aa48.49■■■■■ 5.35
GIPC1-201ENST00000345425 NESP48681 1621 aa48.44■■■■■ 5.34
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM2Q13029 1718 aa48.25■■■■■ 5.31
GIPC1-201ENST00000345425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.16■■■■■ 5.3
GIPC1-201ENST00000345425 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.02■■■■■ 5.28
GIPC1-201ENST00000345425 ERCC6Q03468 1493 aa47.93■■■■■ 5.26
GIPC1-201ENST00000345425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.93■■■■■ 5.26
GIPC1-201ENST00000345425 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.88■■■■■ 5.26
GIPC1-201ENST00000345425 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.59■■■■■ 5.21
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC8Q09428 1581 aa47.51■■■■■ 5.2
GIPC1-201ENST00000345425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
GIPC1-201ENST00000345425 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.46■■■■■ 5.19
GIPC1-201ENST00000345425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
GIPC1-201ENST00000345425 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.41■■■■■ 5.18
GIPC1-201ENST00000345425 WDR62O43379 1518 aa47.4■■■■■ 5.18
GIPC1-201ENST00000345425 CUX1P39880 1505 aa47.36■■■■■ 5.17
GIPC1-201ENST00000345425 TOPBP1Q92547 1522 aa47.36■■■■■ 5.17
GIPC1-201ENST00000345425 SYNJ1O43426 1573 aa47.26■■■■■ 5.16
GIPC1-201ENST00000345425 TOP2BQ02880 1626 aa47.25■■■■■ 5.15
GIPC1-201ENST00000345425 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.24■■■■■ 5.15
GIPC1-201ENST00000345425 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.07■■■■■ 5.13
GIPC1-201ENST00000345425 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.06■■■■■ 5.12
GIPC1-201ENST00000345425 CUX2O14529 1486 aa47.05■■■■■ 5.12
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM41Q8WV44 630 aa47.03■■■■■ 5.12
GIPC1-201ENST00000345425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
GIPC1-201ENST00000345425 SOGA1O94964 1423 aa46.85■■■■■ 5.09
GIPC1-201ENST00000345425 IFT140Q96RY7 1462 aa46.83■■■■■ 5.09
GIPC1-201ENST00000345425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.79■■■■■ 5.08
GIPC1-201ENST00000345425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.66■■■■■ 5.06
GIPC1-201ENST00000345425 WDR97A6NE52 1622 aa46.63■■■■■ 5.05
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
GIPC1-201ENST00000345425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
GIPC1-201ENST00000345425 KIF27Q86VH2 1401 aa46.4■■■■■ 5.02
GIPC1-201ENST00000345425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.38■■■■■ 5.01
GIPC1-201ENST00000345425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.36■■■■■ 5.01
GIPC1-201ENST00000345425 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.34■■■■■ 5.01
GIPC1-201ENST00000345425 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.21■■■■■ 4.99
GIPC1-201ENST00000345425 EEA1Q15075 1411 aa46.2■■■■■ 4.99
GIPC1-201ENST00000345425 GRIN2BQ13224 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
GIPC1-201ENST00000345425 PBRM1Q86U86 1689 aa46.19■■■■■ 4.98
GIPC1-201ENST00000345425 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.13■■■■■ 4.98
GIPC1-201ENST00000345425 IGF1RP08069 1367 aa46.04■■■■■ 4.96
GIPC1-201ENST00000345425 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
GIPC1-201ENST00000345425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.98■■■■■ 4.95
GIPC1-201ENST00000345425 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
GIPC1-201ENST00000345425 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.95■■■■■ 4.95
GIPC1-201ENST00000345425 CUL7Q14999 1698 aa45.92■■■■■ 4.94
GIPC1-201ENST00000345425 ADAMTS12P58397 1594 aa45.87■■■■■ 4.93
GIPC1-201ENST00000345425 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.84■■■■■ 4.93
GIPC1-201ENST00000345425 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.82■■■■■ 4.93
GIPC1-201ENST00000345425 SYNJ2O15056 1496 aa45.78■■■■■ 4.92
GIPC1-201ENST00000345425 PRXQ9BXM0 1461 aa45.73■■■■■ 4.91
GIPC1-201ENST00000345425 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.91
GIPC1-201ENST00000345425 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.67■■■■■ 4.9
GIPC1-201ENST00000345425 FBLN2P98095 1184 aa45.65■■■■■ 4.9
GIPC1-201ENST00000345425 KIF21BO75037 1637 aa45.62■■■■■ 4.89
GIPC1-201ENST00000345425 CHD1O14646 1710 aa45.62■■■■■ 4.89
GIPC1-201ENST00000345425 GRIN2AQ12879 1464 aa45.6■■■■■ 4.89
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA3Q08378 1498 aa45.44■■■■■ 4.86
GIPC1-201ENST00000345425 NUP160Q12769 1436 aa45.35■■■■■ 4.85
GIPC1-201ENST00000345425 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.32■■■■■ 4.85
GIPC1-201ENST00000345425 CEP170Q5SW79 1584 aa45.32■■■■■ 4.84
GIPC1-201ENST00000345425 OSCARQ8IYS5 282 aa45.28■■■■■ 4.84
GIPC1-201ENST00000345425 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms