RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.77■■■■■ 7.16
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.92■■■■■ 5.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
HOXD8-201ENST00000313173 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.42■■■■■ 5.5
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC9O60706 1549 aa49.38■■■■■ 5.5
HOXD8-201ENST00000313173 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.17■■■■■ 5.46
HOXD8-201ENST00000313173 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.09■■■■■ 5.45
HOXD8-201ENST00000313173 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.65■■■■■ 5.38
HOXD8-201ENST00000313173 NACADO15069 1562 aa48.34■■■■■ 5.33
HOXD8-201ENST00000313173 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48■■■■■ 5.28
HOXD8-201ENST00000313173 SCRIBQ14160 1630 aa47.82■■■■■ 5.25
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.44■■■■■ 5.18
HOXD8-201ENST00000313173 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.04■■■■■ 5.12
HOXD8-201ENST00000313173 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.6■■■■■ 5.05
HOXD8-201ENST00000313173 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.55■■■■■ 5.04
HOXD8-201ENST00000313173 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
HOXD8-201ENST00000313173 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.41■■■■■ 5.02
HOXD8-201ENST00000313173 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.21■■■■■ 4.99
HOXD8-201ENST00000313173 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
HOXD8-201ENST00000313173 SMARCA4P51532 1647 aa45.87■■■■■ 4.93
HOXD8-201ENST00000313173 WIZO95785 1651 aa45.86■■■■■ 4.93
HOXD8-201ENST00000313173 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.67■■■■■ 4.9
HOXD8-201ENST00000313173 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
HOXD8-201ENST00000313173 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.27■■■■■ 4.84
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
HOXD8-201ENST00000313173 SMARCA2P51531 1590 aa45■■■■■ 4.79
HOXD8-201ENST00000313173 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.98■■■■■ 4.79
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.93■■■■■ 4.78
HOXD8-201ENST00000313173 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
HOXD8-201ENST00000313173 NCAPD3P42695 1498 aa44.65■■■■■ 4.74
HOXD8-201ENST00000313173 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.65■■■■■ 4.74
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM41Q8WV44 630 aa44.56■■■■■ 4.72
HOXD8-201ENST00000313173 HMGXB3Q12766 1538 aa44.52■■■■■ 4.72
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC8Q09428 1581 aa44.16■■■■■ 4.66
HOXD8-201ENST00000313173 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.93■■■■■ 4.62
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.93■■■■■ 4.62
HOXD8-201ENST00000313173 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.8■■■■■ 4.6
HOXD8-201ENST00000313173 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
HOXD8-201ENST00000313173 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
HOXD8-201ENST00000313173 SYNJ1O43426 1573 aa43.63■■■■■ 4.57
HOXD8-201ENST00000313173 PRDM2Q13029 1718 aa43.5■■■■■ 4.55
HOXD8-201ENST00000313173 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.5■■■■■ 4.55
HOXD8-201ENST00000313173 EEA1Q15075 1411 aa43.42■■■■■ 4.54
HOXD8-201ENST00000313173 SOGA1O94964 1423 aa43.41■■■■■ 4.54
HOXD8-201ENST00000313173 TOP2BQ02880 1626 aa43.4■■■■■ 4.54
HOXD8-201ENST00000313173 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.37■■■■■ 4.53
HOXD8-201ENST00000313173 NESP48681 1621 aa43.25■■■■■ 4.51
HOXD8-201ENST00000313173 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.22■■■■■ 4.51
HOXD8-201ENST00000313173 CUX1P39880 1505 aa43.18■■■■■ 4.5
HOXD8-201ENST00000313173 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.16■■■■■ 4.5
HOXD8-201ENST00000313173 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.13■■■■■ 4.5
HOXD8-201ENST00000313173 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.1■■■■■ 4.49
HOXD8-201ENST00000313173 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.01■■■■■ 4.48
HOXD8-201ENST00000313173 KIF21BO75037 1637 aa42.86■■■■■ 4.45
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA3Q08378 1498 aa42.86■■■■■ 4.45
HOXD8-201ENST00000313173 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.86■■■■■ 4.45
HOXD8-201ENST00000313173 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
HOXD8-201ENST00000313173 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.8■■■■■ 4.44
HOXD8-201ENST00000313173 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.68■■■■■ 4.42
HOXD8-201ENST00000313173 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
HOXD8-201ENST00000313173 KIF27Q86VH2 1401 aa42.64■■■■■ 4.42
HOXD8-201ENST00000313173 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.63■■■■■ 4.41
HOXD8-201ENST00000313173 CEP162Q5TB80 1403 aa42.62■■■■■ 4.41
HOXD8-201ENST00000313173 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
HOXD8-201ENST00000313173 TOPBP1Q92547 1522 aa42.52■■■■■ 4.4
HOXD8-201ENST00000313173 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.52■■■■■ 4.4
HOXD8-201ENST00000313173 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
HOXD8-201ENST00000313173 PRXQ9BXM0 1461 aa42.49■■■■■ 4.39
HOXD8-201ENST00000313173 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.48■■■■■ 4.39
HOXD8-201ENST00000313173 CUX2O14529 1486 aa42.44■■■■■ 4.38
HOXD8-201ENST00000313173 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.42■■■■■ 4.38
HOXD8-201ENST00000313173 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
HOXD8-201ENST00000313173 ERCC6Q03468 1493 aa42.35■■■■■ 4.37
HOXD8-201ENST00000313173 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.32■■■■■ 4.37
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.26■■■■■ 4.36
HOXD8-201ENST00000313173 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.21■■■■■ 4.35
HOXD8-201ENST00000313173 IGF1RP08069 1367 aa42.2■■■■■ 4.35
HOXD8-201ENST00000313173 CLIP1P30622 1438 aa42.18■■■■■ 4.34
HOXD8-201ENST00000313173 WDR97A6NE52 1622 aa42.11■■■■■ 4.33
HOXD8-201ENST00000313173 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
HOXD8-201ENST00000313173 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
HOXD8-201ENST00000313173 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42■■■■■ 4.31
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.9■■■■■ 4.3
HOXD8-201ENST00000313173 CUL7Q14999 1698 aa41.88■■■■■ 4.3
HOXD8-201ENST00000313173 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
HOXD8-201ENST00000313173 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.88■■■■■ 4.29
HOXD8-201ENST00000313173 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
HOXD8-201ENST00000313173 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
HOXD8-201ENST00000313173 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
HOXD8-201ENST00000313173 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.75■■■■■ 4.27
HOXD8-201ENST00000313173 IFT140Q96RY7 1462 aa41.75■■■■■ 4.27
HOXD8-201ENST00000313173 ARAP1Q96P48 1450 aa41.73■■■■■ 4.27
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.62■■■■■ 4.25
HOXD8-201ENST00000313173 HRCP23327 699 aa41.61■■■■■ 4.25
HOXD8-201ENST00000313173 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
HOXD8-201ENST00000313173 PBRM1Q86U86 1689 aa41.53■■■■■ 4.24
HOXD8-201ENST00000313173 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.5■■■■■ 4.23
HOXD8-201ENST00000313173 APLP2Q06481 763 aa41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms