RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.98■■■■■ 7.67
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.96■■■■■ 6.39
HOXB3-207ENST00000472863 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.82■■■■■ 6.05
HOXB3-207ENST00000472863 ABCC9O60706 1549 aa52.44■■■■■ 5.99
HOXB3-207ENST00000472863 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.31■■■■■ 5.96
HOXB3-207ENST00000472863 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.99■■■■■ 5.91
HOXB3-207ENST00000472863 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.48■■■■■ 5.83
HOXB3-207ENST00000472863 NACADO15069 1562 aa51.31■■■■■ 5.8
HOXB3-207ENST00000472863 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.3■■■■■ 5.8
HOXB3-207ENST00000472863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.96■■■■■ 5.75
HOXB3-207ENST00000472863 SCRIBQ14160 1630 aa50.63■■■■■ 5.7
HOXB3-207ENST00000472863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.96■■■■■ 5.59
HOXB3-207ENST00000472863 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.49■■■■■ 5.51
HOXB3-207ENST00000472863 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.48■■■■■ 5.51
HOXB3-207ENST00000472863 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
HOXB3-207ENST00000472863 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.05■■■■■ 5.44
HOXB3-207ENST00000472863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
HOXB3-207ENST00000472863 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.69■■■■■ 5.39
HOXB3-207ENST00000472863 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
HOXB3-207ENST00000472863 SMARCA4P51532 1647 aa48.46■■■■■ 5.35
HOXB3-207ENST00000472863 WIZO95785 1651 aa48.27■■■■■ 5.32
HOXB3-207ENST00000472863 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
HOXB3-207ENST00000472863 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.85■■■■■ 5.25
HOXB3-207ENST00000472863 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.79■■■■■ 5.24
HOXB3-207ENST00000472863 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
HOXB3-207ENST00000472863 SMARCA2P51531 1590 aa47.68■■■■■ 5.22
HOXB3-207ENST00000472863 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
HOXB3-207ENST00000472863 NCAPD3P42695 1498 aa47.41■■■■■ 5.18
HOXB3-207ENST00000472863 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.4■■■■■ 5.18
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.29■■■■■ 5.16
HOXB3-207ENST00000472863 HMGXB3Q12766 1538 aa47.25■■■■■ 5.15
HOXB3-207ENST00000472863 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.91■■■■■ 5.1
HOXB3-207ENST00000472863 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.66■■■■■ 5.06
HOXB3-207ENST00000472863 CFTRP13569 1480 aa46.27■■■■■ 5
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM41Q8WV44 630 aa46.24■■■■■ 4.99
HOXB3-207ENST00000472863 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.2■■■■■ 4.99
HOXB3-207ENST00000472863 ABCC8Q09428 1581 aa46.2■■■■■ 4.99
HOXB3-207ENST00000472863 NESP48681 1621 aa45.96■■■■■ 4.95
HOXB3-207ENST00000472863 PRDM2Q13029 1718 aa45.92■■■■■ 4.94
HOXB3-207ENST00000472863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.9■■■■■ 4.94
HOXB3-207ENST00000472863 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.81■■■■■ 4.92
HOXB3-207ENST00000472863 SYNJ1O43426 1573 aa45.73■■■■■ 4.91
HOXB3-207ENST00000472863 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.69■■■■■ 4.9
HOXB3-207ENST00000472863 CUX1P39880 1505 aa45.53■■■■■ 4.88
HOXB3-207ENST00000472863 TOP2BQ02880 1626 aa45.52■■■■■ 4.88
HOXB3-207ENST00000472863 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.5■■■■■ 4.87
HOXB3-207ENST00000472863 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
HOXB3-207ENST00000472863 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.46■■■■■ 4.87
HOXB3-207ENST00000472863 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.4■■■■■ 4.86
HOXB3-207ENST00000472863 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.32■■■■■ 4.85
HOXB3-207ENST00000472863 SOGA1O94964 1423 aa45.29■■■■■ 4.84
HOXB3-207ENST00000472863 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.18■■■■■ 4.82
HOXB3-207ENST00000472863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.17■■■■■ 4.82
HOXB3-207ENST00000472863 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.16■■■■■ 4.82
HOXB3-207ENST00000472863 TOPBP1Q92547 1522 aa45.15■■■■■ 4.82
HOXB3-207ENST00000472863 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
HOXB3-207ENST00000472863 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.08■■■■■ 4.81
HOXB3-207ENST00000472863 EEA1Q15075 1411 aa44.99■■■■■ 4.79
HOXB3-207ENST00000472863 ERCC6Q03468 1493 aa44.95■■■■■ 4.79
HOXB3-207ENST00000472863 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.93■■■■■ 4.78
HOXB3-207ENST00000472863 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.92■■■■■ 4.78
HOXB3-207ENST00000472863 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
HOXB3-207ENST00000472863 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.9■■■■■ 4.78
HOXB3-207ENST00000472863 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.82■■■■■ 4.77
HOXB3-207ENST00000472863 KIF27Q86VH2 1401 aa44.75■■■■■ 4.75
HOXB3-207ENST00000472863 CUX2O14529 1486 aa44.74■■■■■ 4.75
HOXB3-207ENST00000472863 WDR62O43379 1518 aa44.69■■■■■ 4.74
HOXB3-207ENST00000472863 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.64■■■■■ 4.74
HOXB3-207ENST00000472863 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
HOXB3-207ENST00000472863 WDR97A6NE52 1622 aa44.48■■■■■ 4.71
HOXB3-207ENST00000472863 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
HOXB3-207ENST00000472863 IGF1RP08069 1367 aa44.46■■■■■ 4.71
HOXB3-207ENST00000472863 KIF21BO75037 1637 aa44.44■■■■■ 4.7
HOXB3-207ENST00000472863 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
HOXB3-207ENST00000472863 GOLGA3Q08378 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
HOXB3-207ENST00000472863 PRXQ9BXM0 1461 aa44.38■■■■■ 4.69
HOXB3-207ENST00000472863 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.36■■■■■ 4.69
HOXB3-207ENST00000472863 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
HOXB3-207ENST00000472863 IFT140Q96RY7 1462 aa44.33■■■■■ 4.69
HOXB3-207ENST00000472863 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.28■■■■■ 4.68
HOXB3-207ENST00000472863 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.27■■■■■ 4.68
HOXB3-207ENST00000472863 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.23■■■■■ 4.67
HOXB3-207ENST00000472863 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.21■■■■■ 4.67
HOXB3-207ENST00000472863 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.2■■■■■ 4.672e-7■■■■□ 21.2
HOXB3-207ENST00000472863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.2■■■■■ 4.67
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
HOXB3-207ENST00000472863 CUL7Q14999 1698 aa44.01■■■■■ 4.64
HOXB3-207ENST00000472863 CEP162Q5TB80 1403 aa43.98■■■■■ 4.63
HOXB3-207ENST00000472863 PBRM1Q86U86 1689 aa43.98■■■■■ 4.63
HOXB3-207ENST00000472863 GRIN2BQ13224 1484 aa43.94■■■■■ 4.62
HOXB3-207ENST00000472863 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
HOXB3-207ENST00000472863 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
HOXB3-207ENST00000472863 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.76■■■■■ 4.6
HOXB3-207ENST00000472863 ADAMTS12P58397 1594 aa43.73■■■■■ 4.59
HOXB3-207ENST00000472863 CLIP1P30622 1438 aa43.72■■■■■ 4.59
HOXB3-207ENST00000472863 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.72■■■■■ 4.59
HOXB3-207ENST00000472863 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
HOXB3-207ENST00000472863 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.49■■■■■ 4.55
HOXB3-207ENST00000472863 SYNJ2O15056 1496 aa43.44■■■■■ 4.55
HOXB3-207ENST00000472863 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
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