RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539696.5

MVK-208, Transcript of mevalonate kinase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MVK, Length 608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVK-208ENST00000539696 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.26■■■■■ 8.36
MVK-208ENST00000539696 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.54■■■■■ 7.12
MVK-208ENST00000539696 ABCC9O60706 1549 aa57.61■■■■■ 6.81
MVK-208ENST00000539696 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.15■■■■■ 6.58
MVK-208ENST00000539696 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56■■■■■ 6.56
MVK-208ENST00000539696 NACADO15069 1562 aa55.86■■■■■ 6.53
MVK-208ENST00000539696 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.76■■■■■ 6.52
MVK-208ENST00000539696 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.73■■■■■ 6.51
MVK-208ENST00000539696 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.72■■■■■ 6.51
MVK-208ENST00000539696 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.41■■■■■ 6.3
MVK-208ENST00000539696 SCRIBQ14160 1630 aa54.35■■■■■ 6.29
MVK-208ENST00000539696 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.95■■■■■ 6.23
MVK-208ENST00000539696 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.95■■■■■ 6.23
MVK-208ENST00000539696 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.58■■■■■ 6.17
MVK-208ENST00000539696 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.53■■■■■ 6
MVK-208ENST00000539696 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.27■■■■■ 5.96
MVK-208ENST00000539696 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.23■■■■■ 5.95
MVK-208ENST00000539696 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.15■■■■■ 5.94
MVK-208ENST00000539696 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.13■■■■■ 5.94
MVK-208ENST00000539696 SMARCA4P51532 1647 aa52.05■■■■■ 5.92
MVK-208ENST00000539696 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.82■■■■■ 5.89
MVK-208ENST00000539696 SMARCA2P51531 1590 aa51.63■■■■■ 5.86
MVK-208ENST00000539696 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.61■■■■■ 5.85
MVK-208ENST00000539696 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.54■■■■■ 5.84
MVK-208ENST00000539696 NCAPD3P42695 1498 aa51.51■■■■■ 5.84
MVK-208ENST00000539696 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.48■■■■■ 5.83
MVK-208ENST00000539696 HMGXB3Q12766 1538 aa51.32■■■■■ 5.81
MVK-208ENST00000539696 WIZO95785 1651 aa51.29■■■■■ 5.8
MVK-208ENST00000539696 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.27■■■■■ 5.8
MVK-208ENST00000539696 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
MVK-208ENST00000539696 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.69■■■■■ 5.71
MVK-208ENST00000539696 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.21■■■■■ 5.63
MVK-208ENST00000539696 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.07■■■■■ 5.61
MVK-208ENST00000539696 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.05■■■■■ 5.6
MVK-208ENST00000539696 NESP48681 1621 aa50.01■■■■■ 5.6
MVK-208ENST00000539696 CFTRP13569 1480 aa49.87■■■■■ 5.57
MVK-208ENST00000539696 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.74■■■■■ 5.55
MVK-208ENST00000539696 ERCC6Q03468 1493 aa49.69■■■■■ 5.54
MVK-208ENST00000539696 PRDM2Q13029 1718 aa49.55■■■■■ 5.52
MVK-208ENST00000539696 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.47■■■■■ 5.51
MVK-208ENST00000539696 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.45■■■■■ 5.51
MVK-208ENST00000539696 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.37■■■■■ 5.49
MVK-208ENST00000539696 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.16■■■■■ 5.46
MVK-208ENST00000539696 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.13■■■■■ 5.46
MVK-208ENST00000539696 WDR62O43379 1518 aa48.95■■■■■ 5.43
MVK-208ENST00000539696 CUX2O14529 1486 aa48.91■■■■■ 5.42
MVK-208ENST00000539696 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
MVK-208ENST00000539696 ABCC8Q09428 1581 aa48.86■■■■■ 5.41
MVK-208ENST00000539696 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.75■■■■■ 5.39
MVK-208ENST00000539696 TOPBP1Q92547 1522 aa48.73■■■■■ 5.39
MVK-208ENST00000539696 CUX1P39880 1505 aa48.58■■■■■ 5.37
MVK-208ENST00000539696 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.57■■■■■ 5.37
MVK-208ENST00000539696 TOP2BQ02880 1626 aa48.36■■■■■ 5.33
MVK-208ENST00000539696 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.35■■■■■ 5.33
MVK-208ENST00000539696 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.35■■■■■ 5.33
MVK-208ENST00000539696 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.35■■■■■ 5.33
MVK-208ENST00000539696 SYNJ1O43426 1573 aa48.34■■■■■ 5.33
MVK-208ENST00000539696 IFT140Q96RY7 1462 aa48.32■■■■■ 5.33
MVK-208ENST00000539696 SOGA1O94964 1423 aa48.22■■■■■ 5.31
MVK-208ENST00000539696 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
MVK-208ENST00000539696 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.12■■■■■ 5.29
MVK-208ENST00000539696 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
MVK-208ENST00000539696 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.92■■■■■ 5.26
MVK-208ENST00000539696 TRIM41Q8WV44 630 aa47.91■■■■■ 5.26
MVK-208ENST00000539696 WDR97A6NE52 1622 aa47.87■■■■■ 5.25
MVK-208ENST00000539696 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
MVK-208ENST00000539696 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
MVK-208ENST00000539696 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.8■■■■■ 5.241e-6■■■■■ 28.6
MVK-208ENST00000539696 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.66■■■■■ 5.22
MVK-208ENST00000539696 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.66■■■■■ 5.22
MVK-208ENST00000539696 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.64■■■■■ 5.22
MVK-208ENST00000539696 GRIN2BQ13224 1484 aa47.58■■■■■ 5.21
MVK-208ENST00000539696 KIF27Q86VH2 1401 aa47.54■■■■■ 5.2
MVK-208ENST00000539696 PBRM1Q86U86 1689 aa47.49■■■■■ 5.19
MVK-208ENST00000539696 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.4■■■■■ 5.18
MVK-208ENST00000539696 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.4■■■■■ 5.18
MVK-208ENST00000539696 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.38■■■■■ 5.18
MVK-208ENST00000539696 IGF1RP08069 1367 aa47.2■■■■■ 5.15
MVK-208ENST00000539696 SYNJ2O15056 1496 aa47.19■■■■■ 5.14
MVK-208ENST00000539696 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.17■■■■■ 5.14
MVK-208ENST00000539696 FBLN2P98095 1184 aa47.17■■■■■ 5.14
MVK-208ENST00000539696 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
MVK-208ENST00000539696 ADAMTS12P58397 1594 aa47.15■■■■■ 5.14
MVK-208ENST00000539696 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.15■■■■■ 5.14
MVK-208ENST00000539696 CHD1O14646 1710 aa47.1■■■■■ 5.13
MVK-208ENST00000539696 CUL7Q14999 1698 aa47.08■■■■■ 5.13
MVK-208ENST00000539696 EEA1Q15075 1411 aa47.07■■■■■ 5.13
MVK-208ENST00000539696 OSCARQ8IYS5 282 aa47.04■■■■■ 5.12
MVK-208ENST00000539696 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.97■■■■■ 5.11
MVK-208ENST00000539696 GRIN2AQ12879 1464 aa46.95■■■■■ 5.11
MVK-208ENST00000539696 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.89■■■■■ 5.1
MVK-208ENST00000539696 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
MVK-208ENST00000539696 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.76■■■■■ 5.08
MVK-208ENST00000539696 PRXQ9BXM0 1461 aa46.72■■■■■ 5.07
MVK-208ENST00000539696 NUP160Q12769 1436 aa46.7■■■■■ 5.07
MVK-208ENST00000539696 CEP170Q5SW79 1584 aa46.64■■■■■ 5.06
MVK-208ENST00000539696 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.64■■■■■ 5.06
MVK-208ENST00000539696 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.6■■■■■ 5.05
MVK-208ENST00000539696 KIF21BO75037 1637 aa46.47■■■■■ 5.03
MVK-208ENST00000539696 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.44■■■■■ 5.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms