RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266077.4

SLC2A4RG-201, Transcript of SLC2A4 regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC2A4RG, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC2A4RG-201ENST00000266077 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.14■■■■■ 7.7
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.42■■■■■ 6.46
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.94■■■■■ 6.07
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ABCC9O60706 1549 aa52.76■■■■■ 6.04
SLC2A4RG-201ENST00000266077 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.3■■■■■ 5.96
SLC2A4RG-201ENST00000266077 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.2■■■■■ 5.95
SLC2A4RG-201ENST00000266077 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.93■■■■■ 5.9
SLC2A4RG-201ENST00000266077 NACADO15069 1562 aa51.74■■■■■ 5.87
SLC2A4RG-201ENST00000266077 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.43■■■■■ 5.82
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.93■■■■■ 5.74
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SCRIBQ14160 1630 aa50.74■■■■■ 5.71
SLC2A4RG-201ENST00000266077 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.26■■■■■ 5.64
SLC2A4RG-201ENST00000266077 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.78■■■■■ 5.56
SLC2A4RG-201ENST00000266077 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.58■■■■■ 5.534e-8■■□□□ 13.6
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.02■■■■■ 5.44
SLC2A4RG-201ENST00000266077 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.39
SLC2A4RG-201ENST00000266077 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.72■■■■■ 5.39
SLC2A4RG-201ENST00000266077 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.7■■■■■ 5.39
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SMARCA4P51532 1647 aa48.66■■■■■ 5.38
SLC2A4RG-201ENST00000266077 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
SLC2A4RG-201ENST00000266077 WIZO95785 1651 aa48.26■■■■■ 5.32
SLC2A4RG-201ENST00000266077 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.15■■■■■ 5.3
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SMARCA2P51531 1590 aa48.03■■■■■ 5.28
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48■■■■■ 5.27
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.78■■■■■ 5.24
SLC2A4RG-201ENST00000266077 NCAPD3P42695 1498 aa47.72■■■■■ 5.23
SLC2A4RG-201ENST00000266077 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
SLC2A4RG-201ENST00000266077 HMGXB3Q12766 1538 aa47.64■■■■■ 5.22
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.27■■■■■ 5.16
SLC2A4RG-201ENST00000266077 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.94■■■■■ 5.11
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CFTRP13569 1480 aa46.49■■■■■ 5.03
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.44■■■■■ 5.02
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.4■■■■■ 5.02
SLC2A4RG-201ENST00000266077 PRDM2Q13029 1718 aa46.26■■■■■ 5
SLC2A4RG-201ENST00000266077 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.23■■■■■ 4.99
SLC2A4RG-201ENST00000266077 NESP48681 1621 aa46.11■■■■■ 4.97
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ABCC8Q09428 1581 aa46.04■■■■■ 4.96
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TRIM41Q8WV44 630 aa45.97■■■■■ 4.95
SLC2A4RG-201ENST00000266077 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.92■■■■■ 4.94
SLC2A4RG-201ENST00000266077 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.91■■■■■ 4.94
SLC2A4RG-201ENST00000266077 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.88■■■■■ 4.93
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.71■■■■■ 4.91
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SYNJ1O43426 1573 aa45.7■■■■■ 4.91
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TOP2BQ02880 1626 aa45.63■■■■■ 4.9
SLC2A4RG-201ENST00000266077 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.61■■■■■ 4.89
SLC2A4RG-201ENST00000266077 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.6■■■■■ 4.89
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CUX1P39880 1505 aa45.59■■■■■ 4.89
SLC2A4RG-201ENST00000266077 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.43■■■■■ 4.86
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ERCC6Q03468 1493 aa45.37■■■■■ 4.85
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TOPBP1Q92547 1522 aa45.35■■■■■ 4.85
SLC2A4RG-201ENST00000266077 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
SLC2A4RG-201ENST00000266077 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.3■■■■■ 4.84
SLC2A4RG-201ENST00000266077 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.2■■■■■ 4.83
SLC2A4RG-201ENST00000266077 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
SLC2A4RG-201ENST00000266077 WDR62O43379 1518 aa45.08■■■■■ 4.81
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SOGA1O94964 1423 aa45.06■■■■■ 4.8
SLC2A4RG-201ENST00000266077 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
SLC2A4RG-201ENST00000266077 EEA1Q15075 1411 aa45.04■■■■■ 4.8
SLC2A4RG-201ENST00000266077 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
SLC2A4RG-201ENST00000266077 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.89■■■■■ 4.78
SLC2A4RG-201ENST00000266077 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.86■■■■■ 4.77
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.83■■■■■ 4.77
SLC2A4RG-201ENST00000266077 KIF27Q86VH2 1401 aa44.83■■■■■ 4.77
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CUX2O14529 1486 aa44.8■■■■■ 4.76
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.74■■■■■ 4.75
SLC2A4RG-201ENST00000266077 WDR97A6NE52 1622 aa44.72■■■■■ 4.75
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
SLC2A4RG-201ENST00000266077 IFT140Q96RY7 1462 aa44.67■■■■■ 4.74
SLC2A4RG-201ENST00000266077 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.51■■■■■ 4.72
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.51■■■■■ 4.72
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
SLC2A4RG-201ENST00000266077 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.44■■■■■ 4.71
SLC2A4RG-201ENST00000266077 KIF21BO75037 1637 aa44.43■■■■■ 4.7
SLC2A4RG-201ENST00000266077 IGF1RP08069 1367 aa44.43■■■■■ 4.7
SLC2A4RG-201ENST00000266077 PRXQ9BXM0 1461 aa44.36■■■■■ 4.69
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.33■■■■■ 4.69
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
SLC2A4RG-201ENST00000266077 GOLGA3Q08378 1498 aa44.33■■■■■ 4.69
SLC2A4RG-201ENST00000266077 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.3■■■■■ 4.688e-8■■■■□ 26.4
SLC2A4RG-201ENST00000266077 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.29■■■■■ 4.68
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CUL7Q14999 1698 aa44.24■■■■■ 4.67
SLC2A4RG-201ENST00000266077 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
SLC2A4RG-201ENST00000266077 PBRM1Q86U86 1689 aa44.23■■■■■ 4.67
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.23■■■■■ 4.67
SLC2A4RG-201ENST00000266077 GRIN2BQ13224 1484 aa44.21■■■■■ 4.67
SLC2A4RG-201ENST00000266077 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.21■■■■■ 4.67
SLC2A4RG-201ENST00000266077 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
SLC2A4RG-201ENST00000266077 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.06■■■■■ 4.64
SLC2A4RG-201ENST00000266077 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.98■■■■■ 4.63
SLC2A4RG-201ENST00000266077 ADAMTS12P58397 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.93■■■■■ 4.62
SLC2A4RG-201ENST00000266077 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CEP162Q5TB80 1403 aa43.75■■■■■ 4.59
SLC2A4RG-201ENST00000266077 SYNJ2O15056 1496 aa43.73■■■■■ 4.59
SLC2A4RG-201ENST00000266077 GRIN2AQ12879 1464 aa43.64■■■■■ 4.58
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.63■■■■■ 4.58
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
SLC2A4RG-201ENST00000266077 CLIP1P30622 1438 aa43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 642.5 ms