RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522111.2

TRNP1-201, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRNP1, Length 1,958 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-201ENST00000522111 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.23■■■■■ 7.55
TRNP1-201ENST00000522111 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.33■■■■■ 6.29
TRNP1-201ENST00000522111 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.22■■■■■ 5.95
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC9O60706 1549 aa51.79■■■■■ 5.88
TRNP1-201ENST00000522111 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.68■■■■■ 5.86
TRNP1-201ENST00000522111 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.32■■■■■ 5.81
TRNP1-201ENST00000522111 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.82■■■■■ 5.73
TRNP1-201ENST00000522111 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.78■■■■■ 5.72
TRNP1-201ENST00000522111 NACADO15069 1562 aa50.66■■■■■ 5.7
TRNP1-201ENST00000522111 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.33■■■■■ 5.65
TRNP1-201ENST00000522111 SCRIBQ14160 1630 aa50.11■■■■■ 5.61
TRNP1-201ENST00000522111 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.41■■■■■ 5.5
TRNP1-201ENST00000522111 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.85■■■■■ 5.41
TRNP1-201ENST00000522111 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.81■■■■■ 5.4
TRNP1-201ENST00000522111 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
TRNP1-201ENST00000522111 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.46■■■■■ 5.35
TRNP1-201ENST00000522111 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.2■■■■■ 5.31
TRNP1-201ENST00000522111 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.13■■■■■ 5.29
TRNP1-201ENST00000522111 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
TRNP1-201ENST00000522111 SMARCA4P51532 1647 aa47.92■■■■■ 5.26
TRNP1-201ENST00000522111 WIZO95785 1651 aa47.76■■■■■ 5.24
TRNP1-201ENST00000522111 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
TRNP1-201ENST00000522111 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.25■■■■■ 5.16
TRNP1-201ENST00000522111 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.17■■■■■ 5.14
TRNP1-201ENST00000522111 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.17■■■■■ 5.14
TRNP1-201ENST00000522111 SMARCA2P51531 1590 aa47.11■■■■■ 5.13
TRNP1-201ENST00000522111 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
TRNP1-201ENST00000522111 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.81■■■■■ 5.08
TRNP1-201ENST00000522111 NCAPD3P42695 1498 aa46.75■■■■■ 5.07
TRNP1-201ENST00000522111 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.71■■■■■ 5.07
TRNP1-201ENST00000522111 HMGXB3Q12766 1538 aa46.68■■■■■ 5.06
TRNP1-201ENST00000522111 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.38■■■■■ 5.02
TRNP1-201ENST00000522111 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.88■■■■■ 4.94
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC8Q09428 1581 aa45.76■■■■■ 4.92
TRNP1-201ENST00000522111 TRIM41Q8WV44 630 aa45.75■■■■■ 4.91
TRNP1-201ENST00000522111 CFTRP13569 1480 aa45.68■■■■■ 4.9
TRNP1-201ENST00000522111 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.57■■■■■ 4.89
TRNP1-201ENST00000522111 PRDM2Q13029 1718 aa45.46■■■■■ 4.87
TRNP1-201ENST00000522111 NESP48681 1621 aa45.39■■■■■ 4.86
TRNP1-201ENST00000522111 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.39■■■■■ 4.86
TRNP1-201ENST00000522111 SYNJ1O43426 1573 aa45.26■■■■■ 4.84
TRNP1-201ENST00000522111 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
TRNP1-201ENST00000522111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.13■■■■■ 4.81
TRNP1-201ENST00000522111 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
TRNP1-201ENST00000522111 TOP2BQ02880 1626 aa45.03■■■■■ 4.8
TRNP1-201ENST00000522111 CUX1P39880 1505 aa45.01■■■■■ 4.8
TRNP1-201ENST00000522111 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.98■■■■■ 4.79
TRNP1-201ENST00000522111 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.9■■■■■ 4.78
TRNP1-201ENST00000522111 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.87■■■■■ 4.77
TRNP1-201ENST00000522111 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.84■■■■■ 4.77
TRNP1-201ENST00000522111 SOGA1O94964 1423 aa44.81■■■■■ 4.76
TRNP1-201ENST00000522111 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.71■■■■■ 4.75
TRNP1-201ENST00000522111 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.67■■■■■ 4.74
TRNP1-201ENST00000522111 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.65■■■■■ 4.74
TRNP1-201ENST00000522111 TOPBP1Q92547 1522 aa44.6■■■■■ 4.73
TRNP1-201ENST00000522111 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
TRNP1-201ENST00000522111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.57■■■■■ 4.73
TRNP1-201ENST00000522111 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.53■■■■■ 4.72
TRNP1-201ENST00000522111 EEA1Q15075 1411 aa44.49■■■■■ 4.71
TRNP1-201ENST00000522111 ERCC6Q03468 1493 aa44.41■■■■■ 4.7
TRNP1-201ENST00000522111 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
TRNP1-201ENST00000522111 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.36■■■■■ 4.69
TRNP1-201ENST00000522111 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.36■■■■■ 4.69
TRNP1-201ENST00000522111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.28■■■■■ 4.68
TRNP1-201ENST00000522111 CUX2O14529 1486 aa44.25■■■■■ 4.67
TRNP1-201ENST00000522111 KIF27Q86VH2 1401 aa44.24■■■■■ 4.67
TRNP1-201ENST00000522111 WDR62O43379 1518 aa44.13■■■■■ 4.65
TRNP1-201ENST00000522111 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
TRNP1-201ENST00000522111 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.1■■■■■ 4.65
TRNP1-201ENST00000522111 WDR97A6NE52 1622 aa44.02■■■■■ 4.64
TRNP1-201ENST00000522111 KIF21BO75037 1637 aa44.01■■■■■ 4.64
TRNP1-201ENST00000522111 GOLGA3Q08378 1498 aa43.97■■■■■ 4.63
TRNP1-201ENST00000522111 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
TRNP1-201ENST00000522111 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.9■■■■■ 4.62
TRNP1-201ENST00000522111 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
TRNP1-201ENST00000522111 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
TRNP1-201ENST00000522111 IGF1RP08069 1367 aa43.87■■■■■ 4.61
TRNP1-201ENST00000522111 PRXQ9BXM0 1461 aa43.86■■■■■ 4.61
TRNP1-201ENST00000522111 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.8■■■■■ 4.6
TRNP1-201ENST00000522111 IFT140Q96RY7 1462 aa43.75■■■■■ 4.59
TRNP1-201ENST00000522111 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.74■■■■■ 4.59
TRNP1-201ENST00000522111 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.74■■■■■ 4.59
TRNP1-201ENST00000522111 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.73■■■■■ 4.59
TRNP1-201ENST00000522111 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.66■■■■■ 4.58
TRNP1-201ENST00000522111 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.64■■■■■ 4.581e-7■■■□□ 16.7
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
TRNP1-201ENST00000522111 CEP162Q5TB80 1403 aa43.58■■■■■ 4.57
TRNP1-201ENST00000522111 CUL7Q14999 1698 aa43.55■■■■■ 4.56
TRNP1-201ENST00000522111 PBRM1Q86U86 1689 aa43.54■■■■■ 4.56
TRNP1-201ENST00000522111 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
TRNP1-201ENST00000522111 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
TRNP1-201ENST00000522111 GRIN2BQ13224 1484 aa43.4■■■■■ 4.54
TRNP1-201ENST00000522111 CLIP1P30622 1438 aa43.29■■■■■ 4.52
TRNP1-201ENST00000522111 ADAMTS12P58397 1594 aa43.26■■■■■ 4.52
TRNP1-201ENST00000522111 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.21■■■■■ 4.51
TRNP1-201ENST00000522111 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.21■■■■■ 4.51
TRNP1-201ENST00000522111 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.1■■■■■ 4.49
TRNP1-201ENST00000522111 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.93■■■■■ 4.46
TRNP1-201ENST00000522111 SYNJ2O15056 1496 aa42.91■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms