RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412681.2

NRGN-202, Transcript of neurogranin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRGN, Length 1,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRGN-202ENST00000412681 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.71■■■■■ 8.75
NRGN-202ENST00000412681 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.34■■■■■ 7.57
NRGN-202ENST00000412681 ABCC9O60706 1549 aa61.52■■■■■ 7.44
NRGN-202ENST00000412681 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.94■■■■■ 7.03
NRGN-202ENST00000412681 NACADO15069 1562 aa58.71■■■■■ 6.99
NRGN-202ENST00000412681 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.4■■■■■ 6.94
NRGN-202ENST00000412681 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.16■■■■■ 6.9
NRGN-202ENST00000412681 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.94■■■■■ 6.87
NRGN-202ENST00000412681 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.72■■■■■ 6.83
NRGN-202ENST00000412681 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.66■■■■■ 6.82
NRGN-202ENST00000412681 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.33■■■■■ 6.77
NRGN-202ENST00000412681 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.21■■■■■ 6.75
NRGN-202ENST00000412681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.04■■■■■ 6.72
NRGN-202ENST00000412681 SCRIBQ14160 1630 aa56.77■■■■■ 6.68
NRGN-202ENST00000412681 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.52■■■■■ 6.64
NRGN-202ENST00000412681 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.74■■■■■ 6.51
NRGN-202ENST00000412681 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.68■■■■■ 6.5
NRGN-202ENST00000412681 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.36■■■■■ 6.45
NRGN-202ENST00000412681 SMARCA4P51532 1647 aa54.26■■■■■ 6.28
NRGN-202ENST00000412681 NCAPD3P42695 1498 aa54.16■■■■■ 6.26
NRGN-202ENST00000412681 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.09■■■■■ 6.25
NRGN-202ENST00000412681 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.08■■■■■ 6.25
NRGN-202ENST00000412681 SMARCA2P51531 1590 aa54.01■■■■■ 6.24
NRGN-202ENST00000412681 HMGXB3Q12766 1538 aa53.87■■■■■ 6.21
NRGN-202ENST00000412681 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.75■■■■■ 6.2
NRGN-202ENST00000412681 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.71■■■■■ 6.19
NRGN-202ENST00000412681 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.61■■■■■ 6.17
NRGN-202ENST00000412681 WIZO95785 1651 aa53.15■■■■■ 6.1
NRGN-202ENST00000412681 ERCC6Q03468 1493 aa53.07■■■■■ 6.09
NRGN-202ENST00000412681 NESP48681 1621 aa53.06■■■■■ 6.09
NRGN-202ENST00000412681 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.87■■■■■ 6.05
NRGN-202ENST00000412681 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.83■■■■■ 6.05
NRGN-202ENST00000412681 CUX2O14529 1486 aa52.78■■■■■ 6.04
NRGN-202ENST00000412681 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.52■■■■■ 6
NRGN-202ENST00000412681 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.51■■■■■ 6
NRGN-202ENST00000412681 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.5■■■■■ 5.99
NRGN-202ENST00000412681 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.48■■■■■ 5.99
NRGN-202ENST00000412681 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.47■■■■■ 5.99
NRGN-202ENST00000412681 CFTRP13569 1480 aa52.1■■■■■ 5.93
NRGN-202ENST00000412681 MRC2Q9UBG0 1479 aa52■■■■■ 5.92
NRGN-202ENST00000412681 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.94■■■■■ 5.91
NRGN-202ENST00000412681 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.93■■■■■ 5.9
NRGN-202ENST00000412681 WDR62O43379 1518 aa51.89■■■■■ 5.9
NRGN-202ENST00000412681 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.87■■■■■ 5.89
NRGN-202ENST00000412681 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.87■■■■■ 5.89
NRGN-202ENST00000412681 PRDM2Q13029 1718 aa51.79■■■■■ 5.88
NRGN-202ENST00000412681 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.48■■■■■ 5.83
NRGN-202ENST00000412681 TOPBP1Q92547 1522 aa51.05■■■■■ 5.76
NRGN-202ENST00000412681 ABCC8Q09428 1581 aa51■■■■■ 5.75
NRGN-202ENST00000412681 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.95■■■■■ 5.75
NRGN-202ENST00000412681 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.94■■■■■ 5.75
NRGN-202ENST00000412681 IFT140Q96RY7 1462 aa50.87■■■■■ 5.73
NRGN-202ENST00000412681 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.71■■■■■ 5.71
NRGN-202ENST00000412681 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.58■■■■■ 5.69
NRGN-202ENST00000412681 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.57■■■■■ 5.69
NRGN-202ENST00000412681 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.53■■■■■ 5.68
NRGN-202ENST00000412681 CUX1P39880 1505 aa50.43■■■■■ 5.66
NRGN-202ENST00000412681 OSCARQ8IYS5 282 aa50.42■■■■■ 5.66
NRGN-202ENST00000412681 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.35■■■■■ 5.65
NRGN-202ENST00000412681 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.34■■■■■ 5.65
NRGN-202ENST00000412681 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.33■■■■■ 5.652e-8■■■■■ 43.9
NRGN-202ENST00000412681 SOGA1O94964 1423 aa50.32■■■■■ 5.65
NRGN-202ENST00000412681 WDR97A6NE52 1622 aa50.15■■■■■ 5.62
NRGN-202ENST00000412681 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.11■■■■■ 5.61
NRGN-202ENST00000412681 CHD1O14646 1710 aa50.05■■■■■ 5.6
NRGN-202ENST00000412681 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.88■■■■■ 5.58
NRGN-202ENST00000412681 TRIM41Q8WV44 630 aa49.86■■■■■ 5.57
NRGN-202ENST00000412681 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.86■■■■■ 5.57
NRGN-202ENST00000412681 TOP2BQ02880 1626 aa49.85■■■■■ 5.57
NRGN-202ENST00000412681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.84■■■■■ 5.57
NRGN-202ENST00000412681 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.84■■■■■ 5.57
NRGN-202ENST00000412681 GRIN2BQ13224 1484 aa49.82■■■■■ 5.57
NRGN-202ENST00000412681 SYNJ1O43426 1573 aa49.8■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 FBLN2P98095 1184 aa49.79■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 PBRM1Q86U86 1689 aa49.78■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.78■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.78■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.78■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
NRGN-202ENST00000412681 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.75■■■■■ 5.55
NRGN-202ENST00000412681 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.74■■■■■ 5.55
NRGN-202ENST00000412681 ARHGEF11O15085 1522 aa49.66■■■■■ 5.54
NRGN-202ENST00000412681 SYNJ2O15056 1496 aa49.59■■■■■ 5.53
NRGN-202ENST00000412681 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.57■■■■■ 5.53
NRGN-202ENST00000412681 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.45■■■■■ 5.51
NRGN-202ENST00000412681 ADAMTS12P58397 1594 aa49.3■■■■■ 5.48
NRGN-202ENST00000412681 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.24■■■■■ 5.47
NRGN-202ENST00000412681 ARAP1Q96P48 1450 aa49.22■■■■■ 5.47
NRGN-202ENST00000412681 GRIN2AQ12879 1464 aa49.2■■■■■ 5.47
NRGN-202ENST00000412681 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.17■■■■■ 5.46
NRGN-202ENST00000412681 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.14■■■■■ 5.46
NRGN-202ENST00000412681 NUP160Q12769 1436 aa49.01■■■■■ 5.44
NRGN-202ENST00000412681 CEP170Q5SW79 1584 aa49.01■■■■■ 5.44
NRGN-202ENST00000412681 KIF27Q86VH2 1401 aa48.83■■■■■ 5.41
NRGN-202ENST00000412681 SHROOM2Q13796 1616 aa48.77■■■■■ 5.4
NRGN-202ENST00000412681 IGF1RP08069 1367 aa48.71■■■■■ 5.39
NRGN-202ENST00000412681 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.71■■■■■ 5.39
NRGN-202ENST00000412681 CUL7Q14999 1698 aa48.7■■■■■ 5.39
NRGN-202ENST00000412681 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.59■■■■■ 5.37
NRGN-202ENST00000412681 JPH4Q96JJ6 628 aa48.45■■■■■ 5.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms