Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLIN3O60664 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLIN3O60664 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN3O60664 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN3O60664 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN3O60664 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLIN3O60664 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLIN3O60664 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLIN3O60664 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN3O60664 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms