Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLIN3O60664 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PLIN3O60664 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PLIN3O60664 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN3O60664 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PLIN3O60664 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PLIN3O60664 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PLIN3O60664 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PLIN3O60664 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PLIN3O60664 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PLIN3O60664 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PLIN3O60664 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PLIN3O60664 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN3O60664 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN3O60664 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PLIN3O60664 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN3O60664 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLIN3O60664 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PLIN3O60664 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PLIN3O60664 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PLIN3O60664 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLIN3O60664 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLIN3O60664 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PLIN3O60664 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PLIN3O60664 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN3O60664 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLIN3O60664 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PLIN3O60664 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PLIN3O60664 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLIN3O60664 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLIN3O60664 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN3O60664 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN3O60664 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLIN3O60664 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLIN3O60664 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLIN3O60664 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLIN3O60664 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLIN3O60664 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLIN3O60664 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN3O60664 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN3O60664 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN3O60664 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLIN3O60664 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PLIN3O60664 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLIN3O60664 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLIN3O60664 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLIN3O60664 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLIN3O60664 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLIN3O60664 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN3O60664 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLIN3O60664 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLIN3O60664 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLIN3O60664 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLIN3O60664 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLIN3O60664 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLIN3O60664 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN3O60664 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN3O60664 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN3O60664 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN3O60664 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLIN3O60664 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN3O60664 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN3O60664 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN3O60664 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN3O60664 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN3O60664 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN3O60664 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN3O60664 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN3O60664 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN3O60664 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN3O60664 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN3O60664 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN3O60664 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLIN3O60664 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN3O60664 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN3O60664 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN3O60664 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN3O60664 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN3O60664 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN3O60664 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN3O60664 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN3O60664 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLIN3O60664 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLIN3O60664 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN3O60664 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLIN3O60664 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLIN3O60664 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLIN3O60664 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLIN3O60664 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLIN3O60664 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLIN3O60664 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLIN3O60664 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLIN3O60664 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLIN3O60664 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms