Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC17Q8N6Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC17Q8N6Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC17Q8N6Y2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC17Q8N6Y2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC17Q8N6Y2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms