RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369642.7

RHOC-208, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOC, Length 1,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOC-208ENST00000369642 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.01■■■■■ 8.16
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RHOC-208ENST00000369642 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.11■■■■■ 6.41
RHOC-208ENST00000369642 NACADO15069 1562 aa55.09■■■■■ 6.41
RHOC-208ENST00000369642 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.06■■■■■ 6.4
RHOC-208ENST00000369642 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.93■■■■■ 6.38
RHOC-208ENST00000369642 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.84■■■■■ 6.37
RHOC-208ENST00000369642 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.65■■■■■ 6.34
RHOC-208ENST00000369642 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.88■■■■■ 6.22
RHOC-208ENST00000369642 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.51■■■■■ 6.16
RHOC-208ENST00000369642 SCRIBQ14160 1630 aa53.5■■■■■ 6.16
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RHOC-208ENST00000369642 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.95■■■■■ 6.07
RHOC-208ENST00000369642 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.43■■■■■ 5.98
RHOC-208ENST00000369642 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.06■■■■■ 5.92
RHOC-208ENST00000369642 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.79■■■■■ 5.88
RHOC-208ENST00000369642 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.42■■■■■ 5.82
RHOC-208ENST00000369642 SMARCA4P51532 1647 aa51.21■■■■■ 5.79
RHOC-208ENST00000369642 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.15■■■■■ 5.78
RHOC-208ENST00000369642 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.9■■■■■ 5.74
RHOC-208ENST00000369642 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.89■■■■■ 5.74
RHOC-208ENST00000369642 NCAPD3P42695 1498 aa50.84■■■■■ 5.73
RHOC-208ENST00000369642 SMARCA2P51531 1590 aa50.82■■■■■ 5.73
RHOC-208ENST00000369642 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.74■■■■■ 5.71
RHOC-208ENST00000369642 HMGXB3Q12766 1538 aa50.63■■■■■ 5.7
RHOC-208ENST00000369642 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
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RHOC-208ENST00000369642 WIZO95785 1651 aa50.32■■■■■ 5.65
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RHOC-208ENST00000369642 NESP48681 1621 aa49.59■■■■■ 5.53
RHOC-208ENST00000369642 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.48■■■■■ 5.51
RHOC-208ENST00000369642 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.35■■■■■ 5.49
RHOC-208ENST00000369642 ERCC6Q03468 1493 aa49.29■■■■■ 5.48
RHOC-208ENST00000369642 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.21■■■■■ 5.47
RHOC-208ENST00000369642 CFTRP13569 1480 aa49.11■■■■■ 5.45
RHOC-208ENST00000369642 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.1■■■■■ 5.45
RHOC-208ENST00000369642 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
RHOC-208ENST00000369642 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49■■■■■ 5.43
RHOC-208ENST00000369642 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.85■■■■■ 5.41
RHOC-208ENST00000369642 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.79■■■■■ 5.4
RHOC-208ENST00000369642 CUX2O14529 1486 aa48.78■■■■■ 5.4
RHOC-208ENST00000369642 PRDM2Q13029 1718 aa48.72■■■■■ 5.39
RHOC-208ENST00000369642 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.72■■■■■ 5.39
RHOC-208ENST00000369642 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.64■■■■■ 5.38
RHOC-208ENST00000369642 WDR62O43379 1518 aa48.5■■■■■ 5.35
RHOC-208ENST00000369642 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
RHOC-208ENST00000369642 TOPBP1Q92547 1522 aa48.04■■■■■ 5.28
RHOC-208ENST00000369642 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48■■■■■ 5.27
RHOC-208ENST00000369642 ABCC8Q09428 1581 aa47.99■■■■■ 5.27
RHOC-208ENST00000369642 CUX1P39880 1505 aa47.73■■■■■ 5.23
RHOC-208ENST00000369642 IFT140Q96RY7 1462 aa47.69■■■■■ 5.23
RHOC-208ENST00000369642 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
RHOC-208ENST00000369642 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.54■■■■■ 5.2
RHOC-208ENST00000369642 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.52■■■■■ 5.2
RHOC-208ENST00000369642 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.49■■■■■ 5.19
RHOC-208ENST00000369642 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.44■■■■■ 5.186e-6■■■□□ 16.7
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RHOC-208ENST00000369642 SOGA1O94964 1423 aa47.39■■■■■ 5.18
RHOC-208ENST00000369642 SYNJ1O43426 1573 aa47.35■■■■■ 5.17
RHOC-208ENST00000369642 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.35■■■■■ 5.17
RHOC-208ENST00000369642 TOP2BQ02880 1626 aa47.34■■■■■ 5.17
RHOC-208ENST00000369642 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
RHOC-208ENST00000369642 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.2■■■■■ 5.154e-7■■■■■ 38.2
RHOC-208ENST00000369642 WDR97A6NE52 1622 aa47.18■■■■■ 5.14
RHOC-208ENST00000369642 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.13
RHOC-208ENST00000369642 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.1■■■■■ 5.13
RHOC-208ENST00000369642 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.1■■■■■ 5.13
RHOC-208ENST00000369642 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.92■■■■■ 5.1
RHOC-208ENST00000369642 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.87■■■■■ 5.09
RHOC-208ENST00000369642 GRIN2BQ13224 1484 aa46.86■■■■■ 5.09
RHOC-208ENST00000369642 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.79■■■■■ 5.08
RHOC-208ENST00000369642 PBRM1Q86U86 1689 aa46.78■■■■■ 5.08
RHOC-208ENST00000369642 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
RHOC-208ENST00000369642 OSCARQ8IYS5 282 aa46.69■■■■■ 5.06
RHOC-208ENST00000369642 CHD1O14646 1710 aa46.66■■■■■ 5.06
RHOC-208ENST00000369642 SYNJ2O15056 1496 aa46.55■■■■■ 5.04
RHOC-208ENST00000369642 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.52■■■■■ 5.04
RHOC-208ENST00000369642 FBLN2P98095 1184 aa46.51■■■■■ 5.04
RHOC-208ENST00000369642 ADAMTS12P58397 1594 aa46.47■■■■■ 5.03
RHOC-208ENST00000369642 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
RHOC-208ENST00000369642 KIF27Q86VH2 1401 aa46.42■■■■■ 5.02
RHOC-208ENST00000369642 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.34■■■■■ 5.01
RHOC-208ENST00000369642 TRIM41Q8WV44 630 aa46.3■■■■■ 5
RHOC-208ENST00000369642 GRIN2AQ12879 1464 aa46.27■■■■■ 5
RHOC-208ENST00000369642 IGF1RP08069 1367 aa46.22■■■■■ 4.99
RHOC-208ENST00000369642 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.21■■■■■ 4.99
RHOC-208ENST00000369642 CUL7Q14999 1698 aa46.11■■■■■ 4.97
RHOC-208ENST00000369642 NUP160Q12769 1436 aa46.09■■■■■ 4.97
RHOC-208ENST00000369642 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.07■■■■■ 4.96
RHOC-208ENST00000369642 CEP170Q5SW79 1584 aa46.06■■■■■ 4.96
RHOC-208ENST00000369642 ARHGEF11O15085 1522 aa46.04■■■■■ 4.96
RHOC-208ENST00000369642 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.02■■■■■ 4.96
RHOC-208ENST00000369642 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.02■■■■■ 4.96
RHOC-208ENST00000369642 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.02■■■■■ 4.96
RHOC-208ENST00000369642 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.93■■■■■ 4.94
RHOC-208ENST00000369642 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.86■■■■■ 4.93
RHOC-208ENST00000369642 SHROOM2Q13796 1616 aa45.73■■■■■ 4.91
RHOC-208ENST00000369642 ARAP1Q96P48 1450 aa45.69■■■■■ 4.9
RHOC-208ENST00000369642 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.69■■■■■ 4.9
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