RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297303.4

XKR6-201, Transcript of XK related 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene XKR6, Length 1,550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR6-201ENST00000297303 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.12■■■■■ 7.53
XKR6-201ENST00000297303 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.59■■■■■ 6.33
XKR6-201ENST00000297303 ABCC9O60706 1549 aa52.27■■■■■ 5.96
XKR6-201ENST00000297303 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.02■■■■■ 5.92
XKR6-201ENST00000297303 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.45■■■■■ 5.83
XKR6-201ENST00000297303 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.4■■■■■ 5.82
XKR6-201ENST00000297303 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.1■■■■■ 5.77
XKR6-201ENST00000297303 NACADO15069 1562 aa51.02■■■■■ 5.76
XKR6-201ENST00000297303 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.76■■■■■ 5.72
XKR6-201ENST00000297303 SCRIBQ14160 1630 aa50.02■■■■■ 5.6
XKR6-201ENST00000297303 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.99■■■■■ 5.59
XKR6-201ENST00000297303 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.75■■■■■ 5.55
XKR6-201ENST00000297303 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.25■■■■■ 5.48
XKR6-201ENST00000297303 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.1■■■■■ 5.45
XKR6-201ENST00000297303 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.31■■■■■ 5.32
XKR6-201ENST00000297303 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
XKR6-201ENST00000297303 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.94■■■■■ 5.27
XKR6-201ENST00000297303 SMARCA4P51532 1647 aa47.93■■■■■ 5.26
XKR6-201ENST00000297303 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
XKR6-201ENST00000297303 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
XKR6-201ENST00000297303 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
XKR6-201ENST00000297303 WIZO95785 1651 aa47.52■■■■■ 5.2
XKR6-201ENST00000297303 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.41■■■■■ 5.18
XKR6-201ENST00000297303 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.33■■■■■ 5.17
XKR6-201ENST00000297303 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.32■■■■■ 5.17
XKR6-201ENST00000297303 SMARCA2P51531 1590 aa47.3■■■■■ 5.16
XKR6-201ENST00000297303 NCAPD3P42695 1498 aa47.08■■■■■ 5.13
XKR6-201ENST00000297303 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
XKR6-201ENST00000297303 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
XKR6-201ENST00000297303 HMGXB3Q12766 1538 aa46.95■■■■■ 5.11
XKR6-201ENST00000297303 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.85■■■■■ 5.09
XKR6-201ENST00000297303 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.5■■■■■ 5.03
XKR6-201ENST00000297303 CFTRP13569 1480 aa45.8■■■■■ 4.92
XKR6-201ENST00000297303 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.8■■■■■ 4.92
XKR6-201ENST00000297303 NESP48681 1621 aa45.64■■■■■ 4.9
XKR6-201ENST00000297303 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.62■■■■■ 4.89
XKR6-201ENST00000297303 PRDM2Q13029 1718 aa45.57■■■■■ 4.89
XKR6-201ENST00000297303 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.28■■■■■ 4.84
XKR6-201ENST00000297303 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.27■■■■■ 4.84
XKR6-201ENST00000297303 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.26■■■■■ 4.84
XKR6-201ENST00000297303 ABCC8Q09428 1581 aa45.24■■■■■ 4.83
XKR6-201ENST00000297303 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.13■■■■■ 4.82
XKR6-201ENST00000297303 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.08■■■■■ 4.81
XKR6-201ENST00000297303 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.06■■■■■ 4.8
XKR6-201ENST00000297303 TRIM41Q8WV44 630 aa44.93■■■■■ 4.78
XKR6-201ENST00000297303 SYNJ1O43426 1573 aa44.92■■■■■ 4.78
XKR6-201ENST00000297303 ERCC6Q03468 1493 aa44.89■■■■■ 4.78
XKR6-201ENST00000297303 CUX1P39880 1505 aa44.89■■■■■ 4.78
XKR6-201ENST00000297303 TOP2BQ02880 1626 aa44.82■■■■■ 4.77
XKR6-201ENST00000297303 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.8■■■■■ 4.76
XKR6-201ENST00000297303 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
XKR6-201ENST00000297303 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.75■■■■■ 4.75
XKR6-201ENST00000297303 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.74■■■■■ 4.75
XKR6-201ENST00000297303 TOPBP1Q92547 1522 aa44.71■■■■■ 4.75
XKR6-201ENST00000297303 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
XKR6-201ENST00000297303 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
XKR6-201ENST00000297303 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.51■■■■■ 4.72
XKR6-201ENST00000297303 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
XKR6-201ENST00000297303 SOGA1O94964 1423 aa44.26■■■■■ 4.68
XKR6-201ENST00000297303 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.26■■■■■ 4.68
XKR6-201ENST00000297303 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
XKR6-201ENST00000297303 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
XKR6-201ENST00000297303 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.12■■■■■ 4.65
XKR6-201ENST00000297303 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.11■■■■■ 4.65
XKR6-201ENST00000297303 WDR97A6NE52 1622 aa44.09■■■■■ 4.65
XKR6-201ENST00000297303 IFT140Q96RY7 1462 aa44.06■■■■■ 4.64
XKR6-201ENST00000297303 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
XKR6-201ENST00000297303 EEA1Q15075 1411 aa43.99■■■■■ 4.63
XKR6-201ENST00000297303 KIF27Q86VH2 1401 aa43.99■■■■■ 4.63
XKR6-201ENST00000297303 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
XKR6-201ENST00000297303 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.85■■■■■ 4.61
XKR6-201ENST00000297303 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
XKR6-201ENST00000297303 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.81■■■■■ 4.6
XKR6-201ENST00000297303 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.77■■■■■ 4.6
XKR6-201ENST00000297303 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.6
XKR6-201ENST00000297303 IGF1RP08069 1367 aa43.7■■■■■ 4.59
XKR6-201ENST00000297303 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
XKR6-201ENST00000297303 PBRM1Q86U86 1689 aa43.62■■■■■ 4.57
XKR6-201ENST00000297303 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.6■■■■■ 4.57
XKR6-201ENST00000297303 GRIN2BQ13224 1484 aa43.55■■■■■ 4.56
XKR6-201ENST00000297303 PRXQ9BXM0 1461 aa43.51■■■■■ 4.56
XKR6-201ENST00000297303 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.48■■■■■ 4.55
XKR6-201ENST00000297303 KIF21BO75037 1637 aa43.48■■■■■ 4.55
XKR6-201ENST00000297303 CUL7Q14999 1698 aa43.46■■■■■ 4.55
XKR6-201ENST00000297303 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.45■■■■■ 4.55
XKR6-201ENST00000297303 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.42■■■■■ 4.54
XKR6-201ENST00000297303 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.36■■■■■ 4.53
XKR6-201ENST00000297303 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.36■■■■■ 4.53
XKR6-201ENST00000297303 GOLGA3Q08378 1498 aa43.33■■■■■ 4.53
XKR6-201ENST00000297303 ADAMTS12P58397 1594 aa43.32■■■■■ 4.53
XKR6-201ENST00000297303 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
XKR6-201ENST00000297303 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.28■■■■■ 4.52
XKR6-201ENST00000297303 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
XKR6-201ENST00000297303 SYNJ2O15056 1496 aa43.13■■■■■ 4.49
XKR6-201ENST00000297303 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.04■■■■■ 4.48
XKR6-201ENST00000297303 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
XKR6-201ENST00000297303 GRIN2AQ12879 1464 aa43.02■■■■■ 4.48
XKR6-201ENST00000297303 FBLN2P98095 1184 aa42.98■■■■■ 4.47
XKR6-201ENST00000297303 CHD1O14646 1710 aa42.92■■■■■ 4.46
XKR6-201ENST00000297303 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.87■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms