RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306730.7

AVEN-201, Transcript of apoptosis and caspase activation inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AVEN, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVEN-201ENST00000306730 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.92■■■■■ 7.5
AVEN-201ENST00000306730 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.32■■■■■ 6.29
AVEN-201ENST00000306730 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.89■■■■■ 5.9
AVEN-201ENST00000306730 ABCC9O60706 1549 aa51.76■■■■■ 5.88
AVEN-201ENST00000306730 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.29■■■■■ 5.8
AVEN-201ENST00000306730 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.16■■■■■ 5.78
AVEN-201ENST00000306730 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.94■■■■■ 5.75
AVEN-201ENST00000306730 NACADO15069 1562 aa50.74■■■■■ 5.71
AVEN-201ENST00000306730 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.42■■■■■ 5.66
AVEN-201ENST00000306730 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.88■■■■■ 5.57
AVEN-201ENST00000306730 SCRIBQ14160 1630 aa49.72■■■■■ 5.55
AVEN-201ENST00000306730 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.29■■■■■ 5.48
AVEN-201ENST00000306730 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.88■■■■■ 5.41
AVEN-201ENST00000306730 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.65■■■■■ 5.38
AVEN-201ENST00000306730 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.09■■■■■ 5.29
AVEN-201ENST00000306730 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.87■■■■■ 5.25
AVEN-201ENST00000306730 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
AVEN-201ENST00000306730 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.76■■■■■ 5.24
AVEN-201ENST00000306730 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
AVEN-201ENST00000306730 SMARCA4P51532 1647 aa47.7■■■■■ 5.23
AVEN-201ENST00000306730 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
AVEN-201ENST00000306730 WIZO95785 1651 aa47.31■■■■■ 5.16
AVEN-201ENST00000306730 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.22■■■■■ 5.15
AVEN-201ENST00000306730 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.08■■■■■ 5.13
AVEN-201ENST00000306730 SMARCA2P51531 1590 aa47.08■■■■■ 5.13
AVEN-201ENST00000306730 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.1
AVEN-201ENST00000306730 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.87■■■■■ 5.09
AVEN-201ENST00000306730 NCAPD3P42695 1498 aa46.83■■■■■ 5.09
AVEN-201ENST00000306730 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
AVEN-201ENST00000306730 HMGXB3Q12766 1538 aa46.71■■■■■ 5.07
AVEN-201ENST00000306730 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.36■■■■■ 5.01
AVEN-201ENST00000306730 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.17■■■■■ 4.98
AVEN-201ENST00000306730 CFTRP13569 1480 aa45.6■■■■■ 4.89
AVEN-201ENST00000306730 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.56■■■■■ 4.88
AVEN-201ENST00000306730 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.45■■■■■ 4.87
AVEN-201ENST00000306730 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.33■■■■■ 4.85
AVEN-201ENST00000306730 PRDM2Q13029 1718 aa45.31■■■■■ 4.84
AVEN-201ENST00000306730 NESP48681 1621 aa45.25■■■■■ 4.83
AVEN-201ENST00000306730 ABCC8Q09428 1581 aa45.12■■■■■ 4.81
AVEN-201ENST00000306730 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.01■■■■■ 4.8
AVEN-201ENST00000306730 TRIM41Q8WV44 630 aa45.01■■■■■ 4.8
AVEN-201ENST00000306730 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.99■■■■■ 4.79
AVEN-201ENST00000306730 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.99■■■■■ 4.79
AVEN-201ENST00000306730 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.8■■■■■ 4.76
AVEN-201ENST00000306730 SYNJ1O43426 1573 aa44.79■■■■■ 4.76
AVEN-201ENST00000306730 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.72■■■■■ 4.75
AVEN-201ENST00000306730 TOP2BQ02880 1626 aa44.71■■■■■ 4.75
AVEN-201ENST00000306730 CUX1P39880 1505 aa44.71■■■■■ 4.75
AVEN-201ENST00000306730 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.68■■■■■ 4.74
AVEN-201ENST00000306730 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.53■■■■■ 4.72
AVEN-201ENST00000306730 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
AVEN-201ENST00000306730 ERCC6Q03468 1493 aa44.47■■■■■ 4.71
AVEN-201ENST00000306730 TOPBP1Q92547 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
AVEN-201ENST00000306730 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.42■■■■■ 4.7
AVEN-201ENST00000306730 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.31■■■■■ 4.68
AVEN-201ENST00000306730 WDR62O43379 1518 aa44.23■■■■■ 4.67
AVEN-201ENST00000306730 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
AVEN-201ENST00000306730 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.67
AVEN-201ENST00000306730 SOGA1O94964 1423 aa44.18■■■■■ 4.66
AVEN-201ENST00000306730 EEA1Q15075 1411 aa44.09■■■■■ 4.65
AVEN-201ENST00000306730 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
AVEN-201ENST00000306730 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.02■■■■■ 4.64
AVEN-201ENST00000306730 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44■■■■■ 4.63
AVEN-201ENST00000306730 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.96■■■■■ 4.63
AVEN-201ENST00000306730 KIF27Q86VH2 1401 aa43.93■■■■■ 4.62
AVEN-201ENST00000306730 CUX2O14529 1486 aa43.91■■■■■ 4.62
AVEN-201ENST00000306730 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
AVEN-201ENST00000306730 WDR97A6NE52 1622 aa43.84■■■■■ 4.61
AVEN-201ENST00000306730 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.84■■■■■ 4.61
AVEN-201ENST00000306730 IFT140Q96RY7 1462 aa43.81■■■■■ 4.6
AVEN-201ENST00000306730 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
AVEN-201ENST00000306730 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.63■■■■■ 4.57
AVEN-201ENST00000306730 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.61■■■■■ 4.57
AVEN-201ENST00000306730 IGF1RP08069 1367 aa43.59■■■■■ 4.57
AVEN-201ENST00000306730 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.57■■■■■ 4.57
AVEN-201ENST00000306730 KIF21BO75037 1637 aa43.51■■■■■ 4.56
AVEN-201ENST00000306730 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
AVEN-201ENST00000306730 PRXQ9BXM0 1461 aa43.49■■■■■ 4.55
AVEN-201ENST00000306730 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.46■■■■■ 4.55
AVEN-201ENST00000306730 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.45■■■■■ 4.55
AVEN-201ENST00000306730 GOLGA3Q08378 1498 aa43.39■■■■■ 4.54
AVEN-201ENST00000306730 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.35■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.35■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 GRIN2BQ13224 1484 aa43.34■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 CUL7Q14999 1698 aa43.33■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 PBRM1Q86U86 1689 aa43.33■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.32■■■■■ 4.53
AVEN-201ENST00000306730 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
AVEN-201ENST00000306730 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.16■■■■■ 4.5
AVEN-201ENST00000306730 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.11■■■■■ 4.49
AVEN-201ENST00000306730 ADAMTS12P58397 1594 aa43.1■■■■■ 4.49
AVEN-201ENST00000306730 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.07■■■■■ 4.48
AVEN-201ENST00000306730 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
AVEN-201ENST00000306730 SYNJ2O15056 1496 aa42.88■■■■■ 4.45
AVEN-201ENST00000306730 CEP162Q5TB80 1403 aa42.83■■■■■ 4.45
AVEN-201ENST00000306730 GRIN2AQ12879 1464 aa42.8■■■■■ 4.44
AVEN-201ENST00000306730 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
AVEN-201ENST00000306730 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.71■■■■■ 4.43
AVEN-201ENST00000306730 CLIP1P30622 1438 aa42.66■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms