RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376371.6

GKAP1-203, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,778 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-203ENST00000376371 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.63■■■■■ 7.46
GKAP1-203ENST00000376371 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.05■■■■■ 6.24
GKAP1-203ENST00000376371 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.66■■■■■ 5.86
GKAP1-203ENST00000376371 ABCC9O60706 1549 aa51.61■■■■■ 5.85
GKAP1-203ENST00000376371 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.99■■■■■ 5.75
GKAP1-203ENST00000376371 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.96■■■■■ 5.75
GKAP1-203ENST00000376371 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.59■■■■■ 5.69
GKAP1-203ENST00000376371 NACADO15069 1562 aa50.46■■■■■ 5.67
GKAP1-203ENST00000376371 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.15■■■■■ 5.62
GKAP1-203ENST00000376371 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.78■■■■■ 5.56
GKAP1-203ENST00000376371 SCRIBQ14160 1630 aa49.59■■■■■ 5.53
GKAP1-203ENST00000376371 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.22■■■■■ 5.47
GKAP1-203ENST00000376371 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.73■■■■■ 5.39
GKAP1-203ENST00000376371 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.54■■■■■ 5.36
GKAP1-203ENST00000376371 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.96■■■■■ 5.27
GKAP1-203ENST00000376371 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
GKAP1-203ENST00000376371 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.61■■■■■ 5.21
GKAP1-203ENST00000376371 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
GKAP1-203ENST00000376371 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
GKAP1-203ENST00000376371 SMARCA4P51532 1647 aa47.52■■■■■ 5.2
GKAP1-203ENST00000376371 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
GKAP1-203ENST00000376371 WIZO95785 1651 aa47.19■■■■■ 5.15
GKAP1-203ENST00000376371 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.98■■■■■ 5.11
GKAP1-203ENST00000376371 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.87■■■■■ 5.09
GKAP1-203ENST00000376371 SMARCA2P51531 1590 aa46.82■■■■■ 5.08
GKAP1-203ENST00000376371 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.72■■■■■ 5.07
GKAP1-203ENST00000376371 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
GKAP1-203ENST00000376371 NCAPD3P42695 1498 aa46.57■■■■■ 5.05
GKAP1-203ENST00000376371 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
GKAP1-203ENST00000376371 HMGXB3Q12766 1538 aa46.46■■■■■ 5.03
GKAP1-203ENST00000376371 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.18■■■■■ 4.98
GKAP1-203ENST00000376371 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.12■■■■■ 4.97
GKAP1-203ENST00000376371 CFTRP13569 1480 aa45.37■■■■■ 4.85
GKAP1-203ENST00000376371 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.32■■■■■ 4.85
GKAP1-203ENST00000376371 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.27■■■■■ 4.84
GKAP1-203ENST00000376371 NESP48681 1621 aa45.16■■■■■ 4.82
GKAP1-203ENST00000376371 PRDM2Q13029 1718 aa45.15■■■■■ 4.82
GKAP1-203ENST00000376371 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.09■■■■■ 4.81
GKAP1-203ENST00000376371 ABCC8Q09428 1581 aa45.01■■■■■ 4.8
GKAP1-203ENST00000376371 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.82■■■■■ 4.77
GKAP1-203ENST00000376371 TRIM41Q8WV44 630 aa44.77■■■■■ 4.76
GKAP1-203ENST00000376371 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.76■■■■■ 4.76
GKAP1-203ENST00000376371 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.71■■■■■ 4.75
GKAP1-203ENST00000376371 SYNJ1O43426 1573 aa44.65■■■■■ 4.74
GKAP1-203ENST00000376371 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.63■■■■■ 4.73
GKAP1-203ENST00000376371 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.59■■■■■ 4.73
GKAP1-203ENST00000376371 CUX1P39880 1505 aa44.55■■■■■ 4.72
GKAP1-203ENST00000376371 TOP2BQ02880 1626 aa44.51■■■■■ 4.72
GKAP1-203ENST00000376371 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.5■■■■■ 4.71
GKAP1-203ENST00000376371 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
GKAP1-203ENST00000376371 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.32■■■■■ 4.69
GKAP1-203ENST00000376371 TOPBP1Q92547 1522 aa44.28■■■■■ 4.68
GKAP1-203ENST00000376371 ERCC6Q03468 1493 aa44.26■■■■■ 4.68
GKAP1-203ENST00000376371 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.21■■■■■ 4.67
GKAP1-203ENST00000376371 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.13■■■■■ 4.66
GKAP1-203ENST00000376371 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
GKAP1-203ENST00000376371 SOGA1O94964 1423 aa44.03■■■■■ 4.64
GKAP1-203ENST00000376371 WDR62O43379 1518 aa44.03■■■■■ 4.64
GKAP1-203ENST00000376371 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
GKAP1-203ENST00000376371 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
GKAP1-203ENST00000376371 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.94■■■■■ 4.62
GKAP1-203ENST00000376371 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.87■■■■■ 4.61
GKAP1-203ENST00000376371 EEA1Q15075 1411 aa43.77■■■■■ 4.6
GKAP1-203ENST00000376371 CUX2O14529 1486 aa43.76■■■■■ 4.6
GKAP1-203ENST00000376371 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.74■■■■■ 4.59
GKAP1-203ENST00000376371 WDR97A6NE52 1622 aa43.71■■■■■ 4.59
GKAP1-203ENST00000376371 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
GKAP1-203ENST00000376371 KIF27Q86VH2 1401 aa43.67■■■■■ 4.58
GKAP1-203ENST00000376371 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.61■■■■■ 4.57
GKAP1-203ENST00000376371 IFT140Q96RY7 1462 aa43.56■■■■■ 4.56
GKAP1-203ENST00000376371 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.51■■■■■ 4.56
GKAP1-203ENST00000376371 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
GKAP1-203ENST00000376371 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.46■■■■■ 4.55
GKAP1-203ENST00000376371 IGF1RP08069 1367 aa43.38■■■■■ 4.54
GKAP1-203ENST00000376371 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
GKAP1-203ENST00000376371 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.36■■■■■ 4.53
GKAP1-203ENST00000376371 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.32■■■■■ 4.53
GKAP1-203ENST00000376371 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.32■■■■■ 4.53
GKAP1-203ENST00000376371 KIF21BO75037 1637 aa43.29■■■■■ 4.52
GKAP1-203ENST00000376371 PRXQ9BXM0 1461 aa43.27■■■■■ 4.52
GKAP1-203ENST00000376371 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
GKAP1-203ENST00000376371 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.21■■■■■ 4.51
GKAP1-203ENST00000376371 PBRM1Q86U86 1689 aa43.21■■■■■ 4.51
GKAP1-203ENST00000376371 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.17■■■■■ 4.5
GKAP1-203ENST00000376371 GOLGA3Q08378 1498 aa43.16■■■■■ 4.5
GKAP1-203ENST00000376371 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.13■■■■■ 4.5
GKAP1-203ENST00000376371 GRIN2BQ13224 1484 aa43.11■■■■■ 4.49
GKAP1-203ENST00000376371 CUL7Q14999 1698 aa43.1■■■■■ 4.49
GKAP1-203ENST00000376371 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
GKAP1-203ENST00000376371 ADAMTS12P58397 1594 aa42.93■■■■■ 4.46
GKAP1-203ENST00000376371 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.91■■■■■ 4.46
GKAP1-203ENST00000376371 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.91■■■■■ 4.46
GKAP1-203ENST00000376371 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.87■■■■■ 4.45
GKAP1-203ENST00000376371 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
GKAP1-203ENST00000376371 SYNJ2O15056 1496 aa42.66■■■■■ 4.42
GKAP1-203ENST00000376371 CEP162Q5TB80 1403 aa42.64■■■■■ 4.42
GKAP1-203ENST00000376371 GRIN2AQ12879 1464 aa42.59■■■■■ 4.41
GKAP1-203ENST00000376371 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.57■■■■■ 4.4
GKAP1-203ENST00000376371 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
GKAP1-203ENST00000376371 FBLN2P98095 1184 aa42.48■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms