RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.54■■■■■ 8.72
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HOXB3-211ENST00000490677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.93■■■■■ 7.02
HOXB3-211ENST00000490677 NACADO15069 1562 aa58.67■■■■■ 6.98
HOXB3-211ENST00000490677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.14■■■■■ 6.9
HOXB3-211ENST00000490677 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.07■■■■■ 6.89
HOXB3-211ENST00000490677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.89■■■■■ 6.86
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HOXB3-211ENST00000490677 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.51■■■■■ 6.8
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.45■■■■■ 6.79
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HOXB3-211ENST00000490677 SCRIBQ14160 1630 aa56.68■■■■■ 6.66
HOXB3-211ENST00000490677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.51■■■■■ 6.64
HOXB3-211ENST00000490677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.82■■■■■ 6.53
HOXB3-211ENST00000490677 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.81■■■■■ 6.52
HOXB3-211ENST00000490677 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.47■■■■■ 6.47
HOXB3-211ENST00000490677 SMARCA4P51532 1647 aa54.19■■■■■ 6.26
HOXB3-211ENST00000490677 NCAPD3P42695 1498 aa54.15■■■■■ 6.26
HOXB3-211ENST00000490677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.05■■■■■ 6.24
HOXB3-211ENST00000490677 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.91■■■■■ 6.22
HOXB3-211ENST00000490677 SMARCA2P51531 1590 aa53.91■■■■■ 6.22
HOXB3-211ENST00000490677 HMGXB3Q12766 1538 aa53.83■■■■■ 6.21
HOXB3-211ENST00000490677 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.7■■■■■ 6.19
HOXB3-211ENST00000490677 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.61■■■■■ 6.17
HOXB3-211ENST00000490677 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.49■■■■■ 6.15
HOXB3-211ENST00000490677 NESP48681 1621 aa53.16■■■■■ 6.1
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HOXB3-211ENST00000490677 WIZO95785 1651 aa53.03■■■■■ 6.08
HOXB3-211ENST00000490677 CUX2O14529 1486 aa52.94■■■■■ 6.07
HOXB3-211ENST00000490677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.87■■■■■ 6.05
HOXB3-211ENST00000490677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.63■■■■■ 6.02
HOXB3-211ENST00000490677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.62■■■■■ 6.01
HOXB3-211ENST00000490677 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.61■■■■■ 6.01
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HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.31■■■■■ 5.96
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HOXB3-211ENST00000490677 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.01■■■■■ 5.92
HOXB3-211ENST00000490677 WDR62O43379 1518 aa51.95■■■■■ 5.91
HOXB3-211ENST00000490677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.88■■■■■ 5.9
HOXB3-211ENST00000490677 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.87■■■■■ 5.89
HOXB3-211ENST00000490677 PRDM2Q13029 1718 aa51.76■■■■■ 5.88
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.71■■■■■ 5.87
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HOXB3-211ENST00000490677 TOPBP1Q92547 1522 aa51■■■■■ 5.75
HOXB3-211ENST00000490677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.87■■■■■ 5.73
HOXB3-211ENST00000490677 ABCC8Q09428 1581 aa50.85■■■■■ 5.73
HOXB3-211ENST00000490677 IFT140Q96RY7 1462 aa50.82■■■■■ 5.73
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.76■■■■■ 5.72
HOXB3-211ENST00000490677 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.62■■■■■ 5.69
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HOXB3-211ENST00000490677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.51■■■■■ 5.68
HOXB3-211ENST00000490677 OSCARQ8IYS5 282 aa50.46■■■■■ 5.67
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HOXB3-211ENST00000490677 SOGA1O94964 1423 aa50.19■■■■■ 5.63
HOXB3-211ENST00000490677 CHD1O14646 1710 aa50.16■■■■■ 5.62
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM41Q8WV44 630 aa50.08■■■■■ 5.61
HOXB3-211ENST00000490677 WDR97A6NE52 1622 aa50.07■■■■■ 5.61
HOXB3-211ENST00000490677 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
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HOXB3-211ENST00000490677 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.99■■■■■ 5.59
HOXB3-211ENST00000490677 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.99■■■■■ 5.59
HOXB3-211ENST00000490677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.82■■■■■ 5.57
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGEF11O15085 1522 aa49.82■■■■■ 5.57
HOXB3-211ENST00000490677 PBRM1Q86U86 1689 aa49.75■■■■■ 5.55
HOXB3-211ENST00000490677 GRIN2BQ13224 1484 aa49.73■■■■■ 5.55
HOXB3-211ENST00000490677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.73■■■■■ 5.55
HOXB3-211ENST00000490677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.72■■■■■ 5.55
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HOXB3-211ENST00000490677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.7■■■■■ 5.55
HOXB3-211ENST00000490677 TOP2BQ02880 1626 aa49.67■■■■■ 5.54
HOXB3-211ENST00000490677 FBLN2P98095 1184 aa49.67■■■■■ 5.54
HOXB3-211ENST00000490677 SYNJ1O43426 1573 aa49.64■■■■■ 5.54
HOXB3-211ENST00000490677 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.63■■■■■ 5.53
HOXB3-211ENST00000490677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.57■■■■■ 5.53
HOXB3-211ENST00000490677 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.55■■■■■ 5.52
HOXB3-211ENST00000490677 SYNJ2O15056 1496 aa49.53■■■■■ 5.52
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.43■■■■■ 5.5
HOXB3-211ENST00000490677 ARAP1Q96P48 1450 aa49.38■■■■■ 5.5
HOXB3-211ENST00000490677 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.25■■■■■ 5.47
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS12P58397 1594 aa49.24■■■■■ 5.47
HOXB3-211ENST00000490677 GRIN2AQ12879 1464 aa49.14■■■■■ 5.46
HOXB3-211ENST00000490677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.1■■■■■ 5.45
HOXB3-211ENST00000490677 CEP170Q5SW79 1584 aa49.02■■■■■ 5.44
HOXB3-211ENST00000490677 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49■■■■■ 5.44
HOXB3-211ENST00000490677 NUP160Q12769 1436 aa48.99■■■■■ 5.43
HOXB3-211ENST00000490677 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.82■■■■■ 5.41
HOXB3-211ENST00000490677 SHROOM2Q13796 1616 aa48.82■■■■■ 5.41
HOXB3-211ENST00000490677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.56■■■■■ 5.36
HOXB3-211ENST00000490677 KIF27Q86VH2 1401 aa48.55■■■■■ 5.36
HOXB3-211ENST00000490677 IGF1RP08069 1367 aa48.54■■■■■ 5.36
HOXB3-211ENST00000490677 CUL7Q14999 1698 aa48.52■■■■■ 5.36
HOXB3-211ENST00000490677 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
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