RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-215ENST00000626257 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.75■■■■■ 6.52
CCZ1B-215ENST00000626257 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.8■■■■■ 5.24
CCZ1B-215ENST00000626257 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
CCZ1B-215ENST00000626257 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
CCZ1B-215ENST00000626257 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.03■■■■■ 4.96
CCZ1B-215ENST00000626257 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
CCZ1B-215ENST00000626257 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.87■■■■■ 4.93
CCZ1B-215ENST00000626257 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.84■■■■■ 4.77
CCZ1B-215ENST00000626257 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.65■■■■■ 4.74
CCZ1B-215ENST00000626257 SCRIBQ14160 1630 aa44.43■■■■■ 4.7
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCC9O60706 1549 aa44.38■■■■■ 4.7
CCZ1B-215ENST00000626257 NACADO15069 1562 aa44.27■■■■■ 4.68
CCZ1B-215ENST00000626257 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.63
CCZ1B-215ENST00000626257 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.66■■■■■ 4.58
CCZ1B-215ENST00000626257 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.41■■■■■ 4.54
CCZ1B-215ENST00000626257 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.27■■■■■ 4.52
CCZ1B-215ENST00000626257 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.2■■■■■ 4.51
CCZ1B-215ENST00000626257 WIZO95785 1651 aa43.01■■■■■ 4.48
CCZ1B-215ENST00000626257 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.98■■■■■ 4.47
CCZ1B-215ENST00000626257 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
CCZ1B-215ENST00000626257 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
CCZ1B-215ENST00000626257 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.81■■■■■ 4.44
CCZ1B-215ENST00000626257 HRCP23327 699 aa42.67■■■■■ 4.42
CCZ1B-215ENST00000626257 SMARCA4P51532 1647 aa42.53■■■■■ 4.4
CCZ1B-215ENST00000626257 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
CCZ1B-215ENST00000626257 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.44■■■■■ 4.38
CCZ1B-215ENST00000626257 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
CCZ1B-215ENST00000626257 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
CCZ1B-215ENST00000626257 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
CCZ1B-215ENST00000626257 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.17■■■■■ 4.34
CCZ1B-215ENST00000626257 SMARCA2P51531 1590 aa42.14■■■■■ 4.34
CCZ1B-215ENST00000626257 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.14■■■■■ 4.34
CCZ1B-215ENST00000626257 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.98■■■■■ 4.31
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCC8Q09428 1581 aa41.88■■■■■ 4.29
CCZ1B-215ENST00000626257 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.81■■■■■ 4.28
CCZ1B-215ENST00000626257 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CCZ1B-215ENST00000626257 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
CCZ1B-215ENST00000626257 SOGA1O94964 1423 aa41.43■■■■■ 4.22
CCZ1B-215ENST00000626257 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
CCZ1B-215ENST00000626257 EEA1Q15075 1411 aa41.31■■■■■ 4.2
CCZ1B-215ENST00000626257 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
CCZ1B-215ENST00000626257 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.22■■■■■ 4.19
CCZ1B-215ENST00000626257 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.2■■■■■ 4.19
CCZ1B-215ENST00000626257 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
CCZ1B-215ENST00000626257 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.13■■■■■ 4.17
CCZ1B-215ENST00000626257 CEP162Q5TB80 1403 aa41.11■■■■■ 4.17
CCZ1B-215ENST00000626257 SYNJ1O43426 1573 aa41.1■■■■■ 4.17
CCZ1B-215ENST00000626257 GOLGA3Q08378 1498 aa40.95■■■■■ 4.15
CCZ1B-215ENST00000626257 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CCZ1B-215ENST00000626257 HMGXB3Q12766 1538 aa40.91■■■■■ 4.14
CCZ1B-215ENST00000626257 NCAPD3P42695 1498 aa40.87■■■■■ 4.13
CCZ1B-215ENST00000626257 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.77■■■■■ 4.12
CCZ1B-215ENST00000626257 KIF21BO75037 1637 aa40.75■■■■■ 4.11
CCZ1B-215ENST00000626257 TOP2BQ02880 1626 aa40.68■■■■■ 4.1
CCZ1B-215ENST00000626257 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
CCZ1B-215ENST00000626257 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.56■■■■■ 4.08
CCZ1B-215ENST00000626257 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
CCZ1B-215ENST00000626257 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.46■■■■■ 4.07
CCZ1B-215ENST00000626257 CLIP1P30622 1438 aa40.43■■■■■ 4.06
CCZ1B-215ENST00000626257 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
CCZ1B-215ENST00000626257 CFTRP13569 1480 aa40.36■■■■■ 4.05
CCZ1B-215ENST00000626257 CUX1P39880 1505 aa40.32■■■■■ 4.05
CCZ1B-215ENST00000626257 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.24■■■■■ 4.03
CCZ1B-215ENST00000626257 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.19■■■■■ 4.02
CCZ1B-215ENST00000626257 PRXQ9BXM0 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
CCZ1B-215ENST00000626257 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.17■■■■■ 4.02
CCZ1B-215ENST00000626257 PRDM2Q13029 1718 aa40.16■■■■■ 4.02
CCZ1B-215ENST00000626257 KIF27Q86VH2 1401 aa40.06■■■■■ 4
CCZ1B-215ENST00000626257 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CCZ1B-215ENST00000626257 APLP2Q06481 763 aa39.96■■■■□ 3.99
CCZ1B-215ENST00000626257 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.95■■■■□ 3.99
CCZ1B-215ENST00000626257 ARAP1Q96P48 1450 aa39.84■■■■□ 3.97
CCZ1B-215ENST00000626257 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
CCZ1B-215ENST00000626257 CUX2O14529 1486 aa39.71■■■■□ 3.95
CCZ1B-215ENST00000626257 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.64■■■■□ 3.94
CCZ1B-215ENST00000626257 IGF1RP08069 1367 aa39.64■■■■□ 3.94
CCZ1B-215ENST00000626257 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.56■■■■□ 3.92
CCZ1B-215ENST00000626257 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.55■■■■□ 3.92
CCZ1B-215ENST00000626257 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
CCZ1B-215ENST00000626257 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.46■■■■□ 3.91
CCZ1B-215ENST00000626257 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CCZ1B-215ENST00000626257 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.36■■■■□ 3.89
CCZ1B-215ENST00000626257 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.32■■■■□ 3.89
CCZ1B-215ENST00000626257 NESP48681 1621 aa39.31■■■■□ 3.88
CCZ1B-215ENST00000626257 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
CCZ1B-215ENST00000626257 TOPBP1Q92547 1522 aa39.27■■■■□ 3.88
CCZ1B-215ENST00000626257 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
CCZ1B-215ENST00000626257 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.24■■■■□ 3.87
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.23■■■■□ 3.87
CCZ1B-215ENST00000626257 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
CCZ1B-215ENST00000626257 MAP3K1Q13233 1512 aa39.11■■■■□ 3.85
CCZ1B-215ENST00000626257 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.09■■■■□ 3.85
CCZ1B-215ENST00000626257 TIAM1Q13009 1591 aa39.09■■■■□ 3.85
CCZ1B-215ENST00000626257 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
CCZ1B-215ENST00000626257 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.05■■■■□ 3.84
CCZ1B-215ENST00000626257 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
CCZ1B-215ENST00000626257 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
CCZ1B-215ENST00000626257 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.99■■■■□ 3.83
CCZ1B-215ENST00000626257 CUL7Q14999 1698 aa38.99■■■■□ 3.83
CCZ1B-215ENST00000626257 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.94■■■■□ 3.82
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