RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.75	■■■■■ 6.52
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		47.8	■■■■■ 5.24
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.11	■■■■■ 5.13
CCZ1B-215	ENST00000626257	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.02	■■■■■ 5.12
CCZ1B-215	ENST00000626257	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.03	■■■■■ 4.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	45.97	■■■■■ 4.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.87	■■■■■ 4.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		44.84	■■■■■ 4.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		44.65	■■■■■ 4.74
CCZ1B-215	ENST00000626257	SCRIB	Q14160	1630 aa		44.43	■■■■■ 4.7
CCZ1B-215	ENST00000626257	ABCC9	O60706	1549 aa		44.38	■■■■■ 4.7
CCZ1B-215	ENST00000626257	NACAD	O15069	1562 aa		44.27	■■■■■ 4.68
CCZ1B-215	ENST00000626257	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.94	■■■■■ 4.63
CCZ1B-215	ENST00000626257	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		43.66	■■■■■ 4.58
CCZ1B-215	ENST00000626257	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		43.41	■■■■■ 4.54
CCZ1B-215	ENST00000626257	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CCZ1B-215	ENST00000626257	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CCZ1B-215	ENST00000626257	WIZ	O95785	1651 aa		43.01	■■■■■ 4.48
CCZ1B-215	ENST00000626257	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		42.98	■■■■■ 4.47
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CCZ1B-215	ENST00000626257	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
CCZ1B-215	ENST00000626257	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CCZ1B-215	ENST00000626257	HRC	P23327	699 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMARCA4	P51532	1647 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.44	■■■■■ 4.38
CCZ1B-215	ENST00000626257	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CCZ1B-215	ENST00000626257	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
CCZ1B-215	ENST00000626257	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.2	■■■■■ 4.35
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMARCA2	P51531	1590 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CCZ1B-215	ENST00000626257	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	42.14	■■■■■ 4.34
CCZ1B-215	ENST00000626257	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CCZ1B-215	ENST00000626257	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.88	■■■■■ 4.29
CCZ1B-215	ENST00000626257	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.7	■■■■■ 4.27
CCZ1B-215	ENST00000626257	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		41.5	■■■■■ 4.23
CCZ1B-215	ENST00000626257	SOGA1	O94964	1423 aa		41.43	■■■■■ 4.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	41.36	■■■■■ 4.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	EEA1	Q15075	1411 aa		41.31	■■■■■ 4.2
CCZ1B-215	ENST00000626257	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.29	■■■■■ 4.2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.22	■■■■■ 4.19
CCZ1B-215	ENST00000626257	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	41.17	■■■■■ 4.18
CCZ1B-215	ENST00000626257	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.13	■■■■■ 4.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.11	■■■■■ 4.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.1	■■■■■ 4.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.95	■■■■■ 4.15
CCZ1B-215	ENST00000626257	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
CCZ1B-215	ENST00000626257	HMGXB3	Q12766	1538 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CCZ1B-215	ENST00000626257	NCAPD3	P42695	1498 aa		40.87	■■■■■ 4.13
CCZ1B-215	ENST00000626257	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		40.77	■■■■■ 4.12
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIF21B	O75037	1637 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CCZ1B-215	ENST00000626257	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CCZ1B-215	ENST00000626257	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
CCZ1B-215	ENST00000626257	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CCZ1B-215	ENST00000626257	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CCZ1B-215	ENST00000626257	CLIP1	P30622	1438 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
CCZ1B-215	ENST00000626257	CFTR	P13569	1480 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CCZ1B-215	ENST00000626257	CUX1	P39880	1505 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CCZ1B-215	ENST00000626257	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CCZ1B-215	ENST00000626257	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	PRDM2	Q13029	1718 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.06	■■■■■ 4
CCZ1B-215	ENST00000626257	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
CCZ1B-215	ENST00000626257	APLP2	Q06481	763 aa		39.96	■■■■□ 3.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.84	■■■■□ 3.97
CCZ1B-215	ENST00000626257	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	39.76	■■■■□ 3.96
CCZ1B-215	ENST00000626257	CUX2	O14529	1486 aa		39.71	■■■■□ 3.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		39.64	■■■■□ 3.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	IGF1R	P08069	1367 aa		39.64	■■■■□ 3.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		39.56	■■■■□ 3.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		39.55	■■■■□ 3.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	39.49	■■■■□ 3.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.46	■■■■□ 3.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	39.4	■■■■□ 3.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		39.36	■■■■□ 3.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		39.32	■■■■□ 3.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	NES	P48681	1621 aa		39.31	■■■■□ 3.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	39.27	■■■■□ 3.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	TOPBP1	Q92547	1522 aa		39.27	■■■■□ 3.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	39.26	■■■■□ 3.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		39.24	■■■■□ 3.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.23	■■■■□ 3.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	39.23	■■■■□ 3.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	MAP3K1	Q13233	1512 aa		39.11	■■■■□ 3.85
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		39.09	■■■■□ 3.85
CCZ1B-215	ENST00000626257	TIAM1	Q13009	1591 aa		39.09	■■■■□ 3.85
CCZ1B-215	ENST00000626257	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	39.06	■■■■□ 3.84
CCZ1B-215	ENST00000626257	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		39.05	■■■■□ 3.84
CCZ1B-215	ENST00000626257	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	39	■■■■□ 3.83
CCZ1B-215	ENST00000626257	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	38.99	■■■■□ 3.83
CCZ1B-215	ENST00000626257	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		38.99	■■■■□ 3.83
CCZ1B-215	ENST00000626257	CUL7	Q14999	1698 aa		38.99	■■■■□ 3.83
CCZ1B-215	ENST00000626257	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		38.94	■■■■□ 3.82

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