RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374517.5

TXN-202, Transcript of thioredoxin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TXN, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXN-202ENST00000374517 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.21■■■■■ 8.51
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TXN-202ENST00000374517 ABCC9O60706 1549 aa60.31■■■■■ 7.24
TXN-202ENST00000374517 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.63■■■■■ 6.82
TXN-202ENST00000374517 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.42■■■■■ 6.78
TXN-202ENST00000374517 NACADO15069 1562 aa57.39■■■■■ 6.78
TXN-202ENST00000374517 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.78■■■■■ 6.68
TXN-202ENST00000374517 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.67■■■■■ 6.66
TXN-202ENST00000374517 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.33■■■■■ 6.61
TXN-202ENST00000374517 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.31■■■■■ 6.6
TXN-202ENST00000374517 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.29■■■■■ 6.6
TXN-202ENST00000374517 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.94■■■■■ 6.55
TXN-202ENST00000374517 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.92■■■■■ 6.54
TXN-202ENST00000374517 SCRIBQ14160 1630 aa55.61■■■■■ 6.49
TXN-202ENST00000374517 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.18■■■■■ 6.42
TXN-202ENST00000374517 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.51■■■■■ 6.32
TXN-202ENST00000374517 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.45■■■■■ 6.31
TXN-202ENST00000374517 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.22■■■■■ 6.27
TXN-202ENST00000374517 SMARCA4P51532 1647 aa53.06■■■■■ 6.09
TXN-202ENST00000374517 NCAPD3P42695 1498 aa52.97■■■■■ 6.07
TXN-202ENST00000374517 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.94■■■■■ 6.07
TXN-202ENST00000374517 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.89■■■■■ 6.06
TXN-202ENST00000374517 SMARCA2P51531 1590 aa52.83■■■■■ 6.05
TXN-202ENST00000374517 HMGXB3Q12766 1538 aa52.65■■■■■ 6.02
TXN-202ENST00000374517 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.6■■■■■ 6.01
TXN-202ENST00000374517 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.5■■■■■ 5.99
TXN-202ENST00000374517 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.48■■■■■ 5.99
TXN-202ENST00000374517 ERCC6Q03468 1493 aa52.02■■■■■ 5.92
TXN-202ENST00000374517 WIZO95785 1651 aa52■■■■■ 5.91
TXN-202ENST00000374517 NESP48681 1621 aa52■■■■■ 5.91
TXN-202ENST00000374517 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.77■■■■■ 5.88
TXN-202ENST00000374517 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.67■■■■■ 5.86
TXN-202ENST00000374517 CUX2O14529 1486 aa51.61■■■■■ 5.85
TXN-202ENST00000374517 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.44■■■■■ 5.82
TXN-202ENST00000374517 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.39■■■■■ 5.82
TXN-202ENST00000374517 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.37■■■■■ 5.81
TXN-202ENST00000374517 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.3■■■■■ 5.8
TXN-202ENST00000374517 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.26■■■■■ 5.8
TXN-202ENST00000374517 CFTRP13569 1480 aa50.97■■■■■ 5.75
TXN-202ENST00000374517 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.9■■■■■ 5.74
TXN-202ENST00000374517 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.87■■■■■ 5.73
TXN-202ENST00000374517 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.85■■■■■ 5.73
TXN-202ENST00000374517 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.82■■■■■ 5.73
TXN-202ENST00000374517 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.81■■■■■ 5.72
TXN-202ENST00000374517 WDR62O43379 1518 aa50.72■■■■■ 5.71
TXN-202ENST00000374517 PRDM2Q13029 1718 aa50.48■■■■■ 5.67
TXN-202ENST00000374517 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.41■■■■■ 5.66
TXN-202ENST00000374517 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.11■■■■■ 5.61
TXN-202ENST00000374517 TOPBP1Q92547 1522 aa49.97■■■■■ 5.59
TXN-202ENST00000374517 ABCC8Q09428 1581 aa49.87■■■■■ 5.57
TXN-202ENST00000374517 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.84■■■■■ 5.57
TXN-202ENST00000374517 IFT140Q96RY7 1462 aa49.8■■■■■ 5.56
TXN-202ENST00000374517 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.69■■■■■ 5.54
TXN-202ENST00000374517 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.51■■■■■ 5.52
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TXN-202ENST00000374517 OSCARQ8IYS5 282 aa49.43■■■■■ 5.5
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TXN-202ENST00000374517 CUX1P39880 1505 aa49.39■■■■■ 5.5
TXN-202ENST00000374517 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.35■■■■■ 5.49
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TXN-202ENST00000374517 SOGA1O94964 1423 aa49.32■■■■■ 5.49
TXN-202ENST00000374517 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.31■■■■■ 5.48
TXN-202ENST00000374517 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
TXN-202ENST00000374517 TRIM41Q8WV44 630 aa48.98■■■■■ 5.43
TXN-202ENST00000374517 WDR97A6NE52 1622 aa48.94■■■■■ 5.43
TXN-202ENST00000374517 FBLN2P98095 1184 aa48.94■■■■■ 5.43
TXN-202ENST00000374517 CHD1O14646 1710 aa48.92■■■■■ 5.42
TXN-202ENST00000374517 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.85■■■■■ 5.41
TXN-202ENST00000374517 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.83■■■■■ 5.41
TXN-202ENST00000374517 GRIN2BQ13224 1484 aa48.8■■■■■ 5.4
TXN-202ENST00000374517 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.77■■■■■ 5.4
TXN-202ENST00000374517 SYNJ1O43426 1573 aa48.75■■■■■ 5.39
TXN-202ENST00000374517 TOP2BQ02880 1626 aa48.75■■■■■ 5.39
TXN-202ENST00000374517 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.73■■■■■ 5.39
TXN-202ENST00000374517 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.72■■■■■ 5.39
TXN-202ENST00000374517 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.71■■■■■ 5.39
TXN-202ENST00000374517 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.69■■■■■ 5.38
TXN-202ENST00000374517 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.69■■■■■ 5.38
TXN-202ENST00000374517 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.69■■■■■ 5.38
TXN-202ENST00000374517 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.65■■■■■ 5.38
TXN-202ENST00000374517 PBRM1Q86U86 1689 aa48.63■■■■■ 5.37
TXN-202ENST00000374517 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.61■■■■■ 5.37
TXN-202ENST00000374517 ARHGEF11O15085 1522 aa48.61■■■■■ 5.37
TXN-202ENST00000374517 SYNJ2O15056 1496 aa48.55■■■■■ 5.36
TXN-202ENST00000374517 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.35■■■■■ 5.33
TXN-202ENST00000374517 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.27■■■■■ 5.32
TXN-202ENST00000374517 ADAMTS12P58397 1594 aa48.22■■■■■ 5.31
TXN-202ENST00000374517 ARAP1Q96P48 1450 aa48.19■■■■■ 5.31
TXN-202ENST00000374517 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.16■■■■■ 5.3
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TXN-202ENST00000374517 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.13■■■■■ 5.3
TXN-202ENST00000374517 NUP160Q12769 1436 aa47.96■■■■■ 5.27
TXN-202ENST00000374517 CEP170Q5SW79 1584 aa47.96■■■■■ 5.27
TXN-202ENST00000374517 KIF27Q86VH2 1401 aa47.85■■■■■ 5.25
TXN-202ENST00000374517 IGF1RP08069 1367 aa47.75■■■■■ 5.23
TXN-202ENST00000374517 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.71■■■■■ 5.23
TXN-202ENST00000374517 SHROOM2Q13796 1616 aa47.63■■■■■ 5.22
TXN-202ENST00000374517 CUL7Q14999 1698 aa47.59■■■■■ 5.21
TXN-202ENST00000374517 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
TXN-202ENST00000374517 JPH4Q96JJ6 628 aa47.52■■■■■ 5.2
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